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格式: ZIP 标签: 粗粒化模拟

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  • MBOAT_家族蛋白的坐标文件_膜蛋白分子动力学模拟数据

    2026年1月30日 30 12 5

    数据集概述 本数据集包含膜结合O-酰基转移酶(MBOAT)家族蛋白的粗粒化(CG)和原子级分子动力学(MD)模拟首帧坐标文件,覆盖HHAT、PORCN、GOAT、DltB、ACAT1和DGAT1六种蛋白,支持研究该家族蛋白的结构与动态差异。 文件详解 文件名称:MBOAT_coordinates.zip 文件格式:ZIP...
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  • 乔丹_克莱因等人_2025_年关于蛋白质与膜相互作用的研究数据

    2026年1月28日 30 67 66

    数据集概述 本数据集基于粗粒化分子动力学模拟,研究含疏水条带的蛋白质区域与脂质膜的相互作用。通过系统改变疏水条带宽度、扭转程度及相互作用范围,观察到无相互作用、表面接触、倾斜插入三种状态,验证了Twister模型预测的膜变形模式,并基于疏水矩解释倾斜角度变化。数据集包含1个压缩文件。 文件详解...
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  • HIV_1_Vpr_Based_蛋白构象动力学与脂质双层离子通道模拟数据

    2026年1月22日 30 48 5

    数据集概述 本数据集为HIV-1 Vpr蛋白在脂质双层中构象动力学研究的分子动力学模拟文件,包含模拟所需的输入、参数及运行文件,支持离子通道建模相关分析,共包含2个文件。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • SND3膜插入酶分子动力学模拟数据集

    2025年12月19日 30 199 57

    数据集概述 本数据集包含研究论文“SND3 is the membrane insertase within a distinct SEC61 translocon complex”相关的分子动力学模拟文件,涵盖原子级和粗粒化模拟的参数、配置及分析代码,支持复现研究中的计算与可视化结果。 文件详解 文件名称:...
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  • 不同分子量聚己内酯熔体粗粒化模拟数据集

    2025年12月12日 30 46 38

    数据集概述 本数据集包含不同分子量(10、30、50、100、125个单体)聚己内酯(PCL)熔体的粗粒化分子动力学模拟结果,采用迭代玻尔兹曼反演方法构建相互作用势,模拟条件为500K恒温、1巴恒压。 文件详解 文件名称:CG_systematic_PCL_melt.zip 文件格式:ZIP压缩包(.zip)...
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  • 胆固醇对膜影响的非普遍性研究数据集

    2025年12月7日 30 15 5

    数据集概述 本数据集包含原子分子动力学模拟的设置文件、参数文件及后处理分析用的修改轨迹,围绕胆固醇对膜的流动性、曲率感知和弹性的非普遍性影响展开,对应2023年发表于《Nature Comm.》的研究。 文件详解 压缩文件: Membrane-...
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