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Parallel_Transcriptomics_Based人类突变细胞平行反向遗传筛选数据与分析代码
数据集概述 本数据集包含与论文“Parallel reverse genetic screening in mutant human cells using transcriptomics”相关的数据文件和分析代码,核心为1800余个RNA-seq样本的表达谱及注释信息,辅以生成汇总图表的R脚本,支持对人类突变细胞转录组反向遗传筛选的研究与验证。...
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Integrative_Multi_Omics_肺腺癌内质网应激预后生物标志物及细胞通讯研究数据
数据集概述 本数据集为肺腺癌相关研究的补充表格数据,核心内容是qPCR引物信息,用于支持内质网应激相关预后生物标志物及CD99介导细胞通讯的多组学整合分析,为肺腺癌分子机制研究提供实验工具参考。 文件详解 文件名称:Table S19_qPCR primers.xlsx 文件格式:XLSX...
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Endogenous_Retrovirus_Based_小鼠间皮瘤模型I型干扰素信号通路激活数据
数据集概述 本数据集支持论文《内源性逆转录病毒表达在实验性小鼠间皮瘤模型中激活I型干扰素信号通路》的结论,包含25个Excel文件,记录了实验相关的原始数据,涉及内源性逆转录病毒表达与I型干扰素信号通路激活的关联分析。 文件详解 文件名称:包含Figure 2Arev.xlsx、Figure 4Frev.xlsx、Figure...
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Platyhelminthes_Microturbellarian_扁形动物核基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集包含扁形动物核基因组进化研究相关数据,基于全自由生活扁形动物目基因组与转录组调查,通过数百个核蛋白编码基因解析扁形动物系统发育关系,支持以“微涡虫”类群为核心的进化假说,为研究自由生活与脊椎动物寄生扁形动物的相互关系及寄生起源提供数据基础。 文件详解 文件名称:trinity_assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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Supplemental_Data_Yulania_stellata涝害胁迫生理与转录组分析数据
数据集概述 本数据集为星花木兰(Yulania stellata)涝害胁迫下的生理与转录组分析补充数据,包含3个表格文件,记录了基因鉴定、差异表达基因与转录因子的关联信息,用于支持植物抗涝胁迫的分子机制研究。 文件详解 Table S1 Total identified genes.xlsx 文件格式:xlsx...
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Modelling_Based_啮齿动物神经元儿茶酚胺色素沉着模型与神经退行性缺陷研究数据_v2
数据集概述 本数据集为论文“Modelling human brain-wide pigmentation in rodents recapitulates age-related multisystem neurodegenerative...
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Helianthus_maximiliani_Based_多年生向日葵生态分化群体转录组资源数据
数据集概述 本数据集为多年生向日葵Helianthus maximiliani的转录组资源,通过454焦磷酸测序技术获取自地理分布不同、生态分化的群体,包含多个个体和组织类型的测序数据。原始读数经组装后得到16,681个独特contigs,多数可基于拟南芥基因组注释,同时识别出大量SSR和SNP位点,可用于研究其生命周期变异和适应性分化的分子机制。...
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Replication_stalling_Based_SSB激活与DNA损伤耐受因子招募研究数据
数据集概述 本数据集包含与论文《Replication stalling activates SSB for recruitment of DNA damage tolerance factors》相关的4个压缩文件夹及1个文档文件,内容涉及MATLAB格式的数据和代码,用于支持研究中DNA复制停滞激活SSB及招募DNA损伤耐受因子的相关分析。...
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PhysiolGenomics_Source_肥胖与2型糖尿病骨骼肌早期基因响应失调研究补充数据
数据集概述 本数据集为研究“肥胖与2型糖尿病患者骨骼肌对混合餐的早期基因响应失调”的补充表格集合,包含5个Excel文件,对应研究中的补充表格S1至S5,为该代谢疾病相关基因表达研究提供结构化的辅助数据支持。 文件详解 补充表格文件集合 文件名称:Supplementary Tables S1.xlsx、Supplementary Tables...
