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牛粪便_土壤及施肥土壤样本的111个宏基因组组装基因组数据集
数据集概述 本数据集包含111个宏基因组组装基因组(MAGs)的序列及相关信息,样本来源为抗生素预防下奶牛新鲜粪便、两个有机农场牧场土壤及施肥土壤构建的微宇宙。数据支持微生物组分类、功能及生态关联研究。 文件详解 文件名称: MAGs_FASTA_files.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容: 包含所有宏基因组组装基因组的FASTA序列文件...
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真菌NUDIX酶多样性分析数据集
数据集概述 本数据集涵盖真菌NUDIX酶多样性分析的原始数据,包含补充文件(如真菌组装列表、蛋白ID、基序保守性等)和多个文件夹(分子对接结果、结构文件、序列比对、系统发育树),为研究真菌NUDIX酶的多样性与功能提供支持。 文件详解 补充文件: Supplementary_File_S1.xlsx:...
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STEC感染临床结局预测补充数据集
数据集概述 本数据集为STEC感染临床结局预测相关研究的补充数据,包含测试集分离株结局预测、特征注释、SHAP值、模型超参数调优等多类文件,为分析STEC感染临床结局预测模型提供支持。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件,内部包含多个补充数据集,具体说明如下: - 文件名称: STEC_ML_Supplementary_dataset.zip -...
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东南亚淡水鱼类多基因遗传数据及古流域连通性分析数据集
数据集概述 本数据集包含东南亚三个生物多样性热点地区淡水鱼类的多基因分子遗传数据及相关分析文件,旨在研究第四纪气候变化及古流域重组对水生动物多样性的影响,为区域生物多样性保护提供数据支持。 文件详解 该数据集由多种格式的文件组成,具体说明如下: - 遗传序列文件: -...
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马丁_穆勒博士论文补充材料_气液界面培养的分化支气管上皮细胞中尼帕病毒的表征及雪松病毒反向遗传学
数据集概述 本数据集为马丁·穆勒博士论文的补充材料,核心内容围绕气液界面培养的分化支气管上皮细胞中尼帕病毒的表征,以及雪松病毒反向遗传学研究展开,包含实验相关的序列、统计数据、图像等多种类型文件。 文件详解 说明文件: 00_description.txt:TXT格式,包含文件清单及简要描述,如siRNA序列文件的用途说明 Supplement...
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NSDV_GP38免疫原性与弗林蛋白酶作用补充数据集
数据集概述 本数据集为NSDV GP38免疫原性及弗林蛋白酶在其蛋白水解加工中作用的研究补充数据,包含感染绵羊的抗体检测、序列比对、信号强度定量等实验结果,支持相关学术发表。 文件详解 该数据集包含9个文件,具体说明如下: - CSV数据文件(6个): -...
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小麦瘟病菌大流行种群基因分型多重扩增子测序数据集
数据集概述 该数据集包含186株稻瘟病菌(同物异名:Pyricularia oryzae)的基因分型数据,样本覆盖孟加拉国(2016-2020年,75株)和赞比亚(2018-2020年,13株)的小麦瘟病流行菌株。数据基于多重扩增子测序技术,选取84个单核苷酸多态性位点,用于区分2016年东南亚出现的小麦瘟病菌克隆谱系与其他基因型。 文件详解...
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凤蝶科全基因组鸟枪法系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集包含凤蝶科(Papilionidae)蝴蝶的全基因组鸟枪法测序数据及系统发育分析结果,涵盖45种凤蝶科物种和16种外群物种的6621个直系同源蛋白编码基因序列,用于解析其进化关系与分化时间。 文件详解 附录文档(PDF格式): Appendix S12 - Phylogenomic tree with cross-...
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数据16S核糖体RNA基因口腔序列数据集
数据集概述 本数据集包含人类口腔细菌和古菌完整基因组中的16S rRNA基因数量及其变体信息,涵盖3192个口腔细菌和191个口腔古菌的完整基因组,可通过提供的Python脚本按分类学筛选序列并计算分类群的基因数平均值。 文件详解 序列数据文件: bacteria_genes.fasta、archaea_genes.fasta:...
