找到28个数据集

标签: 全基因组序列

过滤结果
  • 埃及鹅源分枝杆菌森林亚种全基因组序列研究补充数据

    2026年2月1日 30 49 19

    数据集概述 本数据集是论文《First whole-genome sequence of Mycobacterium avium subsp. silvaticum isolated from a diseased Egyptian...
    packageimg
  • MG_Based_野生动物病原体宿主转移后CRISPR进化与丢失数据

    2026年1月26日 30 83 80

    数据集概述 本数据集围绕野生动物病原体鸡毒支原体(MG)宿主转移后的基因组进化展开,包含12株家朱雀分离株及4株家禽株的全基因组序列分析结果,重点记录CRISPR阵列的多样性变化、重复序列丢失及相关基因功能丧失情况,为研究野生鸟类细菌病原体的快速进化机制提供数据支持。 文件详解 基因组序列文件(共3个)...
    packageimg
  • PacBio_HiFi_Source_春冬型亚麻荠基因组组装分析补充文件

    2026年1月21日 30 122 7

    数据集概述 本数据集为使用PacBio HiFi技术对春型和冬型亚麻荠(Camelina sativa)进行全基因组序列组装与分析的补充文件,包含1个压缩包文件,无目录层级,未提供文件拆分或内容预览信息。 文件详解 文件名称:supplemental files.zip 文件格式:ZIP...
    packageimg
  • Oryza_rufipogon_Based_亚洲野生稻群体遗传学研究数据

    2026年1月21日 30 208 105

    数据集概述 本数据集来源于亚洲野生稻(Oryza rufipogon)群体遗传学研究,包含108份亚洲野生稻样本的42个全基因组序列标签位点(STS)的序列变异数据。研究通过贝叶斯聚类、主成分分析和AMOVA等方法,揭示了两个遗传分化群体(Ruf-I和Ruf-II)的地理渐变模式,支持亚洲栽培稻(O....
    packageimg
  • Prochlorococcus_Based_海洋蓝细菌多样分离株基因组数据

    2026年1月21日 30 5 4

    数据集概述 本数据集包含27株海洋蓝细菌Prochlorococcus的全基因组序列(2株完整闭合,25株草稿质量),覆盖5个主要系统发育分支,分离自全球不同海域。同时提供预计算的蛋白质直系同源组(COGs)聚类数据,可用于比较基因组学研究,是微生物生态学、进化和海洋学领域的重要参考资料。 文件详解 文档文件(document_files)...
    packageimg
  • 佐藤秀树_Sathuperi_Shamonda_在日本分离的病毒基因组序列数据

    2026年1月20日 30 126 0

    数据集概述 本数据集为论文“日本分离Sathuperi和Shamonda病毒的全基因组序列”的补充信息,包含1个文件,记录与该研究相关的引物列表数据,用于支持病毒基因组序列的研究分析。 文件详解 文件名称:primer list.xlsx 文件格式:XLSX...
    packageimg
  • AIV_Based_墨西哥高致病性禽流感H7N3病毒系统发育与地理起源研究数据

    2026年1月19日 30 164 163

    数据集概述 本数据集围绕墨西哥高致病性禽流感H7N3病毒的起源展开,包含通过最大似然法和贝叶斯法构建的系统发育树文件。研究通过分析北美地区禽流感病毒全基因组序列的8个片段,结合地理、亚型、宿主等离散性状建模,揭示该病毒源于北美低致病性禽流感病毒库的重配事件,涉及不同迁徙路线野鸟的病毒片段贡献。 文件详解 文件名称:Maximum likelihood...
    packageimg
  • Helicoverpa_armigera_Based全球种群结构与基因流动研究数据

    2026年1月18日 30 180 2

    数据集概述 本数据集为全球农业害虫棉铃虫(Helicoverpa armigera)的种群结构与基因流动研究数据,涵盖六大洲种群的线粒体基因组、基因分型及全基因组序列等信息,用于分析其种群来源、基因交流及与近缘种的关系,助力生物安全风险评估。 文件详解 文件名称:b3_b1b2_snps.vcf.bz2 文件格式:VCF.BZ2...
    packageimg
  • SARS_CoV_2_Based_多变异株结构蛋白疫苗研发用分离株全基因组序列数据

    2026年1月18日 30 47 44

    数据集概述 本数据集包含用于下一代新冠疫苗研发的特定SARS-CoV-2分离株全基因组序列,聚焦多变异株的结构蛋白分析,为相关疫苗开发提供基础生物数据支持,仅含一个文件。 文件详解 文件名称:Translated Protein Sequence.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含SARS-...
    packageimg
  • PoAstVs_GenBank_Based_东非小型猪场猪星状病毒基因组分析补充数据

    2026年1月18日 30 196 132

    数据集概述 本数据集为东非小型猪场猪星状病毒研究的补充材料,包含5个表格,记录猪星状病毒全基因组及衣壳蛋白(ORF2)的核苷酸、氨基酸序列比对结果、进化分歧估计和潜在抗原表位预测,用于揭示东非流行的新型遗传多样性基因型,支持病毒基因组学研究。 文件详解...
    packageimg
  • Proboscidean_Palaeoproteomic_长鼻目古蛋白质组参考数据集

