-
系统发育基因组分析中替代异质性处理模拟研究数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育基因组学中替代异质性处理方法展开，通过模拟氨基酸序列数据对比CAT模型（CAT-F81、CAT-GTR）与数据分区策略的性能差异，分析不同模型对系统发育树推断准确性的影响，为相关研究提供数据支持。 文件详解 压缩文件: NexusFiles_PartitionFiles_ProgramCommands.zip:...
-
MicrobiologyOpen_Alexyuk_Based_微生物分类路径完整数据
数据集概述 本数据集是Alexyuk等人发表于《MicrobiologyOpen》期刊论文的补充数据，包含SAS微生物组的Kaiju分类路径数据及分类结构文档，为研究微生物分类提供支持。 文件详解 文件名称: SAS kaiju_taxonpaths.txt，文件格式: TXT 内容:...
-
LifeCLEF_FishCLEF_2015_Based_鱼类物种识别多媒体完整数据
数据集概述 该数据集为2015年FishCLEF项目发布的数据集，属于LifeCLEF 2015多媒体生物物种识别挑战的一部分，聚焦鱼类物种识别相关的多媒体数据，为生物物种识别研究提供数据支持。 文件详解 文件名称：fishclef_2015_release.zip 文件格式：ZIP压缩包（.zip） 内容说明：压缩包内包含FishCLEF...
-
MUUMI多组学数据整合R包案例研究输入输出文件数据集
数据集概述 本数据集包含论文《MUUMI: an R package for statistical and network-based meta-analysis for MUlti-omics data Integration》中两个案例研究的输入与输出文件，支持复现研究结果，涉及特发性肺纤维化转录组数据及THP-1巨噬细胞多组学数据的整合分析。...
-
洪都拉斯艰难梭菌基因组与表型特征数据集
数据集概述 本数据集为洪都拉斯艰难梭菌研究的补充数据，聚焦持续存在的RT027基因型和新兴的RT002基因型的基因组与表型特征分析，包含实验结果表格、Clostyper分析报告及原始数据文件。 文件详解 表格文件（.xlsx格式，共10个）：...
-
灵长类基因表达混合模型再分析数据集
数据集概述 本数据集是对灵长类基因表达数据的混合模型再分析结果，探究物种间基因表达差异与适应性进化的关联。数据包含12600个基因的表达变异分析，涉及人类、黑猩猩、 orangutan等物种的脑组织与肝脏组织，揭示基因表达分化的组织和物种偏倚。 文件详解 数据集包含4个文件，具体说明如下： - 图表文件（PDF格式）： -...
-
水螅水母类全球分布与完全浮游生命周期转变研究数据集
数据集概述 本数据集为相关研究文章的配套数据与代码，围绕水螅水母类完全浮游生命周期独立转变及其对全球表层海洋分布的影响展开，包含分析用输入数据、图表生成脚本及OTU分类代码等内容。 文件详解 压缩文件：Boosten-Sant-et-al-2025_codes.zip（.zip格式），包含三个子文件夹： data文件夹：存储分析过程中使用的输入数据文件...
-
哺乳动物系统发育树根位置置信度评估与非可逆模型实证研究
数据集概述 本数据集围绕哺乳动物系统发育分析展开，聚焦非可逆模型在树根位置推断中的应用，提出“rootstrap”新 Bootstrap 度量方法，旨在解决传统可逆模型无法统计支持根位置的问题，为系统发育树的根位置评估提供新工具。 文件详解 文件名称: Supplementary_material.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
-
Apiales目全质体基因组比较分析表1数据集
数据集概述 该数据集为Apiales目五个物种质体基因组组装比较的表格数据，源自《Apiales目全质体基因组比较分析》一文的表1，包含组装结果的核心指标，如非冗余contig总数、质体contig数量、大小范围及平均大小等。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
-
实验室血吸虫种群遗传变异数据与代码
数据集概述 本数据集包含用于生成研究论文图表的代码和数据，核心内容围绕实验室血吸虫种群的遗传变异特征展开，为相关研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: sm_single_gt-main.zip 文件格式: ZIP (.zip) 文件内容: 压缩包内包含用于生成论文图表的代码与数据，具体字段及内容需解压后查看 适用场景 血吸虫遗传学研究:...
