数据集概述
本数据集为果蝇scalloped E3（sd）基因突变背景效应的整合基因组分析数据，包含基因渗入定位实验的基因组数据集、RNA基因表达数据集、亲本株系全基因组重测序数据，以及与已发表表达芯片、修饰突变筛选数据的整合结果，用于探究sd突变表型的背景依赖性机制及相关候选基因位点。
文件详解
- 文件名称：README_for_CHC_SC_DT_ID_Dryad.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据分析复现说明，涉及SAM/ORE亲本基因组、回交系的原始测序 reads 下载路径，Drosophila参考基因组索引构建脚本（sequencing_scripts/read_mapping/index_reference.sh）等分析流程指引。
- 文件名称：CHC_SC_DT_ID_Dryad.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含基因渗入定位实验的基因组数据集、RNA基因表达数据集、亲本株系全基因组重测序数据等核心数据文件，具体内容需解压后查看。
数据来源
Dryad数据平台（对应标题为“Causes and consequences of genetic background effects illuminated by integrative genomic analysis”的研究）
适用场景
- 遗传背景效应机制研究：分析sd基因突变表型的背景依赖性及调控机制。
- 基因组与转录组整合分析：探究基因突变与基因表达、转录因子结合位点的关联。
- 上位性模式研究：解析遗传背景对上位性模式的影响规律。
- 果蝇遗传学实验复现：支持基于本数据集的基因定位、表达分析等实验复现与拓展研究。
