找到13个数据集

格式: ZIP 标签: 进化参数

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  • REML_MVN_Based_进化统计量采样误差估计数据

    2026年1月30日 30 114 70

    数据集概述 本数据集围绕进化统计量的采样误差估计展开,聚焦基于遗传方差-协方差矩阵(G)的最大似然法(含REML)应用。通过REML-MVN方法评估G矩阵及相关进化参数的变异性,并与参数化自举、贝叶斯MCMC方法对比,验证其在果蝇翅膀20维数据中的有效性,支持进化生物学领域的统计不确定性分析。 文件详解 README_for_REMLMVN.txt...
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  • AIC_BIC_Based_分子系统发育模型选择性能研究数据

    2026年1月29日 30 206 163

    数据集概述 本数据集围绕分子系统发育中AIC(赤池信息准则)和BIC(贝叶斯信息准则)在选择分区模型与混合模型的性能展开研究。包含模拟生成的序列比对数据、R分析结果文件、IQTREE2模型拟合结果及分析代码,总计2个文件,旨在为模型选择方法的评估与应用提供支撑。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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  • MG_Based_野生动物病原体宿主转移后CRISPR进化与丢失数据

    2026年1月26日 30 170 163

    数据集概述 本数据集围绕野生动物病原体鸡毒支原体(MG)宿主转移后的基因组进化展开,包含12株家朱雀分离株及4株家禽株的全基因组序列分析结果,重点记录CRISPR阵列的多样性变化、重复序列丢失及相关基因功能丧失情况,为研究野生鸟类细菌病原体的快速进化机制提供数据支持。 文件详解 基因组序列文件(共3个)...
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  • Phylogenies_Based_系统发育分化时间与多样化速率评估数据

    2026年1月22日 30 122 59

    数据集概述 本数据集围绕系统发育分化时间与多样化速率估计展开,通过模拟实验和实证分析评估相关方法的有效性。核心内容包括对替代率、物种形成率、灭绝率等变量的分析,以及特征采样和分类群采样对参数估计的影响,为宏观进化历史研究提供方法学参考。 文件详解 代码文件 格式:.rev、.r、.py...
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  • Radix_balthica_Source_淡水螺自交率估算方法比较研究数据

    2026年1月20日 30 33 15

    数据集概述 本数据集围绕雌雄同体淡水螺Radix balthica自然种群的自交率估算展开,对比直接子代阵列法与间接种群水平法的可靠性。通过10个高多态性微卫星标记,获取60个家系1034个野外胚胎及316个成螺的基因型数据,用于分析不同估算方法的差异及假设条件的影响。 文件详解 文件名称:Microsatellite genotype data...
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  • oomycete_evolution_Based_卵菌进化多基因座时间尺度分子钟模型数据

    2026年1月13日 30 195 20

    数据集概述 本数据集为卵菌进化多基因座时间尺度研究的分子钟模型数据,基于严格时钟、无相关松弛时钟和随机局部时钟三种模型估计卵菌分化时间,包含三种模型的XML格式结果文件,用于分析卵菌进化起源及主要类群分化时间。 文件详解 文件名称:StrictClockGamma_50mil.xml 文件格式:XML...
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  • ECE_2019_10_01384_Based_二倍体适应度依赖重组进化优势确定性模型研究数据

    2026年1月12日 30 191 117

    数据集概述 本数据集为二倍体适应度依赖重组进化优势研究的相关代码压缩包,基于确定性突变-选择-平衡模型,通过数值分析修饰因子模型探究无限随机交配种群中适应度依赖重组的进化优势,涉及至少三个基因座的选择系统、连锁修饰效应及交叉干扰影响等内容,包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称:Codes_for_ECE-2019-10-01384.zip...
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  • Phylogenomic_Inference_Based_系统发育基因组学位点与分区异质性研究数据

    2026年1月7日 30 117 11

    数据集概述 本数据集围绕系统发育基因组推断中位点模式异质性与分区异速性的相对重要性展开,包含模拟实验和实证分析数据。通过比较分区模型、位点异质性模型及组合模型的性能,探讨不同模型对系统发育推断准确性的影响,特别关注长枝吸引问题及模型选择策略。 文件详解 模拟实验数据(Simulated data)...
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  • ABC_Based_野生动物病原体Tracheliastes_polycolpus时空动态与进化参数研究数据

    2025年12月29日 30 25 22

    数据集概述 本数据集为研究新兴野生动物病原体Tracheliastes polycolpus的时空动态提供支持,通过近似贝叶斯计算(ABC)方法追溯其在西欧的传播历史与进化参数,包含样本详情与基因型数据,助力理解该病原体的引入时间、扩散路径及种群动态特征。 文件详解 文件名称:SampleDetails_Genotypes_MEC15-500.xlsx...
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  • 宏观进化自毁检测系统发育数据

    2025年12月23日 30 104 103

    数据集概述 本数据集聚焦于从系统发育树中检测宏观进化自毁现象,通过模拟和案例研究验证“自毁性”性状的系统发育分布特征,为相关进化理论提供数据支持。 文件详解 文件名称:Bromham.SuppInfo.pdf 文件格式:PDF (.pdf)...
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  • 异质进化过程时间推断数据集_从序列替代到系统地理学

    2025年12月22日 30 158 79

    数据集概述 本数据集围绕异质进化过程时间推断展开,包含相关研究的补充文档与XML文件压缩包,支持从序列替代到系统地理学领域的进化参数恢复与实证应用分析。 文件详解 文件名称:SupplementEpochModel.pdf 文件格式:PDF 内容:可能包含研究的补充说明、方法细节、实验结果或图表等辅助信息 文件名称:XMLs.tar.gz...
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  • 二倍体基因组杂合位点相位解析对多物种溯祖模型系统发育基因组分析的影响研究数据集

    2025年12月14日 30 39 0

    数据集概述 本数据集聚焦二倍体基因组杂合位点相位解析对多物种溯祖(MSC)模型下系统发育基因组分析的影响。通过计算机模拟评估四种相位解析策略(真实相位、二倍体解析整合算法、PHASE程序计算相位、随机解析)对物种树及进化参数估计的影响,并分析真实案例验证策略效果,为基因组测序项目数据生成提供建议。 文件详解 文件名称:...
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  • 进化参数推断的模糊编码方法研究数据集

    2025年12月9日 30 121 106

    数据集概述 本数据集聚焦于蛋白质进化历史的研究,探讨如何通过模糊编码处理缺失数据,从低分辨率序列(如氨基酸序列)中准确推断进化参数(如选择强度ω、祖先侧链构型),并验证该方法在模拟与实证数据中的有效性。 文件详解 文件名称:Ambiguity_SYSBIO_suppmat.pdf 文件格式:PDF(.pdf)...
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