数据集概述
本数据集通过高通量测序技术，分析了大盆地沙漠24个斑点黄芪（Astragalus lentiginosus）种群内及种群间的叶内生真菌群落与宿主植物遗传结构。核心内容包括内生真菌群落多样性、宿主植物遗传特征及两者关联，涉及宿主大小、种子传播共生真菌Alternaria fulva丰度等影响因素，共含6个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README_for_populationLevelData.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：提供种群水平数据的说明文档，包含样本信息、数据结构等背景内容
- 数据类文件（CSV格式）
- 文件名称：Labellingkey.csv
- 字段映射介绍：包含well、sample、lane字段，记录样本标识与测序 lane 对应关系，样本命名规则为“种群标识符_个体标识符”（如p1_a1）
- 文件名称：TaxonomicHypotheses.csv
- 字段映射介绍：包含Otu、Phylum_Unite、PhylumConfidenceUnite、Class_Unite、ClassConfidenceUnite、Phylum_warcup、PhylumConfidenceWarcup、Class_warcup、ClassConfidenceWarcup等字段，记录OTU的分类学注释及置信度
- 文件名称：populationLevelData.csv
- 字段映射介绍：种群水平的核心数据文件，包含宿主植物及内生真菌群落的种群尺度信息
- 文件名称：asleOtuTable_sintax.csv
- 字段映射介绍：斑点黄芪内生真菌的OTU表，记录各样本中OTU的丰度信息
- 序列类文件
- 文件名称：FungalOTUs.fa
- 文件格式：FA
- 字段映射介绍：真菌OTU的核酸序列文件
数据来源
论文“A heritable symbiont and host-associated factors shape fungal endophyte communities across spatial scales”
适用场景
- 微生物群落组装机制研究: 分析宿主植物特征（如大小、遗传结构）及共生真菌对内生真菌群落组成的影响
- 植物-微生物共生关系分析: 探究种子传播共生真菌Alternaria fulva与宿主植物及其他内生真菌的互作模式
- 种群遗传学研究: 结合宿主植物遗传结构数据，分析种群间遗传差异与内生真菌群落的关联
- 生物地理学分析: 研究大盆地沙漠不同空间尺度下内生真菌群落的分布规律及驱动因素
- 微生物多样性评估: 利用OTU表和分类学注释数据，评估斑点黄芪内生真菌的物种丰富度与群落组成
