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Aegilops_tauschii_Based_小麦D亚基因组节节麦谱系k_mer原始计数数据
数据集概述 本数据集记录了10余个小麦基因组组装体的D亚基因组中,节节麦(Aegilops tauschii)谱系特异性k-mer在100kb片段中的计数情况,为研究小麦D亚基因组的节节麦谱系混合提供原始数据支持。 文件详解 文件名称:lineage_admixture_raw_counts.xlsx 文件格式:XLSX...
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Melanaphis_sacchari_Based甘蔗蚜染色体级别基因组组装与注释数据_科研版
数据集概述 本数据集提供甘蔗蚜(Melanaphis sacchari)的染色体级别基因组组装与注释数据,包含356.1 Mb基因组序列(其中85.5%位于3条常染色体和X染色体)、16.29%重复序列注释、12,350个蛋白编码基因(BUSCO完整性达95.8%),以及系统发育分析相关信息,为蚜虫基因组进化研究和害虫防治提供基础资源。 文件详解...
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Phytophthora_ramorum_Based_入侵森林病原体有丝分裂重组与基因组进化研究数据
数据集概述 本数据集来源于关于入侵森林病原体疫霉属(Phytophthora ramorum)的研究,聚焦其有丝分裂重组与基因组快速进化机制。研究通过107个基因组测序,分析该病原菌如何克服入侵遗传悖论,揭示非核心基因组加速进化、基因丢失及效应基因正选择等特征,为理解生物入侵适应性提供数据支持。 文件详解...
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Ithaginis_cruentus_Genome_Based_血雉基因组系统发育与高海拔适应研究数据
数据集概述 本数据集为血雉(Ithaginis cruentus)的基因组研究数据,包含其从头组装和注释的完整基因组信息。数据支持分析雉科物种系统发育关系及血雉高海拔适应的分子遗传机制,涵盖基因组大小、重复元件、SSR和蛋白编码基因等核心信息,以及正选择基因与高海拔适应的关联分析结果。 文件详解...
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Genomic_repeat_abundances_phylogenetic_signal_系统发育分析数据
数据集概述 本数据集围绕基因组重复序列丰度的系统发育信号展开,包含3个附录文件。通过比较基于图的下一代测序读长聚类方法,估计不同类别基因组重复序列的丰度,并将其作为连续变化特征推断系统发育树。数据适用于6个案例(5种被子植物、1种昆虫)的系统发育分析,支持种间及属间关系研究。 文件详解 文件名称:Online Appendix 1.docx...
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Dryad_Introgressive_hybridization_Leuciscinae鱼类基因组重排研究数据
数据集概述 本数据集围绕自然同源多倍体鱼类杂交(鲤科,雅罗鱼亚科)的渐渗杂交展开,涉及Achondrostoma oligolepis与Pseudochondrostoma duriense、Pseudochondrostoma polylepis两组杂交带,通过形态、遗传及细胞基因组标记分析杂交个体的基因组重排机制,包含5个相关文件。 文件详解...
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拟南芥TIR型NLR免疫互作研究补充数据集
数据集概述 本数据集为拟南芥TIR型NLR免疫互作研究的补充数据集,包含5个压缩文件,用于支持相关研究中关于遗传连锁NLRs在免疫反应及与片段重复区域编码NLRs互作的分析。 文件详解 文件名称:Dataset S1.zip、Dataset S2.zip、Dataset S3.zip、Dataset S4.zip、Dataset S5.zip...
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新世界鼠耳蝠线粒体与核基因组进化历史冲突数据集
数据集概述 该数据集聚焦新世界鼠耳蝠的基因组进化研究,包含37个代表性物种的完整线粒体基因组序列及3648个超保守元件(UCEs)的靶向测序数据,通过多种系统发育方法分析核基因与线粒体基因树的冲突,探索驱动鼠耳蝠独特进化历史的因素。 文件详解...
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苜蓿属基因组系统发育信号变异数据集
数据集概述 该数据集包含29种苜蓿属(豆科)植物的全基因组序列数据,通过与蒺藜苜蓿参考基因组比对,获得八万七千五百九十六个可变同源位点。用于解析苜蓿属内系统发育关系、评估不同位点数量的系统发育信号强度,以及识别与全基因组系统发育冲突的基因组区域。 文件详解 该数据集包含12个文件,具体说明如下: - 系统发育数据文件(.phy格式,共9个): -...
