SAMPL9_Based_甲苯水分配系数NE_FG盲预测ORAC6_1数据

数据集概述

本数据集为SAMPL9挑战中甲苯/水分配系数(LogP)的非平衡快速增长(NE-FG)盲预测复现数据,基于s/w ORAC6.1工具构建,包含电荷参数库、分子结构文件、工作数据目录、辅助脚本及挑战提交分析结果等内容。

文件详解

  • 核心目录结构:
  • lib-631Gd:含6-31Gd电荷的GAFF2 ORAC拓扑参数库
  • lib-am1bcc:含am1bcc电荷的GAFF2 ORAC拓扑参数库
  • pdb:化合物与溶剂的PDB结构文件目录
  • work-am1-bcc:使用AM1-BCC电荷集的工作数据目录
  • work-6-31Gd:使用HF/6-31Gd电荷集的工作数据目录
  • bin:辅助脚本目录(详见内部README)
  • LogP-analysis:SAMPL9 LogP所有提交结果的分析目录(详见内部README)
  • 压缩包文件:
  • 文件名称:NE-FG.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容说明:包含上述所有目录的归档文件

数据来源

www1.chim.unifi.it/orac

适用场景

  • 计算化学方法验证:复现NE-FG方法对甲苯/水LogP的盲预测结果,评估方法准确性
  • 分子力场参数优化:对比GAFF2力场下不同电荷集(6-31Gd、am1bcc)对分配系数预测的影响
  • 药物设计辅助:利用LogP预测数据优化小分子化合物的亲水性/亲脂性设计
  • 计算工具性能评估:基于SAMPL9挑战分析结果,评估ORAC6.1工具在LogP预测任务中的表现
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.23 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。