数据集概述
本数据集为全球农业害虫棉铃虫(Helicoverpa armigera)的种群结构与基因流动研究数据,涵盖六大洲种群的线粒体基因组、基因分型及全基因组序列等信息,用于分析其种群来源、基因交流及与近缘种的关系,助力生物安全风险评估。
文件详解
- 文件名称:b3_b1b2_snps.vcf.bz2
- 文件格式:VCF.BZ2
- 字段映射介绍:压缩格式的SNP数据文件,包含单核苷酸多态性位点信息,用于种群基因变异分析。
- 文件名称:denovogbs.tar
- 文件格式:TAR
- 字段映射介绍:压缩归档文件,包含从头基因分型(GBS)相关数据,用于种群遗传多样性分析。
- 文件名称:mtdna.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:线粒体基因组序列文件,用于棉铃虫与其他夜蛾科物种的系统发育关系分析。
- 文件名称:Supplementary document FINAL.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:补充文档,包含研究相关的详细说明、方法或结果补充内容。
- 文件名称:all_bacs.vcf.bz2
- 文件格式:VCF.BZ2
- 字段映射介绍:压缩格式的SNP数据文件,基于细菌人工染色体(BACs)的全基因组序列比对结果,用于种群基因交流水平评估。
数据来源
论文“Population structure and gene flow in the global pest, Helicoverpa armigera”
适用场景
- 农业害虫生物安全评估: 分析棉铃虫种群来源与扩散路径,识别潜在生物安全风险点。
- 种群遗传学研究: 利用SNP和基因组数据探究棉铃虫全球种群结构、基因流动模式及进化历史。
- 物种系统发育分析: 通过线粒体基因组序列解析棉铃虫与近缘物种的亲缘关系。
- 农业害虫防控策略制定: 基于种群基因交流特征,优化棉铃虫跨境传播的监测与防控措施。
- 杂交种鉴定研究: 辅助检测棉铃虫与近缘种(如Helicoverpa zea)的自然杂交个体。