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标签: 泛基因组

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  • 马氏菌属全基因组研究_库珀博士论文第四章的补充材料

    2026年1月31日 30 167 57

    数据集概述 本数据集为华盛顿大学海洋学院Zachary S. Cooper博士论文第4章的补充材料,包含Marinobacter属细菌泛基因组分析的主数据表格与补充数据表格,涉及基因组特征、基因功能注释、进化分析等核心内容,用于揭示该属菌株在冰间湖卤水极端环境中的进化分化与功能潜力。 文件详解 文件名称:mbpan_Table_1.xlsx...
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  • Setaria_pan_genome_谷子泛基因组研究表型数据

    2026年1月28日 30 74 25

    数据集概述 本数据集包含用于谷子全基因组关联分析(GWAS)和基因组选择(GS)研究的226个表型数据,可用于基因鉴定、标记辅助育种、基因组选择及基因组编辑,以加速不同气候条件下的作物改良。数据集仅含一个文件。 文件详解 表型数据文件 文件名称:Phenotypes_226.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Golden_Delicious_Apple_T2T参考基因组与泛基因组数据

    2026年1月20日 30 127 88

    数据集概述 本数据集包含‘Golden Delicious’苹果的两个单倍型T2T(端粒到端粒)参考基因组及其注释文件,通过泛基因组分析揭示苹果驯化过程中抗病基因类似物的扩展情况,为苹果基因组学研究提供完整参考数据。 文件详解 文件名称:Golden Delicious genome.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含‘Golden...
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  • Citrus_Genetic_Basis_柑橘杂交驯化细胞质核冲突研究数据集

    2026年1月20日 30 88 56

    数据集概述 本数据集围绕柑橘杂交、驯化及多样化过程中的细胞质核冲突遗传基础展开,包含184份样本的叶绿体、线粒体及核基因组变异图谱,线粒体异质性分析序列,基因表达归一化数据,GWAS分析文件,基因注释结果及基因组组装文件等,共14个文件,为柑橘细胞质核互作机制研究提供全面数据支撑。 文件详解 基因组变异图谱类...
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  • Candida_albicans_Based_白色念珠菌泛基因组研究补充数据

    2026年1月20日 30 169 124

    数据集概述 本数据集为白色念珠菌泛基因组研究的补充数据,包含五个补充图表和两个补充表格,涉及测序数据质量评估、基因组组装质量、基因数量与长度分布、直系同源群分类及功能注释等内容,支持对白色念珠菌基因组多样性及功能特征的分析。 文件详解 补充图表文件 文件名称:Supplementary Figures S1-S5.docx 文件格式:DOCX...
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  • Pseudomonas_Based_六氯环己烷污染场地假单胞菌泛基因组动态分析数据

    2026年1月18日 30 111 9

    数据集概述 本数据集围绕六氯环己烷(HCH)污染场地富集的假单胞菌基因库展开,包含菌株RL的基因组测序数据及17个参考生态型的比较分析结果,结合污染场地宏基因组数据,探究假单胞菌泛基因组动态、代谢通路差异及水平基因转移机制,共含3个相关文件。 文件详解 系统发育树文件...
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  • Chlamydiales_Based_衣原体目泛基因组结构稳定性与功能一致性研究数据

    2026年1月18日 30 67 50

    数据集概述 本数据集包含对衣原体目37个公开基因组序列的比较分析结果,揭示其泛基因组的结构特征与进化历史。数据涵盖2000余个蛋白家族,包括核心基因、外周基因及小家族,可用于研究该类群的结构稳定性与功能一致性,还发现了两个新蛋白序列域。 文件详解 文件名称:Supplement.zip 文件格式:ZIP...
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  • Pan_genomic_Alfalfa_Based泛基因组分析农艺性状关联基因数据

    2026年1月15日 30 138 93

    数据集概述 本数据集来自苜蓿泛基因组分析研究,核心文件为Phenotypes.xlsx,聚焦与农艺性状关联的基因信息,旨在为苜蓿基因组学辅助育种提供数据支持。数据集未包含描述性文档或内容预览,仅提供一个Excel格式的表型数据文件。 文件详解 文件名称:Phenotypes.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Arcobacter_butzleri_Genomic_Diversity_Analysis_Data

    2026年1月3日 30 146 70

    数据集概述 本数据集包含对49株Arcobacter butzleri基因组的分析结果,涵盖基因组组装与注释、核心及泛基因组位点数据。数据支持研究该新兴人类病原体的毒力、抗生素耐药性可塑性及基因组多样性,包含组装序列、转录本序列、氨基酸序列、核心基因座比对、特定基因比对、PorA高变区分类序列及泛基因组等位基因谱矩阵等8个文件。 文件详解...
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  • SV_datas_ACB_Pangenome_and_Structure_variant_基因组学分析数据

    2025年12月31日 30 78 72

    数据集概述 本数据集包含ACB泛基因组与结构变异相关的压缩文件,文件总数为一个,无目录层级结构。数据集未区分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理数据,主要文件类型为压缩包,占比百分之百。 文件详解 文件名称:SV-data.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:未提供README或内容预览,具体字段信息需解压后查看 适用场景 基因组学研究:...
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  • 托比_巴里尔_Toby_Baril_基于小麦真菌病原体Zymoseptoria_tritici的泛基因组资源压缩包_zip文件