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步甲核糖体DNA拷贝数变异与基因组进化研究补充材料
数据集概述 本数据集包含步甲核糖体DNA(rDNA)拷贝数变异(CNV)研究的补充材料,聚焦步甲基因组结构与进化。通过分析rDNA拷贝数变异谱,揭示其与物种边界的关联及基因组快速进化证据,为物种界定和基因组进化研究提供低成本数据支持。 文件详解 文件名称: Supplementary_Materials_Syst_Biol.pdf 文件格式: PDF...
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Parabreviscolex_niepini线粒体基因组补充材料5
数据集概述 本数据集是论文《Parabreviscolex niepini完整线粒体基因组特征分析》的补充材料5,包含1张关于该物种相对同义密码子使用(RSCU)的图片,为研究其基因组密码子偏好性提供可视化数据支持。 文件详解 文件名称: oo_227018.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容: 图片展示Parabreviscolex...
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玉米着丝粒反转录转座子反向剪接RNA调控染色质环数据集
数据集概述 本数据集围绕玉米着丝粒反转录转座子(CRM)产生的反向剪接RNA展开,记录其通过R环结合着丝粒并调控染色质环结构的相关实验数据,为研究着丝粒染色质组织机制提供支持。 文件详解 文件名称:S1_raw_images.pdf 文件格式:PDF(.pdf)...
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Astyanax_scabripinnis基因组重复DNA动力学变异与进化意义补充材料4
数据集概述 该数据集为《Astyanax scabripinnis基因组重复DNA动力学的变异与进化意义》研究的补充材料4,包含三种Astyanax aff. scabripinnis种群的中期染色体C带图像,经碘化丙啶染色并转为灰度图,用于支持相关进化遗传学分析。 文件详解 文件名称: oo_125356.jpg 文件格式: JPG (.jpg)...
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Mgnify_Based_UHGP_v1_0_Based_系统发育数据库完整数据
数据集概述 该数据集为UHGP v1.0版本的系统发育数据库,来源于Mgnify基因组数据库,包含一个压缩格式的系统发育数据文件,用于存储与系统发育相关的信息。 文件详解 文件名称: phylogenize_data.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 数据集仅包含一个压缩文件,未提供具体字段映射或内容预览信息。 数据来源...
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伞形目七种植物质体基因组结构特征比较数据集
数据集概述 该数据集为伞形目七种植物质体基因组的结构特征比较表,包含GenBank登录号、基因组总长度、单拷贝区长度、反向重复区大小、AT含量、重复序列及均聚物数量等核心结构参数,支持质体基因组结构变异研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
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马达加斯加Xenogryllus属新种线粒体基因组注释表
数据集概述 本数据集为一个HTML格式的表格文件,记录了马达加斯加新种蟋蟀Xenogryllus lemuria sp. nov.的线粒体基因组结构与注释信息,包含基因链方向、位置、长度、起始/终止密码子及基因间隔核苷酸数等核心字段,为该新物种的分子系统学研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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哺乳动物系统基因组学不完全谱系分选数据集
数据集概述 本数据集聚焦胎盘哺乳动物全基因组数据,实证检验不完全谱系分选(ILS)相关假设,分析ILS对基因系统发育冲突的影响及在物种树重建中的适用性,包含支持研究结论的补充材料与文件。 文件详解 文件名称: Scornavacca_SuppFig.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 可能包含研究相关的补充图表,用于直观展示实验结果或分析过程...
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芥菜型油菜A亚基因组与其他含A亚基因组芸薹属物种共线性及分化数据集
数据集概述 本数据集围绕芥菜型油菜(B. juncea)A亚基因组(Aj)与其他含A亚基因组芸薹属物种(白菜B. rapa、甘蓝型油菜B. napus)的结构分化展开,包含遗传连锁图谱构建、亚基因组比较分析及群体遗传分析的相关数据,为研究芸薹属A亚基因组进化提供支持。 文件详解 数据文件(.xlsx格式): Information of DArT-...
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神秘囊头类甲壳动物系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集包含针对神秘囊头类甲壳动物(Thylacocephalans)在泛甲壳动物(Pancrustacea)内系统发育亲缘关系的分析数据,涵盖带拓扑约束与无约束两种贝叶斯分析结果,支持相关进化关系研究。 文件详解 约束分析压缩包: Constrained...
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青春双歧杆菌宏基因组组装基因组数据集
数据集概述 本数据集包含为研究“青春双歧杆菌基因组进化评估揭示其对人体肠道的遗传适应”所构建的宏基因组组装基因组,为分析该菌株的进化特征与肠道适应机制提供基础数据。 文件详解 文件名称:B_adolescentis_metagenome.zip 文件格式:ZIP压缩包(.zip)...



