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NanoPharos_Source_17种碳纳米颗粒与SARS_CoV_2_RNA片段相互作用能数据
2026年1月4日 30 10 1
数据集概述 本数据集包含17种不同类型碳纳米颗粒（CNPs，含富勒烯、单壁/多壁碳纳米管、石墨烯）的物理化学及分子描述符，以及这些碳纳米颗粒与SARS-CoV-2 RNA片段之间的总势能、范德华能和静电能数据，为纳米材料与新冠病毒RNA相互作用研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：NP15_CNPs_Covid19_RNA_data.xlsx...
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Molecular_Dynamic_Simulation_Based_CL5D加速SIRT6产物解离研究数据
2025年12月29日 30 11 8
数据集概述 本数据集包含CL5D加速SIRT6产物解离的分子动力学模拟相关数据，涵盖SIRT6及SIRT6-CL5D系统的初始结构、平衡结构快照、模拟配置文件及图表源数据，支持论文图表生成与模拟过程复现，总计包含14个文件。 文件详解 源数据文件 文件名称：Source Data.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：用于生成论文正文图表的源数据...
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UA_PMFs_silver_zero_valent_Based_零价银纳米颗粒生物纳米相互作用联合原子参数数据
2025年12月27日 30 76 5
数据集概述 本数据集提供用于零价银纳米颗粒生物纳米相互作用多尺度建模的联合原子参数，包含碳水化合物、脂质片段和氨基酸侧链的短程表面吸附势表格式数据。数据通过AWT-MetaD（Gromacs/Plumed）计算，基于INTERFACE/CHARMM36力场，为相关分子模拟研究提供参数支持。 文件详解...
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Scalfi等人2020年发表于JCP_论文编号153_174704的基于半经典托马斯_费米模型的电极金属性调控机制研究数据集
2025年12月27日 30 86 61
数据集概述 本数据集为论文“A semiclassical Thomas–Fermi model to tune the metallicity of electrodes in molecular simulations”的关联数据，包含用于生成论文图表的输入文件和处理后数据，涉及分子模拟中电极金属性调控的半经典托马斯-费米模型相关内容。 文件详解...
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吖啶酮类化合物抗奥罗普切病毒候选药物研究数据集
2025年12月25日 30 177 56
数据集概述 本数据集围绕吖啶酮类化合物作为抗奥罗普切病毒（OROV）候选药物的研究展开，包含体外抑制实验结果、作用机制分析数据及相关图表，为开发新型抗病毒药物提供研究支持。 文件详解 图表文件（共7个.jpg格式文件）： Sup Fig 1.jpg、Sup Fig 2.jpg、Sup Fig 3.jpg、Sup Fig 4.jpg、Sup Fig...
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肠道炎症介导分子模拟神经炎症的单细胞RNA与TCR测序数据集
2025年12月23日 30 138 132
数据集概述 本数据集为相关研究论文的配套数据，包含经处理的批量T细胞受体测序数据、单细胞RNA测序数据，以及对应的分析脚本、参考注释和表格输出，支持探究肠道炎症对肠道共生菌特异性CD4 T细胞及分子模拟神经炎症的作用机制。 文件详解 文件名称: scRNA_TCRseq_Data.zip 文件格式: ZIP压缩包 压缩包内包含内容:...
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新型靛红_没食子酸酯杂化物抗氧化抗癌活性评价及抗癌与抗冠状病毒分子模拟研究的红外与核磁共振数据集
2025年12月23日 30 138 104
数据集概述 本数据集包含新型靛红-没食子酸酯杂化物相关的红外（IR）与核磁共振（NMR）数据，用于支持其抗氧化、抗癌活性评价及抗癌与抗冠状病毒分子模拟研究的学术文章。 文件详解 红外光谱图片文件（.jpg格式）： IR Compound 1.jpg：化合物1的红外光谱图 IR Compound 3a.jpg：化合物3a的红外光谱图 IR...
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不对称环收缩反应生物催化研究数据集
2025年12月21日 30 156 129
数据集概述 该数据集包含研究论文《Asymmetric Ring Contraction of 2-Hydroxypyranones by Borrowing Hydrogen Biocatalysis》的原始数据，涵盖NMR数据、计算分子模拟、色谱图及原始NMR文件等内容。 文件详解 NMR files.zip:...
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DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_1Mol_Based_磷脂双分子层动力学模拟完整数据
2025年12月21日 30 28 14
数据集概述 该数据集包含1摩尔浓度氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件，采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟条件为323K，含72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对钠氯离，轨迹时长120纳秒，分析最后60纳秒数据。 文件详解 模拟参数与配置文件： md.mdp：模拟参数文件，记录模拟条件设置...
