数据集概述
本数据集为白色念珠菌泛基因组研究的补充数据,包含五个补充图表和两个补充表格,涉及测序数据质量评估、基因组组装质量、基因数量与长度分布、直系同源群分类及功能注释等内容,支持对白色念珠菌基因组多样性及功能特征的分析。
文件详解
- 补充图表文件
- 文件名称:Supplementary Figures S1-S5.docx
- 文件格式:DOCX
- 内容介绍:包含五个图表,S1展示原始与过滤后测序数据的碱基质量得分,S2展示十四株白色念珠菌基因组组装的contig数量分布,S3展示各样本基因数量及长度分布,S4展示直系同源群的核心/附属/单拷贝分类及在各基因组中的分布,S5展示高频Pfam结构域及物种直系同源分配情况
- 补充表格文件1
- 文件名称:Supplementary Table 1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容介绍:OrthoFinder直系同源分析结果,为直系同源群在各基因组(GCA编号)中的存在/缺失表,0表示缺失,1表示存在
- 补充表格文件2
- 文件名称:Supplementary Table 2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容介绍:Funannotate功能注释结果,记录每个基因及其分配的功能类别(如有)
适用场景
- 真菌基因组学研究:分析白色念珠菌基因组的结构多样性与基因组成特征
- 泛基因组分析:基于直系同源群分类研究白色念珠菌的核心基因与附属基因分布
- 功能基因组学:通过Pfam结构域及功能注释结果探究白色念珠菌的功能基因特征
- 测序数据质量评估:参考原始与过滤后测序数据的碱基质量得分,优化测序数据处理流程
- 基因组组装质量分析:利用contig数量分布评估白色念珠菌基因组组装的完整性与连续性