数据集概述
本数据集包含原子分子动力学模拟的设置文件、参数文件及后处理分析用的修改轨迹，围绕胆固醇对膜的流动性、曲率感知和弹性的非普遍性影响展开，对应2023年发表于《Nature Comm.》的研究。
文件详解
- 压缩文件：
- Membrane-Systems.zip：包含各模拟系统的启动pdb（'name'_start.pdb）、拓扑文件（.top）、模拟参数（.mdp）、最终pdb（'name'_end.pdb）和模拟输入文件（.tpr）
- FF-Charmm.zip：提供Charmm力场文件
- FF-Martini.zip：提供Martini力场文件
- PDF文件：
- AA_Systems.pdf：列出所有原子（AA）模拟系统信息
- CG_Systems.pdf：列出粗粒化（CG）模拟系统信息
数据来源
Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg（德国埃尔朗根-纽伦堡大学）、Erlangen National High-Perfomance Computing Center（NHR@FAU）
适用场景
- 生物物理研究：分析胆固醇对细胞膜物理特性的影响机制
- 分子动力学模拟方法验证：评估不同力场（Charmm、Martini）在膜系统模拟中的表现
- 膜生物学机制探究：研究膜流动性、曲率感知与弹性的关联
- 计算生物学教学：作为分子动力学模拟实践的案例数据