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熊果苷_6_十一烯酸酯分子模拟与酪氨酸酶抑制研究数据集
2025年12月20日 30 113 36
数据集概述 本数据集围绕熊果苷-6'-十一烯酸酯的合成、分子模拟及酪氨酸酶抑制活性展开，包含酶催化合成产物的实验数据与结构表征文件，为研究该化合物作为酪氨酸酶抑制剂的潜力提供支持。 文件详解 文件名称: Tyrosinase_inhibition_assay_.xlsx 文件格式: XLSX 内容说明:...
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YDS_Upload_14_Based_分子模拟多格式数据完整数据集
2025年12月19日 30 20 7
数据集概述 该数据集包含17个文件，涵盖图像文件、数据文件、配置文件、代码文件等多种类型，主要内容涉及分子模拟相关的数值结果（如tfd、rmsd）及对应的可视化图表，为相关研究提供数据与分析支持。 文件详解 该数据集由17个文件组成，具体说明如下： - 图像文件（.png格式，共9个）： -...
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鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制分子动力学模拟数据集
2025年12月19日 30 156 52
数据集概述 本数据集包含鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制研究的分子动力学模拟快照及力场拓扑文件。核心内容为模拟得到的三种结合模式（ROT1、pre-redox、ROT2）的蛋白质-配体结构，以及GROMACS格式的鱼藤酮及其衍生物的力场参数文件，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 分子模拟快照文件（位于configurations/目录下）:...
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共轭聚合物扭转离域能参数化QM数据集
2025年12月9日 30 81 19
数据集概述 本数据集包含用于共轭聚合物扭转离域能参数化的量子力学（QM）数据，由原始QChem输出文件（压缩包）和提取的结构化数据文件（CSV）组成，支持相关研究的可重复性，为后续更新和扩展提供基础。 文件详解...
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杆状聚合物各向同性向向列相转变的分子模拟数据集
2025年12月4日 30 85 50
数据集概述 本数据集对应B. Yan等人发表的关于杆状聚合物在本体及受限条件下各向同性向向列相转变的分子模拟研究，包含模拟配置数据及访问说明文档，为相关分子模拟研究提供支持。 文件详解 文件名称：README_Zenodo_I-NSemiFlexible.txt 文件格式：TXT（.txt） 内容：提供数据集访问及文件读取说明，对应Biao...
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羧基化柱_6_芳烃主客体结合中无端点自由能技术综合评估数据集
2025年12月16日 30 148 67
数据集概述 本数据集聚焦羧基化柱[6]芳烃主客体结合研究，包含所有初始结构、Autodock对接的配体构象及计算结果，为无端点自由能技术的综合评估提供数据支持。 文件详解 文件名称: SI.pdf，文件格式: PDF，包含研究的补充信息，可能涉及实验方法、计算细节或结果说明 文件名称: Data.zip，文件格式:...
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星际尘埃表面乙醇酰胺形成数据集
2025年12月16日 30 67 20
数据集概述 本数据集包含星际尘埃表面乙醇酰胺形成相关的分子结构XYZ文件，涵盖H₂CO与NH₂CO在W18团簇上的吸附结构、反应步骤的反应物/过渡态/产物结构，以及NH₂COCH₂O+H复合物的开壳层单重态结构。 文件详解 文件名称: support_material.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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人参皂苷F1生产相关多功能糖苷酶分子模拟数据集
2025年12月16日 30 21 15
数据集概述 该数据集包含人参皂苷F1生产相关的分子对接及动力学模拟数据，针对野生型β-葡萄糖苷酶BgDU及其DUase突变体与底物NG-R1、G-Rg1的结合动态及构象变化，开展了四组独立模拟研究，为糖苷酶结构工程改造提供数据支持。 文件详解 数据集包含四个核心文件夹，具体说明如下： - Docking Structure文件夹： -...
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含官能团基准分子数据库
2025年12月15日 30 162 65
数据集概述 该数据集包含156个分子的计算数据，每个分子对应约800个构象。数据以支持CRUD操作的数据库形式存储，每个分子和构象均有唯一标识符，分子关联对应的官能团信息，同时提供官能团说明的PDF文档，便于分子数据的管理与检索。 文件详解 文件名称:...
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细菌外膜囊泡脂质相分离与抗菌肽耐药性数据集
2025年12月15日 30 179 3
数据集概述 本数据集围绕细菌外膜囊泡内脂质相分离介导其对 antimicrobial peptides 耐药性的研究主题，包含相关分子动力学（MD）数据的压缩文件，为探究细菌耐药机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: MD_Files.zip 文件格式: .zip（压缩文件） 内容说明:...
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类药物分子溶剂化自由能数据集
2025年12月14日 30 132 80
数据集概述 本数据集围绕类药物分子的溶剂化自由能展开，通过显式溶剂中的快速增长方法，对AM1-BCC、RESP/HF/6-31G*、RESP/QM/等模型进行评估，为相关计算化学研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: abcg2_assess.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明:...
