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Anthropocene_Population_Genomics_纽约都市圈白足鼠基因组变异数据集
数据集概述 本数据集记录纽约市都市圈23个白足鼠种群的基因组变异情况,通过ddRAD-Seq技术生成超10000个SNP标记,分析城市化梯度(不透水面覆盖率、人口密度)对种群基因组多样性、分化模式的影响,含基因组数据压缩包及样本文件共4个。 文件详解 文件名称:wfm191vcf.zip 文件格式:ZIP...
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Trachycarpus_fortunei_Based_瑞士南部及意大利北部入侵群体遗传标记分析数据
数据集概述 本数据集为论文配套数据,包含入侵棕榈Trachycarpus fortunei在瑞士南部及意大利北部群体的微卫星与SNP标记分析结果,记录了208个样本的基因型数据,用于揭示该物种的随机交配模式和主动殖民过程,是研究其入侵机制的核心遗传信息资源。 文件详解 GBS分析文件 文件名称:variants.vcf.gz 文件格式:VCF.GZ...
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Lolium_perenne_Rabier_etal_2015_Based_基因组选择准确性研究数据
数据集概述 本数据集为《On the accuracy of genomic selection》研究相关数据,聚焦通过高密度标记预测选择候选育种值的基因组选择技术,包含理论准确性表达式、新代理指标及多年生黑麦草(367个个体、24,957个SNP标记)的实证分析数据,用于验证基因组选择准确性方法的有效性。 文件详解...
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Symmetrical_Onychomadesis_GWAS_Dogs_犬对称性爪脱落症基因研究数据
数据集概述 本数据集包含犬对称性爪脱落症(一种导致健康犬周期性脱爪的疾病)的全基因组关联研究数据。通过对225只戈登塞特犬的分析,在12号染色体上定位到约3.3Mb的关联区域;结合英国塞特犬的元分析显示该区域同样与该病相关。数据支持犬类该病的遗传标记筛选与育种应用。 文件详解 Dogs.map 文件格式:.map...
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Rye600K_SNP_Based_黑麦600K_SNP阵列标记_Lo7_参考基因组定位数据2017
数据集概述 本数据集包含Bauer等人2017年开发的黑麦600K SNP阵列标记在'Lo7'染色体级参考基因组上的定位数据。通过NCBI blastn工具比对600843个SNP标记序列,经严格过滤后得到精确位置信息,为黑麦基因组学研究提供基础资源。 文件详解 文件名称:Rye600K_SNP_Array_Lo7Map.xlsx 文件格式:XLSX...
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Eragrostis_tef_Based_埃塞俄比亚画眉草水分胁迫下生产力与形态生理性状基因组解析数据
数据集概述 本数据集为埃塞俄比亚画眉草(Eragrostis tef)在不同水分条件下的基因组与表型研究数据,包含297个基因型的28,837个SNP标记数据,以及2020-2021年两个生长季、两种水分处理(充足/有限)下的生产力、抗倒伏性及形态生理性状表型数据,用于解析目标性状的遗传基础。 文件详解 ReadMe for Zenodo.txt...
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Armillaria_cepistipes_SSR_SNP_Based真菌种群遗传结构比较评估原始数据
数据集概述 本数据集为评估SSR和SNP两种分子标记在推断真菌Armillaria...
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Potamopyrgus_antipodarum_Based淡水螺有性无性谱系核质基因组不一致性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦新西兰淡水螺Potamopyrgus antipodarum,通过核单核苷酸多态性(SNP)标记和线粒体基因,分析其有性与无性谱系的核质基因组不一致性,探究无性谱系起源时间、生态进化过程对繁殖方式演化的影响,包含3个相关文件。 文件详解 文件名称:README_for_SNPgen_ploidy_hapl.doc...
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白鲟_Acipenser_sturio_遗传监测单核苷酸多态性_SNP_与短串联重复序列_STR_比较数据
数据集概述 本数据集为极危物种欧洲鲟(Acipenser sturio)的遗传监测研究数据,包含通过ddRAD测序发现的79个SNP标记及其与传统STR标记的对比分析结果,涉及195尾已知谱系幼鱼和40尾野生成鱼的基因分型数据,用于评估两种标记在亲缘关系鉴定、近交系数估计等保护遗传学应用中的有效性。 文件详解 GENOYPES 40 SAMPLES...
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Supplementary_material_1_意大利阿尔卑斯棕熊非侵入性样本SNP标记亲子鉴定补充材料
数据集概述 本数据集是论文“Performance of SNP markers for parentage analysis in the Italian Alpine brown bear using non-invasive...
