数据集概述
本数据集包含法劳按蚊复合体中四类主要昆虫化学感应基因家族的编码序列核苷酸比对数据，以及全基因组SNP数据，关联于研究宿主偏好差异与嗅觉基因关系的手稿，还提供计算kA/kS的R代码。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下：
- 核心数据文件：
- AllAnopheles_Tree_Filtered_thin1K.recode.vcf：VCF格式文件，全基因组SNP数据，用于构建核系统发育树
- 嗅觉基因比对文件（按基因家族分类）：
- GRs目录：包含多个.fas格式文件，如gr17_prankb.fas、gr22_prankb.fas等，为味觉受体（GRs）基因的核苷酸比对序列
- IRs目录：包含多个.fas格式文件，如ir100h_prankb.fas、ir137_prankb.fas等，为离子型受体（IRs）基因的核苷酸比对序列
- OBPs目录：包含多个.fas和.fasta格式文件，如obp15_prankb.fasta、obp25_prankb.fas等，为气味结合蛋白（OBPs）基因的核苷酸比对序列
- ORs目录：包含多个.fasta格式文件，如or10_prankb.fasta、or26_prankb.fasta等，为嗅觉受体（ORs）基因的核苷酸比对序列
- 分析代码文件：
- kaks_code Olf genes.R：R语言格式文件，用于在seqinr包中计算kA/kS的代码
适用场景
- 昆虫分子生物学研究：分析按蚊嗅觉基因家族的序列特征与进化模式
- 媒介生物学研究：探究按蚊宿主偏好差异与嗅觉基因的关联机制
- 进化遗传学分析：利用SNP数据构建按蚊复合体的核系统发育树
- 生物信息学应用：复现或扩展嗅觉基因kA/kS计算的分析流程
