找到57个数据集

标签: 参考基因组

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  • 硬质小麦盐胁迫下表型根系结构的基因型变异数据

    2026年2月9日 30 192 2

    数据集概述 本数据集为硬粒小麦在盐胁迫下根系表型多样性与基因型变异研究的补充数据,包含盐胁迫和对照条件下表型性状的主成分值、与QTL关联的标记在参考基因组上的位置、与NCBI数据库基因关联的标记及PCR结果与等位基因分布,共1个Excel文件。 文件详解 文件名称:WP2_T2.1_UNITUS_RSA and salt stress durum...
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  • 奇努克鲑鱼基因组变异_生活史特征及相关数据

    2026年2月1日 30 8 0

    数据集概述 本数据集基于奇努克鲑鱼染色体水平参考基因组(2.36 Gb),通过全基因组重测序分析不同生活史性状种群的基因组变异,揭示其生态进化适应性的遗传基础,重点识别了与产卵洄游时间相关的28号染色体主效区域,包含4个核心文件。 文件详解 CHI06.ncbi2.annotation.gff3.gz 文件格式:GZ压缩包(内含GFF3文件)...
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  • Sus_scrofa_Based_野猪基因分型数据集

    2026年1月31日 30 65 48

    数据集概述 本数据集为野猪(Sus scrofa)的基因分型数据,包含PED和MAP格式文件,可通过PLINK、GCTA等工具进行分析。数据集共4个文件,涵盖不同版本和密度的基因分型数据及说明文档,支持动物遗传学相关研究。 文件详解 .map格式文件(3个)...
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  • 选择性性别偏好分散行为_圆顶鲨鱼_适应性变异_研究数据

    2026年1月31日 30 175 124

    数据集概述 本数据集为双髻鲨(Sphyrna tiburo)性别偏向扩散与选择研究的相关数据,包含样本信息、遗传序列、处理脚本等11个文件。核心内容涉及该鲨鱼核基因SNP及线粒体控制区序列变异分析,用于探究雌性恋家行为对适应性变异的影响,支持海洋生物遗传结构与扩散机制研究。 文件详解 样本与处理脚本类...
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  • AFLP_454_Based蚊虫抗药性基因识别研究数据

    2026年1月30日 30 41 28

    数据集概述 本数据集围绕埃及伊蚊对苏云金杆菌以色列亚种(Bti)毒素的抗药性基因识别展开,结合AFLP基因组扫描与454焦磷酸测序技术,包含从抗药性和易感品系中检测出的异常位点序列及相关分析数据,共涉及三个文件。 文件详解 BatchAAEL012918.sqn 文件格式:SQN...
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  • Populus_杨属物种性别决定区域基因组关联研究数据

    2026年1月30日 30 129 18

    数据集概述 本数据集为杨属物种性别决定机制研究相关数据,包含86个杨属个体(52个毛果杨、34个香脂杨)的全基因组重测序结果,涉及性别关联SNP、系统发育树、序列文件及连锁不平衡数据等,用于分析杨属性别决定区域的大小、进化时间及性别决定系统类型。 文件详解 文档文件...
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  • Bos_taurus_Genotyping_DATASET

    2026年1月30日 30 39 1

    数据集概述 本数据集包含Bos taurus(牛)的基因分型文件,采用PED和MAP格式,可通过PLINK、GCTA等工具进行分析。共包含四个文件,以.map格式为主,涵盖不同密度的基因分型数据及说明文档,适用于牛的遗传研究。 文件详解 文档文件 文件名称:Bos taurus DATASET.docx 文件格式:DOCX...
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  • LMAS_Source_微生物群落组装软件基准测试补充材料

    2026年1月30日 30 175 150

    数据集概述 本数据集为LMAS(自动化工作流程)的补充材料,包含用于基准测试传统及宏基因组原核生物从头组装软件的模拟数据与参考基因组信息。以ZymoBIOMICS微生物群落标准的8个细菌基因组和4个质粒(三重形式)为参考,通过inSilicoSeq生成带或不带错误的均匀分布模拟原始序列数据,共31个文件。 文件详解 表格文件(Tables)...
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  • 果蝇实验性杂交育种_染色体倒位与X染色体不相容位点关联数据

    2026年1月30日 30 41 23

    数据集概述 本数据集为果蝇实验渐渗研究数据,围绕D. flavomontana与D. montana两个物种的种间基因流展开,通过回交实验结合基因组测序,分析染色体倒位和X染色体不相容位点对合子后生殖隔离的影响,识别限制或增加基因渐渗的染色体区域,共包含六个相关文件。 文件详解 README_file.txt 文件格式:TXT...
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  • Sebastes_Based_岩鱼性别鉴定标记基因组特征数据

    2026年1月29日 30 176 23

    数据集概述 本数据集为Sebastes carnatus和Sebastes chrysomelas两种岩鱼的性别鉴定标记基因组特征数据,通过ddRAD-seq技术分析40个性别已知个体的基因组DNA,识别出雄性特异性位点,验证其XY性别决定系统,包含相关分析文件及验证结果。 文件详解 scaffCheck.R 文件格式:.R...
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  • GBS_PAG2018_八倍体草莓基因分型与变异发现研究数据

