数据集概述
本数据集包含苇莺（Acrocephalus schoenobaenus）MHC I类基因多样性研究的相关数据，涵盖基因型分析结果、DNA/RNA序列及说明文档。通过高通量测序技术，研究揭示了该物种极高的MHC基因拷贝数及不同等位基因的选择模式，为理解免疫基因进化与新功能化提供支撑，共包含6个文件。
文件详解
- 说明文档（README文件）
- 文件名称：README_for_4inds_gDNA_cDNA.docx、README_for_long_reads_cDNA_sequences.docx、README_for_sedge_warbler_genotyping_results.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：分别对应4个个体的基因组DNA/互补DNA数据、长读长互补DNA序列、苇莺基因分型结果的说明文档，解释数据背景、实验方法及结果说明。
- 序列文件（FAS文件）
- 文件名称：long_reads_cDNA_sequences.fas、4inds_gDNA_cDNA.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：包含苇莺长读长互补DNA序列及4个个体的基因组DNA/互补DNA序列数据。
- 基因分型结果文件（XLSX文件）
- 文件名称：sedge_warbler_genotyping_results.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录苇莺MHC I类基因分型结果数据。
数据来源
论文“Extreme MHC class I diversity in the sedge warbler (Acrocephalus schoenobaenus); selection patterns and allelic divergence suggest that different genes have different functions”
适用场景
- 免疫基因进化研究: 分析苇莺MHC I类基因的高拷贝数特征及不同等位基因的选择模式，探讨基因新功能化机制。
- 生物多样性研究: 基于MHC基因多样性数据，研究苇莺种群的遗传多样性与适应性进化。
- 疾病抗性与 fitness 关联分析: 结合不同功能的MHC等位基因数据，研究其与疾病抗性及个体适合度的关系。
- 高通量测序技术应用: 探索高通量测序在高拷贝数免疫基因分型中的应用方法与有效性。
