数据集概述
本数据集包含四株噬菌体(NJ-P3、NB-P21、NC-P34、NN-P42)的重组装全基因组序列及比较基因组分析结果。通过对原始数据的重新分析,提供了噬菌体基因组序列、基因坐标注释、末端分析及基因组比较可视化等核心内容,总计10个文件,支持噬菌体基因组学研究。
文件详解
- 基因组序列文件(.fa格式)
- 文件名称:Phage NJ-P3(SRR8402465).fa、Phage NB-P21(SRR8403229).fa、Phage NC-P34(SRR8403928).fa、Phage NN-P42(SRR8410130).fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:包含对应噬菌体的重组装全基因组序列信息
- 基因坐标注释文件(.xlsx格式)
- 文件名称:Coordinates of genes in phage NJ-P3.xlsx、Coordinates of genes in phage NB-P21.xlsx、Coordinates of genes in phage NC-P34.xlsx、Coordinates of genes in phage NN-P42.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录各噬菌体基因组中基因的坐标位置信息
- 末端分析文件(.xlsx格式)
- 文件名称:Termini analysis of four phages.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含四株噬菌体基因组末端的分析数据
- 比较基因组分析可视化文件(.tif格式)
- 文件名称:Comparative genomic analyses of four phages by DNAMAN.tif
- 文件格式:TIF
- 字段映射介绍:通过DNAMAN工具生成的四株噬菌体比较基因组分析的可视化结果
适用场景
- 噬菌体基因组结构研究: 利用基因组序列文件分析四株噬菌体的基因组成、序列特征及结构差异
- 噬菌体基因功能注释: 通过基因坐标文件定位并研究噬菌体基因组中的功能基因分布
- 噬菌体进化分析: 基于比较基因组分析文件探究四株噬菌体的亲缘关系及进化路径
- 噬菌体末端特性研究: 利用末端分析文件解析噬菌体基因组末端的结构特点及生物学意义
- 噬菌体分子特征可视化: 通过可视化文件直观展示四株噬菌体基因组的比较分析结果