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数据2017年DRYAD数据库中基于生态型的兰花属植物_Epipactis_helleborine_生殖隔离研究数据
数据集概述 本数据集围绕森林与沙丘生态型的Epipactis helleborine(兰科植物)展开,通过受控杂交、种子萌发实验及遗传形态分析,验证菌根群落差异对生殖隔离的影响,包含移民种子活力、杂交种子活力、遗传标记及形态特征等核心研究数据。 文件详解 文件名称:DRYAD_Jacquemyn et al. 2017.xlsx 文件格式:XLSX...
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白额黑雁迁徙传统改变的遗传后果数据集
数据集概述 本数据集围绕白额黑雁迁徙传统改变的遗传后果展开,包含对格陵兰、斯匹次卑尔根、俄罗斯、瑞典及荷兰(后两者为新出现种群)418个个体的358个SNP标记基因分型数据,用于分析种群遗传结构、基因流及连锁不平衡等。 文件详解 统计分析文件:...
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八倍体草莓基因组结构与SNP标记数据集
数据集概述 本数据集围绕八倍体草莓(包括栽培草莓和野生种)的基因组结构、亚基因组变异及SNP标记展开,包含SNP基因分型数据、遗传图谱、探针信息及补充材料,为研究草莓染色体演化、亚基因组结构及遗传标记开发提供支持。 文件详解 基因分型数据文件: SNPcalls.850K_genotypes.txt:TXT格式,包含850K...
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德国胎儿弯曲杆菌性病亚种基因组流行病学研究补充数据集
数据集概述 本数据集是《德国胎儿弯曲杆菌性病亚种基因组流行病学研究》论文的补充数据,包含基因组测序、样本信息、系统发育树及图表等多类型文件,为理解该病原菌的分子流行病学特征提供支持。 文件详解 数据概览文件: 00_Campylobacter fetus_data_overview.csv:CSV格式,提供样本基本信息的汇总概览...
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加州红鲍转录组测序SNP发现与高分辨率熔解分析数据集
数据集概述 本数据集为加州红鲍转录组测序研究成果,包含通过cDNA焦磷酸测序鉴定的622个高质量SNP标记,及45个具基因本体功能信息的SNP标记,其中8个在个体中呈多态性,通过高分辨率熔解分析(HRMA)验证,为评估遗传多样性提供候选基因数据。 文件详解 Hr summary report.pdf:PDF格式,红鲍SNP研究的总结报告文档 Multi...
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豇豆营养生长早期干旱胁迫GWAS分析数据集
数据集概述 本数据集包含豇豆(Vigna unguiculata)迷你核心种群在营养生长早期干旱胁迫下的全基因组关联分析(GWAS)结果,涵盖表型数据(株高、蒸散量、光合效率等)及基因型关联分析文件,支持干旱胁迫响应机制研究。 文件详解 该数据集包含多种类型文件,具体说明如下: - 分析结果文件(PDF格式,占比约六十六点一%): -...
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西班牙普通菜豆多样性面板基因分型数据集
数据集概述 本数据集包含西班牙普通菜豆多样性面板中308个普通菜豆品系的基因分型数据,采用ApeKI限制性内切酶测序,经参考基因组V2.1比对及缺失值、最小等位基因频率过滤后,最终保留11,763个SNP标记。 文件详解 数据文件: 文件名称:alldata_filtered.vcf.vcf 文件格式:VCF...
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草莓PERPETUAL_FLOWERING位点与无性繁殖表型基因组预测数据集
数据集概述 本数据集围绕草莓PERPETUAL FLOWERING(PF)位点展开,包含表型与基因型数据,用于研究PF位点对匍匐茎无性繁殖表型的遗传调控作用,以及基因组预测在草莓育种中的应用,为培育无匍匐茎或低匍匐茎品种提供数据支持。 文件详解 该数据集包含九类数据文件与两类图表文件,具体说明如下: - 多样性面板数据文件: -...
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鹰嘴豆干旱耐受性及相关农艺性状全基因组关联研究数据集
数据集概述 本数据集基于全基因组关联研究(GWAS),探究鹰嘴豆干旱耐受性及相关农艺性状的遗传标记。包含185份鹰嘴豆材料在黎巴嫩两地两年间灌溉与雨养环境下的表型数据、SNP基因分型数据及关联分析结果,为鹰嘴豆抗旱育种提供遗传依据。 文件详解 表型数据文件:...
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杂交区差异渐渗与候选屏障基因数据集
数据集概述 本数据集围绕杂交区作为“基因组筛”的作用,分析控制拟声蟋蟀(G. pennsylvanicus与G. firmus)种间基因交流的候选屏障基因。通过精囊腺转录组扫描与125个SNP标记,对比精液蛋白基因与同组织非精液蛋白基因的渐渗模式,识别出可能参与生殖隔离的关键基因。 文件详解 文件名称: README_for_Figure...



