数据集概述
本数据集为《甲壳动物肢体发育与再生过程中的基因表达动态》研究论文的补充数据，包含基因表达量、聚类分析结果、序列注释等多类型文件，支持论文结论的验证与扩展分析。
文件详解
- 数据文件（CSV格式，共26个）：
- 聚类分析类：Dataset_S25_jags_mfuzz_E_4cl_centres_v2.csv（4个胚胎发育聚类中心数据）、Dataset_S28_jags_mfuzz_D_12cl_centre_v3.csv（12个再生过程聚类中心数据）等，含cluster（聚类编号）及各样本表达量字段
- 表达量类：Dataset_S10_20_samples_abundance_gene_tpm_...csv（20个样本基因TPM值）、Dataset_S7_122_samples_abundance_gene_est_counts_...txt（122个样本基因估计计数）等，含RNAseq_gene_ID（基因ID）及各样本表达量字段
- 基因列表类：Dataset_S16_List_20k_varEDR.txt（2万个高变异基因列表），字段为MSTRG开头的基因ID
- 注释文件（TXT/GTF格式，共4个）：
- Dataset_S1_Annotation_Reg_Embryo_500_cleanOverlap0.5_3.txt（胚胎与再生基因注释文本）
- Dataset_S1_Annotation_Reg_Embryo_500_cleanOverlap0.5_3.gtf.zip（GTF格式注释压缩包）
- 序列文件（ZIP格式）：
- Dataset_S31_ph-pacbio-sequel2-isoseq3-css99.fasta.zip（PacBio Iso-Seq测序序列压缩包）
- 分析脚本与数据（ZIP/GZ格式，共4个）：
- R_data_Sinigaglia_Embryo_reg_05042022-20220407T075816Z.zip（R语言分析数据压缩包）
- DESeq2_lresO_molt.gz（DESeq2差异分析结果压缩包）
适用场景
- 甲壳动物发育生物学研究：分析肢体发育与再生过程的基因表达模式差异
- 进化生物学研究：探究肢体再生相关基因的进化保守性
- 生物信息学方法验证：测试基因表达聚类（mfuzz）、差异分析（DESeq2）等算法的应用效果
- 再生医学基础研究：挖掘调控肢体再生的关键基因靶点
