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MHC_Based_野生大苇莺MHC多样性性别冲突研究数据_2018
数据集概述 本数据集来自野生大苇莺20年的MHC-I基因研究,核心探究适应性免疫关键组件MHC-I多样性的性别特异性选择。研究发现MHC-I多样性与性别存在显著交互作用:雄性多样性越高、雌性多样性越低,后代招募成功率越高,但雌雄均未达MHC-I适应度最优,揭示未解决的遗传性别冲突。 文件详解 补充数据表文件...
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Habronattus_Salticidae_Based跳蛛物种复合体渐渗杂交进化影响研究数据
数据集概述 本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体,探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件(UCEs)及形态学数据,分析基因组与形态的进化模式,揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史,包含267个文件,以基因序列数据为主。 文件详解 基因序列文件...
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Kenyan_flora_Based_肯尼亚植物区系生物多样性热点形成研究数据集
数据集概述 本数据集围绕肯尼亚植物区系生物多样性热点形成机制研究,包含被子植物系统发育树、物种分布记录、基因序列 accession 号及样本信息等核心数据,支撑分析气候波动与造山运动对肯尼亚植物区系系统发育β多样性格局的影响,识别五大植物地理分区。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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OGRDB_Source_小鼠CAST_EiJ品系IGKV基因库数据
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠CAST/EiJ品系IGKV基因种系参考集,包含基因序列文件、元数据文件及许可文件,共四个文件,覆盖基因序列的有间隙、无间隙版本及结构化信息,为免疫遗传学研究提供标准化基因参考数据。 文件详解 基因序列文件 文件名称:EiJ...
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数据18S_rRNA_Based_水生真菌栖息地特异性群落参考数据集
数据集概述 本数据集整合了公开的真菌18S rRNA基因序列与海洋真菌培养物新序列,补充了10类栖息地类型等验证上下文数据,包含系统发育参考树,用于分析水生真菌群落模式、栖息地对群落结构的影响及分类组成差异,为水生真菌研究提供参考。 文件详解 README_for_aquatic_fungal_communities.txt 文件格式:TXT...
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Lampropeltis_Based奶蛇物种界定系统发育比较分析数据
数据集概述 本数据集围绕奶蛇属(Lampropeltis)的物种界定及系统发育分析展开,包含3个文件,涉及物种界定结果、系统发育数据及相关附录信息,用于研究基因树冲突与未识别多样性对物种树估计及多样化分析的影响,是爬行动物系统发育与生物多样性研究的重要参考资料。 文件详解 Online Appendix 1_updated.xlsx 文件格式:XLSX...
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Oreobates_Based阿根廷西北部新种描述及系统发育研究数据
数据集概述 本数据集为阿根廷西北部胡胡伊省Oreobates属新种的分类学研究数据,包含支持新种诊断的形态特征及分子证据(遗传距离与系统发育分析),同时提供O. discoidalis和O. barituensis的分类学注释,强调需对该属物种进行全面修订。 文件详解 Oreobates_distances_16S.nex 文件格式:.nex...
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Malaspina_2010_Based海洋微生物光合酶基因预测数据
数据集概述 本数据集包含马拉斯皮纳2010全球探险中174个宏基因组的光合生物常见酶基因预测结果,涉及NADH:泛醌还原酶(H+转运)、N-乙酰-γ-谷氨酰磷酸还原酶、DNA指导的RNA聚合酶、非特异性丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶四类酶基因,共2个压缩文件。 文件详解 MPRGC.v3.51518238.seq...
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ProbioSML_Based_机器学习支撑益生菌基因序列数据库数据
数据集概述 本数据集是基于机器学习构建的益生菌序列数据库ProbioSML,包含1071个与已证实具有益生菌特性的微生物属相关的基因。数据集共4个文件,覆盖基因序列、预测结果及注释信息,为益生菌基因研究提供结构化资源。 文件详解 基因序列文件 文件名称:ProbioDB_1.0.faa、ProbioDB_1.0.ffn 文件格式:faa、ffn...
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奥弗里奥西斯_Ophryocystis_基因组组装序列及基因注释数据
数据集概述 本数据集包含两种Ophryocystis谱系的基因组组装、注释及基因序列数据,源自对君主蝴蝶寄生原虫Ophryocystis elektroscirrha的研究。数据涵盖直接测序的O. elektroscirrha谱系及从宿主基因组中生物信息学提取的类似谱系,后者完整性置信度较低且未在其他平台存档。 文件详解...
