历史转座子动员波与作物病原菌适应性变异关联研究补充文件集2025

数据集概述

本数据集为“历史转座子动员波在主要作物病原菌中创造独特适应性变异库”研究的补充文件集,包含转座子多态性检测基准测试、泛基因组组装注释、适应性变异定位等核心研究材料,支持解析病原菌适应性进化机制。

文件详解

  • README.txt: 文本文件,说明补充文件集中各文件的内容与用途,包括转座子检测工具基准测试讨论、泛基因组组装注释、TE位点变异数据等。
  • SupplementaryFile1_benchmarkingDiscussion.docx: Word文档,提供McClintock2框架下转座子多态性检测工具的基准测试补充讨论内容。
  • SupplementaryFile2_pangenomeAssemblyAnnotations.tar.gz: 压缩文件,包含小麦病原菌Zymoseptoria tritici的泛基因组组装FASTA文件、FASTA头映射字典及多态性TE注释BED文件。
  • SupplementaryFile3_teLociForGEA.vcf.gz: 压缩VCF文件,用于基因组环境关联分析(GEA)的转座子(TE)位点变异数据。
  • SupplementaryFile4_benchmarkingResults.xlsx: Excel文件,存储转座子检测工具基准测试的结果数据。
  • SupplementaryFile5_sourceData.tar.gz: 压缩文件,包含研究中使用的原始或源数据文件。
  • SupplementaryTables.xlsx: Excel文件,包含研究相关的补充表格数据。
  • SupplementaryFigures.pdf: PDF文件,呈现研究中的补充图表内容。

适用场景

  • 作物病理学研究: 分析小麦病原菌Zymoseptoria tritici的基因组变异与适应性进化机制。
  • 转座子进化研究: 探究转座子动员波对病原菌基因组多样性及适应性变异的影响。
  • 分子生物学研究: 解析转座子介导的病原菌抗药性及宿主环境适应的分子机制。
  • 生物信息学方法验证: 评估McClintock2等工具在转座子多态性检测中的性能。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 634.81 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。