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Physiol_Reports_Based_Lavin团队生理学研究基因表达补充表格数据2019
数据集概述 本数据集是Lavin等人2019年7月向《Physiological Reports》投稿的补充表格集合,包含11个表格文件。内容涵盖不同分组(PD与OA、PD与非PD、PD与YA)的基因表达差异分析结果,以及基于骨骼肌活检生成的WGCNA模块特征、模块成员和模块中枢基因信息,为生理学研究提供基因表达层面的补充数据支持。 文件详解...
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Medicago_truncatula_Based_结瘤因子与生长素协同调控转录组数据_补充表格
数据集概述 本数据集为蒺藜苜蓿结瘤因子(NFs)与生长素互作机制研究的补充表格,包含全基因组转录组分析结果。研究通过NF和/或生长素处理,揭示两者信号通路的重叠及协同互作,将差异表达基因分为三类互作组,涉及信号转导、代谢等功能,是解析豆科植物共生与侧根发育分子机制的关键数据。 文件详解 补充表格文件(共9个)...
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C_elegans_Based_CB755_unc_43_e755_IV线虫行为实验数据2010
数据集概述 本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)CB755品系(unc-43(e755)IV基因突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养皿中的行为特征,包含视频追踪数据及提取的行为特征,可用于研究unc-43基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。 文件详解 文件名称:unc-43...
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MT2247_egl_44_n1080_II_Based_秀丽隐杆线虫行为实验记录数据_2010
数据集概述 本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)egl-44(n1080)II突变体的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。实验记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为,包含视频数据及处理后的特征文件,可用于分析线虫的运动行为特征。 文件详解 文件名称:egl-44 (n1080)II on food...
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C_elegans_Based_VC8_jnk_1_gk7_IV线虫行为实验完整数据集_2011
数据集概述 本数据集为秀丽隐杆线虫VC8 jnk-1(gk7)IV品系的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基、OP50食物条件下的行为特征,包含视频追踪数据及提取的行为特征,可用于研究jnk-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。 文件详解 jnk-1 (gk1)IV on food...
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HTT_Based_Huntingtin相互作用蛋白数据库与Maiuri研究比较分析数据2018
数据集概述 本数据集来自“Huntingtin结构功能开放实验室笔记”项目,旨在对比Dr. Tamara Maiuri发现的ROS特异性Huntingtin相互作用蛋白与现有数据库记录的差异。数据集整合了前期数据库搜索结果与Maiuri公开的高/中置信度互作蛋白列表,通过单文件呈现比较分析内容,为亨廷顿相关蛋白互作研究提供参考。 文件详解...
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Data_from_Expression_profiling_多柔比星暴露心肌细胞多组学整合数据
数据集概述 本数据集为多柔比星暴露的人多能干细胞衍生心肌细胞的多组学表达谱数据,整合了蛋白质组、转录组和microRNA组数据,用于研究蒽环类药物诱导心脏毒性的分子机制,识别差异表达模式及潜在生物标志物,包含2个文件。 文件详解 README_for_Datasets.txt(TXT格式):说明样本信息,包含样本名称、时间点(如Day 0、Day...
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Bradyrhizobium_sp_DOA9_Based_绿豆抗尾孢叶斑病分子机制与生物防治数据
数据集概述 本数据集与论文“Enhancing resistance to Cercospora leaf spot in mung bean (Vigna radiata L.) through Bradyrhizobium sp. DOA9 priming: Molecular insights and biocontrol...
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基于Pdamicornis_Cgoreaui和Dmelanogaster的交响乐团功能聚类结果数据
数据集概述 本数据集是PHILHARMONIC方法在三种生物(造礁珊瑚P. damicornis、共生藻C. goreaui、果蝇D. melanogaster)中的应用结果,包含24个文件,涉及功能聚类、基因本体映射、序列信息等内容,用于揭示非模式生物的功能关系与组织架构。 文件详解 功能聚类与网络文件...
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Mutation_Analysis_Based_囊性纤维化跨膜基因5T等位基因突变实验室研究数据集
数据集概述 本数据集为论文“Mutation Analysis and Characteristics of the 5T Allele in the Cystic Fibrosis Trans Membrane...