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油杉寄生属_Arceuthobium_质体基因组与核系统发育数据集
数据集概述 本数据集包含油杉寄生属(Arceuthobium)的质体基因组与核系统发育研究数据,涉及基因组测序组装结果、系统发育树文件、凭证标本信息表及分析方案文档,为该属系统发育关系、分类学及质体基因组演化研究提供支持。 文件详解 基因组序列文件(FASTA格式):...
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硬松类系统基因组学研究数据集
数据集概述 本数据集基于硬松类(Pinus subsection Ponderosae)的系统基因组学研究,包含130个个体的样本数据,涉及703个低拷贝核基因序列和近完整质体基因组序列,用于构建系统发育树与物种树,分析核质一致性与网状进化关系。 文件详解 说明文档与结果文件:...
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Progenio病原菌比较蛋白质基因组学分析补充数据集
数据集概述 该数据集为病原菌比较蛋白质基因组学分析的补充数据,围绕两种毒力差异的北京家族结核分枝杆菌菌株展开,支持Progenio分析流程的验证与应用,包含表格、序列、图像等多类型文件。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 表格文件(.xlsx,15个): -...
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污染细菌菌株动态调节乙醇生物精炼厂产量分析数据集
数据集概述 本数据集包含支撑研究“污染细菌菌株动态调节乙醇生物精炼厂产量”的分析数据,涵盖实验结果图表、序列文件及文档资料,以RData、PDF、FASTA等格式存储,为相关研究提供数据支持。 文件详解 图表数据文件(.RData格式):...
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ALK2_ACVR1与M4K2117共结晶结构数据集_PDB_6SRH
数据集概述 该数据集包含ALK2(ACVR1)与化合物M4K2117共结晶的结构数据,已在PDB数据库以代码6SRH存档。数据涵盖结晶结构相关的多种文件类型,为研究该蛋白与化合物的相互作用提供支持。 文件详解 结构与序列文件: M4K2117_refine_12.cif:CIF格式,可能包含经精修的晶体结构信息...
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Trichodesmium蛋白质鉴定宏基因组数据集2025
数据集概述 本数据集是Anderson等人2025年研究的补充数据,包含Trichodesmium宏基因组序列、KEGG注释、补充表格及图表,用于分析海洋不同区域资源可用性对该生物蛋白质丰度模式的影响,支持蛋白质组学相关研究。 文件详解 宏基因组与注释文件:...
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地衣共生体相互作用与光生物多样性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕地衣共生体相互作用展开,分析了2356条藻类ITS序列,涉及梅衣科等真菌属及培养的小球藻菌株,探究真菌对藻类的特异性与选择性,以及生态地理分布对共生关系的影响,包含序列比对、系统发育分析及补充数据。 文件详解 序列比对与系统发育文件(.nex格式):...
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甲壳动物肢体发育与再生基因表达动态补充数据集
数据集概述 本数据集为《甲壳动物肢体发育与再生过程中的基因表达动态》研究论文的补充数据,包含基因表达量、聚类分析结果、序列注释等多类型文件,支持论文结论的验证与扩展分析。 文件详解 数据文件(CSV格式,共26个):...
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典型SNARE蛋白额外数据集
数据集概述 该数据集包含典型SNARE蛋白相关的额外研究数据,涵盖系统发育树、序列比对、生物化学实验结果(如圆二色谱、尺寸排阻色谱数据)及蛋白质电泳凝胶图像等,为相关研究提供补充数据支持。 文件详解 文档说明文件:...
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Enterobacter_roggenkampii_B1_01基因组特征数据集
数据集概述 本数据集为MRA文章《Enterobacter roggenkampii菌株B1-01的基因组草图序列》的支撑信息,B1-01是从竹根分离的潜在促生细菌,包含其基因组特征相关的7个文件,支持细菌功能与分类研究。 文件详解 文件名称:Isolation medium for Enterobacter...
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新型捕食性全动物类系统发育与双组分信号系统祖先数据集
数据集概述 本数据集包含三种新型捕食性单细胞全动物类(Pigoraptor vietnamica、Pigoraptor chileana、Syssomonas multiformis)的形态学与转录组测序数据,涉及系统发育分析、基因功能研究及双组分信号系统演化等内容,为动物起源相关研究提供支持。 文件详解 系统发育分析文件:...



