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Hyptidinae亚科核基因与插入缺失编码DNA矩阵数据集
数据集概述 本数据集为唇形科Hyptidinae亚科的系统发育研究提供基因序列数据,包含核基因(nrITS、nrETS、waxy)和质体标记(trnL-F等)的测序结果,支持该亚科属级分类修订及系统发育关系分析。 文件详解 文件名称:Readme.txt,文件格式:TXT...
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Holozoa远缘分支p53家族同源物表征补充材料
数据集概述 本数据集为《Holozoa远缘分支p53家族同源物表征》文章的补充材料,包含13个文件,涉及p53家族同源物的结构预测、序列比对、进化分析等结果,支持研究p53家族的古老起源。 文件详解 PDF文件(10个): 如Supplementary material 08 p-values of all domain hits in non-...
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被子植物系统发育化石花整合数据集
数据集概述 该数据集围绕被子植物系统发育研究,整合化石花的分子与形态学证据,包含24个化石花的系统发育位置分析数据,涵盖1201种现存被子植物的30个花部性状及分子骨架数据,支持多种系统发育分析方法验证。 文件详解 文献与说明文件:...
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新热带区木材降解甲虫帕萨利尼族系统发育数据集
数据集概述 本数据集包含基于分子和形态学数据的新热带区木材降解甲虫(鞘翅目:黑蜣科)帕萨利尼族系统发育分析相关文件,涵盖分析输入矩阵、配置文件、日志及输出结果,为该类群的系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含二十两个系统发育分析相关文件,具体说明如下: - 输入与配置文件: -...
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伪熊蜂基因树估计误差与超保守元件实证研究数据集
数据集概述 本数据集围绕伪熊蜂属(Pseudapis)的基因树估计误差展开实证研究,对比PhyloBayes、MrBayes、IQ-Tree和RAxML四种方法在超保守元件(>800个)分析中的表现,评估其对物种树构建的影响,为基因树估计提供实践指导。 文件详解 文件名称: readme.txt,格式: TXT,内容:...
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鬣蜥类蜥蜴超保守元件与形态学数据联合证据分析数据集
数据集概述 本数据集围绕鬣蜥类蜥蜴的系统发育研究,整合超保守元件(UCE)基因组数据与形态学数据进行联合证据分析。包含多种加权条件下的最大似然法、贝叶斯分析结果及相关图表,探讨不同数据权重对系统发育树的影响,为基因组与形态学数据整合分析提供实证参考。 文件详解 文档与说明文件:...
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千足虫属Nannaria_Chamberlin_1918小物种组修订研究中的表1数据集
数据集概述 本数据集包含一篇关于千足虫属Nannaria小物种组修订研究中的表1内容,记录了MrBayes系统发育分析中使用的分子数据分区信息,包括基因区域、最佳拟合模型及简约信息特征数。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容: 包含表1数据,字段映射如下: Partition: 分区编号 Gene...
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红藻Ceramieae族系统发育分析附录4数据集
数据集概述 本数据集为红藻Ceramieae族系统发育分析研究的附录4内容,记录了不同分区数据集的选定进化模型、最佳得分及树长,基于BIC准则通过Modelfinder(IQtree)和MrBayes 3.2贝叶斯推断得出,支持系统发育分析的方法学细节。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML(.html) 内容说明:...
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贝叶斯分支长度推断的复合狄利克雷先验稳健性数据集
数据集概述 本数据集包含修改MrBayes 3.1.2程序以纳入复合狄利克雷先验的相关文件,用于解决贝叶斯系统发育推断中分支长度高估问题,并重新分析六个有问题的数据集,验证新先验的稳健性。 文件详解 文件名称: patchMB3.zip:压缩包格式,可能包含修改后的MrBayes程序补丁文件或相关代码文件 文件名称:...
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神秘囊头类甲壳动物系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集包含针对神秘囊头类甲壳动物(Thylacocephalans)在泛甲壳动物(Pancrustacea)内系统发育亲缘关系的分析数据,涵盖带拓扑约束与无约束两种贝叶斯分析结果,支持相关进化关系研究。 文件详解 约束分析压缩包: Constrained...