-
云南蒙自新物种Amana_yunmengensis研究中使用的质体基因组序列表
数据集概述 本数据集为研究云南蒙自新物种Amana yunmengensis（百合科）提供质体基因组序列信息，包含物种名称、采集者编号、GenBank编号等数据，部分序列标注为非Li et al. 2017来源，支持新物种分类与系统发育研究。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容:...
-
Motacilla属比较线粒体基因组学与系统发育研究补充材料6
数据集概述 本数据集为Motacilla属（Aves, Passeriformes）比较线粒体基因组学与系统发育研究的补充材料6，包含一张JPG格式的图片，作为该研究的可视化辅助资料，支持对Motacilla属系统发育关系的分析与验证。 文件详解 文件名称: oo_708206.jpg 文件格式: JPG（.jpg） 文件内容:...
-
Gloydius属分子系统发育分析及青藏高原新物种描述的表3数据集
数据集概述 该数据集包含论文《中国青藏高原Gloydius属（有鳞目，蝰科，蝮亚科）分子系统发育分析及两个新高山物种描述》中的表3数据，记录了由PartitionFinder 2.1.1选择的不同基因分区及其进化模型信息。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML 字段映射： Partitions：基因分区编号...
-
新冠病毒大流行背景下深度学习与物理对接工具对比数据集
数据集概述 该数据集围绕新冠病毒大流行背景，提供深度学习与物理对接工具的相关数据，包含数据预处理脚本、不同对接工具的结果文件、多序列比对文件及模拟输入文件等，为相关研究提供数据支持。 文件详解 DataProcessing.zip：压缩文件，包含数据预处理的脚本及中间文件，用于从pdb文件中提取SMILES和蛋白质坐标 docking-...
-
Taverna工作流转换为Snakemake工作流的案例数据集
数据集概述 该数据集记录了将非功能性Taverna工作流转换为Snakemake工作流的过程，关键阶段融入大语言模型，包含原始废弃工作流、转换后工作流及相关制品，Jupyter笔记本详述各步骤。 文件详解 文件名称: Workflow_Revival_Uses_Case_ipynb (1).ipynb 文件格式: .ipynb 内容说明:...
-
ElPiGraph方法手稿补充图表数据集
数据集概述 本数据集为手稿《Robust and Scalable Learning of Complex Intrinsic Dataset Geometry via ElPiGraph》的配套补充图表，包含支持ElPiGraph方法（一种用于构建主图的可扩展鲁棒方法）的相关可视化材料，用于展示复杂数据集几何结构学习的研究成果。 文件详解 文件名称:...
-
Mgnify_Based_UHGP_v1_0_Based_系统发育数据库完整数据
数据集概述 该数据集为UHGP v1.0版本的系统发育数据库，来源于Mgnify基因组数据库，包含一个压缩格式的系统发育数据文件，用于存储与系统发育相关的信息。 文件详解 文件名称: phylogenize_data.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 数据集仅包含一个压缩文件，未提供具体字段映射或内容预览信息。 数据来源...
-
结核分枝杆菌治疗药物研发支持信息数据集
数据集概述 本数据集为结核分枝杆菌治疗药物研发相关研究的支持信息集合，包含研究论文配套的补充图表及关联数据，用于验证和补充主文本的研究结果与分析。 文件详解 文件名称: InhA-Supoorting-Info-Final-28May.pdf 文件格式: PDF 文件内容: 包含与研究论文相关的补充图表、表格及关联数据，为研究结果提供额外背景与验证依据...
-
河流大型底栖动物OTU共享分析补充材料2020
数据集概述 本数据集为研究论文的补充材料，包含一张展示不同河流系统（埃姆舍尔-恩内佩-西格、埃姆舍尔-恩内佩、埃姆舍尔-西格、西格-恩内佩）间共享OTU（操作分类单元）数量的图表，按目级分类学归属进行标注。 文件详解 文件名称: oo_435376.png 文件格式: PNG (.png) 文件内容: 图表（Figure...
-
scTFBridge转录因子结合先验数据集
数据集概述 该数据集包含转录因子（TF）基序结合先验数据，是深度学习模型scTFBridge的关键组成部分，用于生成转录因子-调控元件（TF-RE）掩码矩阵，以增强模型从单细胞多组学数据中推断基因调控网络的能力。 文件详解 文件名称：TF_RE_binding_matrix.zip 文件格式：ZIP压缩文件（.zip）...
