数据集概述
本数据集围绕伪熊蜂属（Pseudapis）的基因树估计误差展开实证研究，对比PhyloBayes、MrBayes、IQ-Tree和RAxML四种方法在超保守元件（>800个）分析中的表现，评估其对物种树构建的影响，为基因树估计提供实践指导。
文件详解
- 文件名称: readme.txt，格式: TXT，内容: 数据集说明文档，包含研究背景、文件结构及联系信息。
- 文件名称: species_trees.zip，格式: ZIP，内容: 物种树相关数据压缩包。
- 文件名称: alignments.zip，格式: ZIP，内容: 序列比对数据压缩包。
- 文件名称: Trinity_assemblies.zip，格式: ZIP，内容: Trinity组装结果压缩包。
- 文件名称: gene_trees.zip，格式: ZIP，内容: 基因树数据压缩包。
- 文件名称: UCE_genome_extractions.zip，格式: ZIP，内容: 超保守元件基因组提取数据压缩包。
- 文件名称: Supplementary_methods.pdf，格式: PDF，内容: 补充方法文档，包含实验设计与分析流程细节。
适用场景
- 系统发育基因组学研究: 分析不同基因树估计方法对物种树准确性的影响。
- 超保守元件应用评估: 探究超保守元件在昆虫系统发育分析中的适用性。
- 分类学修订: 基于分子系统发育结果优化伪熊蜂属的分类体系。
- 方法学比较: 对比贝叶斯与最大似然法在基因树构建中的性能差异。
- 形态特征演化分析: 结合系统发育树研究伪熊蜂形态特征的演化模式。
