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PGENETICS_ReCombine_Based_Tel1_ATM缺失减数分裂重组研究数据
数据集概述 本数据集包含酿酒酵母野生型(WT)及tel1、sgs1、zip3、msh4等基因突变体(含双突变体tel1 zip3、sgs1 zip3)的高通量测序和微阵列数据,用于分析Tel1/ATM缺失对减数分裂重组的影响,包括交叉干扰降低、ZMM非依赖重组增加及DSB分布变化等现象。 文件详解...
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Otindag_Sandy_Land_Based_浑善达克沙地地下凋落物分解实验数据_研究数据
数据集概述 本数据集记录了浑善达克沙地为期一年的地下凋落物分解实验结果,通过绿茶(易分解)和红茶(难分解)模拟四种草地类型(荒漠、沙地、典型草地、温带稀树草原)的地下分解过程,结合高通量测序分析土壤微生物群落,探究生物与非生物因素对凋落物分解的影响,为干旱半干旱区养分循环研究提供支持。 文件详解 SEM.csv 文件格式:CSV...
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PrimateSkinMicrobiome_Based_灵长类皮肤微生物组多样性与进化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦灵长类皮肤微生物组的多样性与进化研究,包含人类、黑猩猩、大猩猩、恒河猴及狒狒的腋窝皮肤细菌与古菌群落数据,通过16S rRNA基因高通量测序技术获取,对比分析宿主进化及人类现代卫生习惯对皮肤微生物组成的影响,共含4份文件。 文件详解 文件名称:README_for_PrimateArmpitOTUsheet.xlsx...
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遗传学_D_13_01530R2_基于酵母减数分裂的Rad51活性下调与DNA双链断裂修复竞争研究数据
数据集概述 本数据集围绕酵母减数分裂中Rad51活性下调机制展开,通过hed1、hed1dmc1T159和dmc1T159突变株的高通量测序分析,探究Rad51与Dmc1在双链断裂(DSB)修复中的竞争关系,以及对同源重组和孢子活力的影响,包含原始数据压缩包与说明文档。 文件详解 README文档...
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Acrocephalus_schoenobaenus_Based苇莺MHC_I类基因多样性研究数据
数据集概述 本数据集包含苇莺(Acrocephalus schoenobaenus)MHC I类基因多样性研究的相关数据,涵盖基因型分析结果、DNA/RNA序列及说明文档。通过高通量测序技术,研究揭示了该物种极高的MHC基因拷贝数及不同等位基因的选择模式,为理解免疫基因进化与新功能化提供支撑,共包含6个文件。 文件详解 说明文档(README文件)...
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Environmental_metabarcodes_Based_昆虫环境元条形码分类偏倚研究数据
数据集概述 本数据集围绕昆虫环境元条形码的分类偏倚展开研究,通过计算机模拟PCR比较新设计16S标记与现有16S、COI标记的分类覆盖度和分辨率,并结合体外实验验证。数据包含模拟与实验相关的测序 reads 及参考序列,用于分析元条形码标记的分类偏倚问题,共2个文件。 文件详解 Enviro metabarcodes for insects PGM...
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Alternanthera_philoxeroides_Based入侵植物土壤真菌病原体群落研究数据
数据集概述 本数据集围绕入侵植物Alternanthera philoxeroides对土壤真菌病原体群落的影响展开,通过植物-土壤反馈实验、实验室生物测定及高通量测序分析,对比入侵植物与本地近缘种A.sessilis对土壤真菌群落的密度依赖性作用,以及对植物和叶甲的反馈效应,验证生物同质化假说在土壤微生物群落中的适用性。 文件详解...
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DNA_metabarcoding_Based_200μm孔径过滤对真核浮游生物群落分析影响研究数据
数据集概述 本数据集围绕200μm孔径过滤在真核浮游生物群落分析中的有效性展开,通过对两个亚热带水库2013年1月至10月采集的16个样本(每个样本3次重复)进行SSU rDNA高通量测序,比较有无200μm预过滤处理的真核浮游生物群落差异,为浮游生物分子生态学研究方法优化提供数据支持。 文件详解 文件名称:raw data size-...
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Spodoptera_exigua_Based_短期热胁迫下甜菜夜蛾连续世代肠道细菌群落结构变化数据
数据集概述 本数据集基于16S rRNA高通量测序技术,对短期热胁迫下连续五代甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)的23个肠道样本进行分析,包含1,795,224条序列和2,565个操作分类单元(OTUs),识别出30个门、618个属的细菌,揭示了热胁迫对其肠道细菌群落结构的影响。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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MBMG_23297_Supplementary_material_2_鱼类环境DNA引物探针序列数据
数据集概述 本数据集为论文补充材料2,包含多物种鱼类环境DNA定量监测研究中使用的引物、索引和探针序列。数据支持高通量测序技术在鱼类eDNA监测中的应用,可用于鱼类物种鉴定与定量分析,共包含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_186031.xlsx 文件格式:XLSX...
