数据集概述
本数据集是《德国胎儿弯曲杆菌性病亚种基因组流行病学研究》论文的补充数据，包含基因组测序、样本信息、系统发育树及图表等多类型文件，为理解该病原菌的分子流行病学特征提供支持。
文件详解
- 数据概览文件：
- 00_Campylobacter fetus_data_overview.csv：CSV格式，提供样本基本信息的汇总概览
- 表格文件（TSV格式）：
- Table 1.tsv：包含样本的基础信息字段（如菌株ID、采集年份、国家等）
- Table 2.tsv：记录菌株的MLST分型、亚种分类、SNP标记等分子特征
- Table 3.tsv：涵盖测序数据质量指标（如总碱基数、GC含量、Q30比例等）及物种鉴定结果
- 系统发育树文件：
- phylogeny.nwk：NWK格式，存储菌株的系统发育树结构数据
- 图表文件：
- Image 1.PDF：PDF格式，可能包含研究相关的可视化图表
数据来源
Frontiers in Veterinary Science
适用场景
- 兽医微生物学研究：分析德国地区胎儿弯曲杆菌性病亚种的基因组特征
- 分子流行病学分析：探究该病原菌的传播模式和进化关系
- 测序数据分析：验证基因组测序数据的质量控制指标和物种鉴定结果
- 系统发育研究：基于系统发育树数据开展菌株亲缘关系分析