    2026年1月18日 30 142 14

    数据集概述 本数据集为长鼻目古蛋白质组参考数据集,通过PaleoProPhyler工具翻译35个以上现存及灭绝长鼻目物种的公开全基因组序列生成。包含物种个体元数据、目标蛋白质列表、所有生成的蛋白质序列,以及按蛋白质和样本分类的序列文件,支持长鼻目物种的古蛋白质组学研究。 文件详解 压缩包文件:PRD.zip 文件格式:ZIP 包含内容:...
    packageimg
  • Phage_Genome_Based_四株噬菌体全基因组序列及比较分析完整数据集

    2026年1月15日 30 33 3

    数据集概述 本数据集包含四株噬菌体(NJ-P3、NB-P21、NC-P34、NN-P42)的重组装全基因组序列及比较基因组分析结果。通过对原始数据的重新分析,提供了噬菌体基因组序列、基因坐标注释、末端分析及基因组比较可视化等核心内容,总计10个文件,支持噬菌体基因组学研究。 文件详解 基因组序列文件(.fa格式) 文件名称:Phage...
    packageimg
  • stickleback_genome_Based_三刺鱼种群全基因组序列分析数据

    2026年1月15日 30 11 1

    数据集概述 本数据集包含81个三刺鱼全基因组序列分析结果,覆盖太平洋北美、格陵兰及北欧16个种群。通过核SNPs主成分分析、线粒体基因组序列分析及全基因组重组 coalescence 方法,揭示不同地理区域种群的分化特征、谱系混合模式及种群动态历史差异,为三刺鱼适应性进化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:mtDNA_alignments.zip...
    packageimg
  • Shewanella_Gammaproteobacteria_基因树物种树二分法研究数据

    2026年1月13日 30 113 70

    数据集概述 本数据集基于γ-变形菌属Shewanella的全基因组序列,围绕基因树与物种树二分法展开研究。包含从243个共线基因同源区域中选取的单基因及核心基因组共线基因集,通过最大简约法(MP)和最大似然法(ML)进行系统发育分析,探索基因同源性与特征同源性的差异,为分子系统学研究提供案例支持。 文件详解 压缩文件(.zip) 文件名称:one...
    packageimg
  • IAV_2009_H1N1_Pandemic_Origins_In_Mexican_Swine_Data

    2026年1月1日 30 35 8

    数据集概述 本数据集针对2009年H1N1流感大流行(pdmH1N1)的猪源起源问题,提供了墨西哥猪群中采集的58条甲型流感病毒(IAV)全基因组序列相关数据,包含CSV格式的数据集、基因库编号表、图表源数据及XML压缩包,共9个文件,用于验证该大流行病毒在墨西哥中部猪群中的进化起源。 文件详解 CSV数据文件(8个) 文件名称:Data set...
    packageimg
  • BEAST_XML_Based_2009_H1N1流感大流行分子流行病学实时特征研究数据_archive

    2025年12月31日 30 171 145

    数据集概述 本数据集围绕2009年H1N1甲型流感大流行展开,通过贝叶斯系统发育学方法,基于全基因组序列模拟实时估计大流行的进化速率、出现日期及内在增长率(r0),同时探究采样时间范围和数据集大小对参数估计精度与准确性的影响,为大流行期间干预策略提供数据支持。 文件详解 文件名称:BEAST_XML.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
    packageimg
  • Arundinarieae_Chloroplast_Phylogenomics_青篱竹族系统发育关系分析数据

    2025年12月29日 30 39 19

    数据集概述 本数据集为青篱竹族(Arundinarieae)叶绿体系统基因组学分析数据,涵盖25个物种(22种温带木本竹类和3个外类群)的全基因组或部分基因组序列,旨在解析该类群11个主要支系的深层系统发育关系。数据包含矩阵、序列比对及补充图表等三类压缩文件,可用于研究植物低分类阶元的系统发育问题。 文件详解 Data matrices.zip...
    packageimg
  • ENA_PRJEB44986_南极稀有放线菌Barrientosiimonas_humi全基因组序列与注释数据集

    2025年12月27日 30 35 31

    数据集概述 本数据集为南极稀有放线菌新属新种Barrientosiimonas humi gen. nov., sp. nov. 39T的全基因组测序与注释结果源文件,包含基因组特征、功能分类、蛋白序列相似性等分析内容,共10个文件,可用于该菌株的基因组学与功能生物学研究。 文件详解 功能分类分析文件(.xlsx格式,共6个) 包含:Fig....
    packageimg
  • 苜蓿属基因组系统发育信号变异数据集

    2025年12月23日 30 122 109

    数据集概述 该数据集包含29种苜蓿属(豆科)植物的全基因组序列数据,通过与蒺藜苜蓿参考基因组比对,获得八万七千五百九十六个可变同源位点。用于解析苜蓿属内系统发育关系、评估不同位点数量的系统发育信号强度,以及识别与全基因组系统发育冲突的基因组区域。 文件详解 该数据集包含12个文件,具体说明如下: - 系统发育数据文件(.phy格式,共9个): -...
    packageimg
  • 基于全基因组序列的系统发育基因组学数据集_aTRAM方法

    2025年12月23日 30 92 14

    数据集概述 本数据集展示了使用自动化目标限制组装方法(aTRAM)从吸血虱(Anoplura)及外类群全基因组测序数据中组装1107个单拷贝直系同源基因的研究成果,包含相关分析文件与补充材料。 文件详解 文档类文件(.pdf格式): SupplementalFigure1.pdf:补充图表文件,可能包含系统发育分析相关的可视化结果...
    packageimg