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ZooKeys_2018_Eurhoptus属修订研究基因测序补充数据
数据集概述 本数据集为论文“美洲北部墨西哥以北Eurhoptus属(象鼻虫科,隐喙象亚科)修订研究”的补充材料,包含所有测序个体及基因的完整数据与GenBank登录号,支持该属的分类学修订与分子系统学分析。 文件详解 文件名称:oo_232390.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含Table...
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OGRDB_Based_小鼠DBA_1J品系IGKV基因种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠DBA/1J品系IGKV基因种系参考集,包含基因序列文件、元数据文件及许可文件,共4个文件,为免疫基因组学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称:1J IGKV_rev_1_ungapped.fasta 文件格式:FASTA...
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Sage_grouse_Based_艾草松鸡遗传分化与物种识别研究数据
数据集概述 本数据集通过基因组单核苷酸多态性(SNPs)分析,验证了 Gunnison 艾草松鸡与大艾草松鸡的遗传分化,以及 Bi-State 种群的独特性。数据包含遗传标记、基因序列比对、群体遗传结构等相关文件,为艾草松鸡的分类学界定和保护单元划分提供支持,共含八个文件。 文件详解 structure_input_file.txt 文件格式:TXT...
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Impatiens_Based_墨西哥凤仙花系统发育比对与遗传距离数据
数据集概述 本数据集包含用于墨西哥凤仙花(Impatiens mexicana Rydb.)系统发育分析的基因序列比对文件及遗传距离数据,涉及ITS、atpb-rbcL、trnL-F三个基因片段及其串联矩阵,共5个文件,支持该物种的形态与系统发育研究及地理分布更新。 文件详解 串联矩阵比对文件...
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Cerapachys_biroi_Based克隆掠夺者蚂蚁基因组研究数据
数据集概述 本数据集为无 queen 克隆掠夺者蚂蚁 Cerapachys biroi 的基因组相关数据,该蚂蚁是研究昆虫社会分工分子调控的重要模型。数据集包含基因序列、进化树及基因列表等文件,支持对其繁殖方式、社会行为相关基因的分析,共5个文件。 文件详解 进化树文件(.tre) 文件名称:CYPs_573.tre、UGTs_321.tre...
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Ficus_Agaonidae_榕树传粉者共享与宿主转移物种形成研究数据
数据集概述 本数据集围绕榕树(Ficus)与传粉榕小蜂(Agaonidae)的专性传粉共生关系展开,通过分子标记分析中国南部及台湾-琉球群岛6种近缘雌雄异株榕树及其传粉者的系统发育关系与种群遗传结构,探究宿主转移导致的传粉者物种形成机制,揭示传粉者共享、协同传粉等现象,为专性传粉共生系统的物种形成与宿主特异性研究提供数据支持。 文件详解 文档类文件...
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Alticini_Host_Jumping_跳甲宿主关联与多样化研究数据
数据集概述 本数据集包含跳甲(Alticini)宿主植物关联与多样化研究的相关数据,涉及101属608种跳甲的系统发育关系重建,以及分支特异性多样化速率分析。数据通过线粒体基因组和细胞色素氧化酶I基因进行分析,探讨宿主植物关联对跳甲多样化的影响,为研究跳甲快速辐射进化的驱动因素提供基础。 文件详解 系统发育树文件...
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Prinia_gracilis_Based复合体Cytb_ND2基因数据
数据集概述 本数据集包含用于分析Prinia gracilis复合体分类地位的线粒体基因(Cytb+ND2)相关数据,支持基于形态、鸣声和分子证据的整合分类学研究,为该复合体的物种界定提供遗传信息支撑。 文件详解 文件名称:Pgracilis_CYB_ND2_Y.xml 文件格式:XML 字段映射介绍:XML格式文件,包含Prinia...
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Philodoria_Based_夏威夷潜叶蛾分子系统发育与保护研究数据
数据集概述 本数据集围绕夏威夷特有濒危潜叶蛾属Philodoria展开,包含其分子系统发育分析、分类修订及保护相关数据。涉及3个基因的序列比对与图像资料,旨在验证亚属分类有效性,为该濒危类群的保护提供进化生物学依据,共包含2个文件。 文件详解 3GENE Photos.zip 文件格式:ZIP...
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Diplomystidae_Based淡水鲶鱼系统发育分析与分子诊断数据
数据集概述 本数据集包含用于Diplomystidae科鲶鱼系统发育分析与分子诊断的11个文件,涉及智利Bueno流域新种群的起源假说验证、物种界定及分类学重新评估,支持两种新物种的描述,为南美南部淡水生物多样性演化研究提供数据支撑。 文件详解 序列数据文件(.fas格式)...



