数据集概述
本数据集为研究澳大利亚西部Pilbara地区Bathynellidae科甲壳动物的异域物种形成及古老起源提供分子系统发育分析数据。包含多个基因序列比对文件及构建的串联基因树,记录了不同基因片段的比对信息、最优模型及分析所用序列数量,支持RaxML、MrBayes和BEAST等方法的系统发育分析。
文件详解
- 文件名称: table.html
- 文件格式: HTML (.html)
- 字段映射介绍: 表格包含6组数据条目,每组字段为数据集描述、最优模型、分析方法、序列数量,具体条目如下:
- 18S_alignment_for concatenate tree: 18S基因序列比对,最优模型GTR+G+I,序列数68条
- Concatenate_tree: COI-16S-28S-ITS2-18S串联基因树,使用RaxML和MrBayes构建,序列数92条
- COI_8seq_for BEAST: COI基因序列比对,最优模型HKY+G,序列数8条
- 16S_10seq_for BEAST: 16S基因序列比对,最优模型TrN+G(BEAST用TN93+G),序列数10条
- 28S_10seq_for BEAST: 28S基因序列比对,最优模型TrN+G(BEAST用TN93+G),序列数10条
- 18S_10seq_for BEAST: 18S基因序列比对,最优模型TrN(BEAST用TN93),序列数10条
- Concat_COI-16S-28S-18S_ BEAST _10seq: COI-16S-28S-18S串联基因比对,使用BEAST构建,序列数10条
适用场景
- 甲壳动物分子系统发育研究:分析Bathynellidae科物种的亲缘关系及演化历史
- 异域物种形成机制研究:探究Pilbara地区地质隔离对物种分化的影响
- 古老物种起源分析:验证Bathynellidae科甲壳动物的古老起源假说
- 系统发育模型选择:比较不同基因片段在系统发育分析中的最优模型适用性