    2026年1月29日 30 143 11

    数据集概述 本数据集为八倍体草莓(Fragaria × ananassa)基因分型与变异发现研究数据,基于基因分型测序(GBS)技术与参考基因组,测试PstI-MseI和HindIII-MseI两种酶组合的双酶切方案,通过Illumina HiSeq...
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  • Lep_Anchor_Based_刺鱼参考基因组组装优化数据

    2026年1月29日 30 7 5

    数据集概述 本数据集记录了使用Lep-Anchor软件整合密集连锁图谱、重叠检测和长读长桥接技术,优化九刺和三刺刺鱼参考基因组组装的过程与结果。通过去除单倍型contig、提升基因组连续性(尤其是X染色体)及检测遗传变异,展示了非模式生物基因组组装优化的方法与效果。 文件详解 文件名称:NSP_V7.zip 文件格式:ZIP...
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  • Rye_Reference_NLRome_黑麦抗性基因注释数据

    2026年1月28日 30 133 19

    数据集概述 本数据集包含对近期发布的黑麦(Rye)参考基因组'Lo7'和'Weining'中核苷酸结合富亮氨酸重复序列(NB-LRR或NLR,主要抗性基因家族)的注释信息。旨在为黑麦NLRome的进一步研究及新型抗病品种选育提供有价值且易于获取的资源,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:Lo7_NLRome_NB-ARC.fasta...
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  • Rhagoletis_Based果蝇滞育适应性分化基因组研究数据

    2026年1月28日 30 45 19

    数据集概述 本数据集包含Rhagoletis果蝇苹果和山楂寄主种群滞育适应性分化的基因组研究数据,涉及基因位点变异、等位基因频率、滞育相关性状分析及数据处理脚本等内容,用于解释适应性进化中多性状组合与拮抗选择导致的反直觉遗传模式,共含37个文件。 文件详解 基因组数据文件...
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  • Catharus_Based_鸫属隐存物种基因组数据集_2021

    2026年1月28日 30 167 4

    数据集概述 本数据集聚焦鸫属(Catharus)鸟类的隐存物种形成基因组学研究,包含比氏夜鸫(C. bicknelli)、灰颊夜鸫(C. minimus)及斯温氏夜鸫(C. ustulatus)的参考基因组与种群重测序数据,以及相关分析结果。数据用于探究物种分化历史、遗传分化、基因组结构及适应性进化过程,共包含2个核心文件。 文件详解...
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  • RNA_seq_Based_转录组组装与差异表达量化策略评估数据

    2026年1月28日 30 149 143

    数据集概述 本数据集为RNA-seq实验转录组组装与差异表达量化的模拟评估数据,包含16个文件,涵盖脚本、代码及压缩包。用于探究转录组特征、技术处理及生物信息学流程对转录组质量和差异表达推断的影响,为RNA-seq实验设计与分析提供方法学参考。 文件详解 代码脚本文件...
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  • antiSMASH_Based_Gordonia参考基因组挖掘结果数据

    2026年1月26日 30 103 71

    数据集概述 本数据集为使用抗SMASH工具挖掘Gordonia参考基因组所得的结果数据表,包含1个Excel文件,未划分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理集,文件类型单一为.xlsx格式,无目录层级结构。 文件详解 文件名称:Table_S9.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Dryad_Source_果蝇sd基因突变背景效应整合基因组分析数据集

    2026年1月26日 30 15 2

    数据集概述 本数据集为果蝇scalloped E3(sd)基因突变背景效应的整合基因组分析数据,包含基因渗入定位实验的基因组数据集、RNA基因表达数据集、亲本株系全基因组重测序数据,以及与已发表表达芯片、修饰突变筛选数据的整合结果,用于探究sd突变表型的背景依赖性机制及相关候选基因位点。 文件详解...
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  • yevis_getting_started线粒体测序分析工作流完整数据

    2026年1月26日 30 181 154

    数据集概述 本数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的一个工作流数据,包含31个文件,涉及人类线粒体基因组分析所需的参考序列、配置文件、工作流脚本等。数据覆盖参考基因组文件、索引文件、黑名单位点文件、工作流定义文件(WDL)、输入参数配置文件等类型,用于支持线粒体基因组的比对、变异检测等分析流程。 文件详解...
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  • genetic_linkage_Based_遗传连锁数据集及分析结果

    2026年1月25日 30 38 10

    数据集概述 本数据集包含遗传连锁分析相关的原始数据与结果文件,涵盖基因型数据、遗传图谱、群体频率、家系信息及分析结果压缩包,共6个文件,支持遗传连锁研究及相关生物信息学分析。 文件详解 freq_NFE_hg19.txt(TXT格式):包含SNP位点的群体频率数据,字段包括SNP名称(Name)、频率(Freq)、染色体(Chr)、位置(Pos)。...
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