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MycoKeys_Supplementary_material_地中海海草根共生真菌物种数据_2019
数据集概述 本数据集是论文补充材料,记录地中海优势海草Posidonia oceanica的优势根共生真菌新属种Posidoniomyces atricolor的物种相关数据,通过广泛采样和高通量测序发现,为真菌分类学及海洋生态研究提供支持。 文件详解 文件名称:oo_313325.xlsx 文件格式:XLSX...
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Great_Basin_Desert_Source_斑点黄芪内生真菌群落与宿主遗传结构数据_研究数据集
数据集概述 本数据集通过高通量测序技术,分析了大盆地沙漠24个斑点黄芪(Astragalus lentiginosus)种群内及种群间的叶内生真菌群落与宿主植物遗传结构。核心内容包括内生真菌群落多样性、宿主植物遗传特征及两者关联,涉及宿主大小、种子传播共生真菌Alternaria fulva丰度等影响因素,共含6个文件。 文件详解 文档类文件...
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Anadenanthera_Seq_Length_Allele_info_Based群体微卫星基因分型数据
数据集概述 本数据集包含非模式新热带树种Anadenanthera colubrina(豆科)的SSRseq基因分型数据,记录了该树种两个生活史阶段个体在25个SSRseq位点的基因型信息,同时涵盖基于序列同一性(GS)、扩增子长度(GL)的数据集及等位基因序列信息。 文件详解 文件名称:Data_SSRseq_Anadenanthera_Seq-...
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Supplementary_material_2_Röder_Schwenk_摇蚊群落人工组成数据_2023
数据集概述 本数据集为论文“Direct PCR meets high-throughput sequencing – metabarcoding of chironomid communities without DNA...
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Sinorhizobium_meliloti_Based_蒺藜苜蓿根瘤菌对宿主防御素类肽敏感性全基因组分析数据
数据集概述 本数据集为蒺藜苜蓿根瘤菌对宿主防御素类肽敏感性的全基因组分析结果,包含转座子突变结合高通量测序(Tn-seq)获取的基因信息,涉及根瘤菌抗宿主肽的相关基因及通路,为研究豆科植物-根瘤菌共生机制提供数据支持。 文件详解 文件名称:all genes Tn-seq results.xlsx 文件格式:XLSX...
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调味品发酵微生物群落动态数据集
"英文标题:Condiment Fermentation Microbial Community Dynamics Dataset 数据集概述...
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阿尔卑斯地区水生蓝细菌和真核微藻参考数据库覆盖度分析数据集
数据集概述 本数据集包含2019年阿尔卑斯地区37个湖泊和22条河流的浮游生物及生物膜样本高通量测序数据,涵盖蓝细菌16S rRNA和真核微藻18S rRNA的FASTA序列及blastn比对结果,用于分析参考数据库的分类覆盖度。 文件详解 描述文档: Dataset_Description_EAW.pdf:PDF格式,数据集说明文档...
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Bt玉米与土壤空间异质性对丛枝菌根真菌影响数据集
数据集概述 本数据集围绕Bt转基因玉米与非Bt玉米对丛枝菌根真菌(AMF)群落及植物生长的影响展开,重点对比土壤空间异质性与Bt基因修饰的作用差异。包含植物生长指标、AMF定殖率及群落组成数据,通过454焦磷酸测序分析根内AMF多样性,揭示田间空间异质性对AMF群落结构的主导影响。 文件详解 图表与图像文件: Figure S1 Plot...
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多物种鱼类环境DNA定量监测补充材料9
数据集概述 该数据集为Ushio M等人2018年发表的多物种鱼类环境DNA定量监测研究的补充材料9。内容包含总鱼类环境DNA、日本鳀鱼和日本竹䇲鱼的Bland-Altman图,用于展示不同检测方法的一致性分析,为环境DNA定量监测的准确性提供图形支持。 文件详解 文件名称: oo_186037.pdf 文件格式: PDF(.pdf) 内容:...
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基于PRIMAD模型和BioCompute_Object的高通量测序案例研究RO_Crate数据集
数据集概述 该数据集是基于PRIMAD模型和BioCompute Object(BCO)的高通量测序案例研究RO-Crate,包含研究方法、数据文件及可视化图表等结构化内容,用于评估BCO框架的可重复性,为生物信息学分析的可靠性研究提供支持。 文件详解 ro-crate-metadata.json:JSON格式,RO-...



