数据集概述
本数据集基于奇努克鲑鱼染色体水平参考基因组（2.36 Gb），通过全基因组重测序分析不同生活史性状种群的基因组变异，揭示其生态进化适应性的遗传基础，重点识别了与产卵洄游时间相关的28号染色体主效区域，包含4个核心文件。
文件详解
- CHI06.ncbi2.annotation.gff3.gz
- 文件格式：GZ压缩包（内含GFF3文件）
- 字段映射介绍：奇努克鲑鱼基因组注释文件，包含基因位置、结构等标准GFF3格式注释信息
- Dryad Table 1-cand genes within lineages.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：谱系内候选基因表格，记录奇努克鲑鱼不同谱系内与适应性相关的候选基因信息
- Dryad Table 2-cand genes between lineages.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：谱系间候选基因表格，记录奇努克鲑鱼不同谱系间分化相关的候选基因信息
- Dryad Table 3-GO enrichment results.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：GO富集分析结果表格，包含候选基因的基因本体功能富集注释信息
数据来源
论文“Genomic variation underlying complex life history traits revealed by genome sequencing in Chinook salmon”
适用场景
- 鱼类进化基因组学研究: 分析奇努克鲑鱼生活史性状的遗传基础与基因组变异模式
- 适应性进化机制研究: 探究不同谱系内/间候选基因的适应性分化机制
- 功能基因组学分析: 利用GO富集结果解析候选基因的生物学功能
- 渔业资源保护应用: 为奇努克鲑鱼资源保护与可持续利用提供基因组学依据