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树懒系统发育宏进化趋势与历史生物地理数据集
数据集概述 该数据集基于树懒形态数据超矩阵,通过贝叶斯推断、系统发育与形态钟方法分析64种树懒属的演化。核心内容包括不同支系分化时间、多样性、形态差异及生物地理历史,支持常见树懒类群分支分类,提供分子方法无法测定的主要分支分化时间估计。 文件详解 数据矩阵文件: Matrix.nex:NEX格式数据矩阵,包含树懒形态特征超矩阵数据 贝叶斯分析文件:...
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侧口类纤毛虫进化历史重建特征状态分布数据集
数据集概述 本数据集为侧口类纤毛虫进化历史重建研究中的特征状态分布表,记录了不同类群纤毛虫在30个特征上的状态数据,包含缺失值(?)和不适用值(–),用于系统发育分析。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: 包含Taxon(分类群)、Character states 1–5(特征状态1-5)、Character...
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分子钟校准方法的尖端与节点互补性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕分子钟校准方法展开,探讨节点校准与尖端校准的互补性。研究指出传统节点校准依赖化石约束,而尖端校准将化石物种作为年代节点与现存物种结合,二者结合可提升进化时间尺度的合理性、精确性与准确性。 文件详解 MrBayes_Analyses.NEX:...
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基于分子与形态学证据的唇柱苣苔重评估数据集
数据集概述 本数据集围绕中国云南特有植物唇柱苣苔(Chirita umbrophila)的分类学地位展开研究,整合了核核糖体DNA(ETS、ITS)和叶绿体DNA(rpl16、rps16、trnL-F)的分子数据,以及重新采集的形态学观察数据,通过系统发育分析明确其分类归属。 文件详解 分子数据文件(FASTA格式):...
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中生代鸟类形态钟异质性贝叶斯尖端定年数据集
数据集概述 本数据集包含中生代鸟类形态演化研究的相关文件,基于贝叶斯尖端定年方法分析早期鸟类演化速率异质性,涉及头骨、轴骨骼等六个身体部位的形态特征变化,揭示飞行能力相关身体部位的演化动态。 文件详解 文件名称: CharacterDescription.pdf;文件格式:...
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木槿族_锦葵科_系统发育关系研究比对与树文件数据集
数据集概述 本数据集包含木槿族(锦葵科)系统发育关系研究的基因比对文件与系统发育树文件,基于迄今最全面的分类群采样构建,涉及传统定义的木槿属和孔雀葵属的多系性分析,以及新属的分类修订,为该族植物分类提供关键数据支持。 文件详解 数据集包含5个文件,具体说明如下: - 文件名称:README.md - 文件格式:Markdown(.md) -...
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山楂全质体系统发育骨架贝叶斯推断分析补充材料3
数据集概述 该数据集是山楂属(Crataegus)基于全质体基因组的系统发育骨架研究的补充材料,通过贝叶斯推断分析(MrBayes)生成,为揭示山楂属系统发育关系及相关分类学研究提供支持。 文件详解 文件名称: oo_1248846.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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蚁栖性棒角隐翅虫亚科甲虫多样化及新喀里多尼亚辐射数据集
数据集概述 本数据集为相关研究论文的完整补充文件集合,包含所有分析用数据集及结果。涵盖棒角隐翅虫亚科甲虫的分类、DNA序列、形态学数据、系统发育分析结果等多类文件,支撑其多样化及新喀里多尼亚辐射的研究。 文件详解 分类与基础信息文件: S1_Classification.XLS:分类信息表格,格式XLS S2_GenBank...
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Pilbara地区Bathynellidae科甲壳动物系统发育数据集
数据集概述 本数据集为研究澳大利亚西部Pilbara地区Bathynellidae科甲壳动物的异域物种形成及古老起源提供分子系统发育分析数据。包含多个基因序列比对文件及构建的串联基因树,记录了不同基因片段的比对信息、最优模型及分析所用序列数量,支持RaxML、MrBayes和BEAST等方法的系统发育分析。 文件详解 文件名称: table.html...
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埃塞俄比亚裂谷非洲爪蟾扩散障碍研究数据集
数据集概述 本数据集围绕埃塞俄比亚裂谷对非洲爪蟾(Xenopus clivii和X. largeni)扩散的阻碍作用展开,包含分子数据及分析文件,揭示裂谷两侧种群结构、迁移情况及分化时间,为裂谷作为两栖动物扩散障碍的研究提供支持。 文件详解 文档类文件(PDF、DOCX格式):...