    2025年12月27日 30 62 21

    数据集概述 本数据集是小麦真菌病原体Zymoseptoria tritici的参考级基因组资源集合,包含该病原体的泛基因组相关数据,为研究其基因组特征、进化机制及致病机理提供基础资源支持。 文件详解 文件名称:TobyBaril/Zt_pangenome-v1.0.zip 文件格式:ZIP(压缩包) 字段映射介绍:压缩包内包含Zymoseptoria...
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  • 哥伦比亚热带谱系血红扇头蜱内共生体与病原体宏基因组研究补充材料5

    2025年12月19日 30 9 6

    数据集概述 该数据集为学术研究的补充材料,包含哥伦比亚热带谱系血红扇头蜱内共生体与病原体宏基因组研究中的去重复结果、系统基因组学分析及泛基因组探索数据,支持对蜱虫相关微生物的深入研究。 文件详解 文件名称: oo_939695.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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  • 促进乳腺肿瘤转移的瘤内细菌鉴定支持数据集

    2025年12月19日 30 59 43

    数据集概述 本数据集是Gerbec等人题为《促进乳腺肿瘤转移的瘤内细菌鉴定》的研究论文的支持数据集,包含8个支持数据集及说明各数据集的图例文件,覆盖细菌分类、基因组分析、注释等多维度实验数据。 文件详解 该数据集包含40个文件,覆盖多种格式与研究内容,具体说明如下: - 16S rRNA序列文件(.fa格式): -...
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  • 甲型流感病毒K_mer基高效基因组监测数据库

    2025年12月18日 30 185 51

    数据集概述 本数据集为甲型流感病毒基因组监测设计的K-mer基数据库,包含50个亚型的独特子序列,涵盖18种血凝素(HA)和11种神经氨酸酶(NA)亚型。基于NCBI 2022年5月数据构建,通过泛基因组工具生成亚型特异性及共享序列,支持高效亚型分类。 文件详解...
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  • 法国牛分枝杆菌菌株全基因组测序新遗传知识获取附录

    2025年12月15日 30 192 65

    数据集概述 本数据集为学位论文附录,包含法国牛分枝杆菌菌株全基因组测序研究的5个附件文件,涉及新基因组测序指标、泛基因组分析、插入缺失变异、全基因组单核苷酸多态性分析及基因组比对结果,支持牛分枝杆菌遗传特性研究。 文件详解 Annex...
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  • STEC感染临床结局预测补充数据集

    2025年12月14日 30 166 44

    数据集概述 本数据集为STEC感染临床结局预测相关研究的补充数据,包含测试集分离株结局预测、特征注释、SHAP值、模型超参数调优等多类文件,为分析STEC感染临床结局预测模型提供支持。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件,内部包含多个补充数据集,具体说明如下: - 文件名称: STEC_ML_Supplementary_dataset.zip -...
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  • 化脓性链球菌泛基因组基因必要性评估数据集

    2025年12月13日 30 164 15

    数据集概述 本数据集包含使用Transit工具包对化脓性链球菌转座子测序数据集分析的原始输出文件,涉及九组Tn5-like和Himar1-like转座子数据,涵盖泛基因组关系、必要性、操纵子必要性等多维度分析结果。 文件详解 该数据集包含25个文件,无目录结构,具体说明如下: - 主要数据文件(.tsv格式,16个): -...
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  • 选择性消化道去污染对产超广谱β_内酰胺酶大肠杆菌泛基因组组成影响的补充数据集

    2025年12月12日 30 15 0

    数据集概述 本数据集为“选择性消化道去污染对产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌(ESBL-E. coli)泛基因组组成影响”研究的补充数据,提供研究相关的附加信息,支持对该主题的深入分析。 文件详解 文件名称: Supplementary_Data.zip 文件格式: ZIP(压缩包格式) 内容说明:...
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  • 历史转座子动员波与作物病原菌适应性变异关联研究补充文件集2025

    2025年12月11日 30 36 1

    数据集概述 本数据集为“历史转座子动员波在主要作物病原菌中创造独特适应性变异库”研究的补充文件集,包含转座子多态性检测基准测试、泛基因组组装注释、适应性变异定位等核心研究材料,支持解析病原菌适应性进化机制。 文件详解 README.txt:...
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  • 绵羊副结核分枝杆菌亚种菌株JIII_386全基因组序列与比较分析补充数据集

    2025年12月4日 30 6 5

    数据集概述 本数据集为绵羊副结核分枝杆菌亚种菌株JIII-386(MAP-S/type III)全基因组序列相关研究的补充材料,包含该菌株与其他MAP亚型、副结核分枝杆菌复合体菌株的基因组比较分析结果,涵盖非编码RNA、原噬菌体区域、毒力相关基因等多维度数据。 文件详解 该数据集包含27个文件,具体说明如下: - 核心数据文件(CSV格式,25个):...
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