数据集概述
本数据集包含用于酵母核孔复合体(ScNPC)细胞内结构整合建模的源代码文件、输入文件及输出整合模型。数据支撑《Nature》2020年发表的相关研究,可用于分析ScNPC的细胞内结构特征及周转过程,共包含11个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:说明数据集背景、来源文献及文件组成,为数据使用提供指引。
- 压缩类文件
- 文件名称:software.zip、Nup116delta25C.zip、P_complex_neg_stain_fitting.zip、Nup116delta37C.zip、IR_asymmetric_unit_refinement.zip、Nup116delta25C_ScNPC_model.zip、Nup116delta37C_ScNPC_model.zip、wtScNPC_model.zip等10个压缩文件
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含源代码、输入数据及不同条件下的ScNPC整合模型文件,涵盖野生型及Nup116缺失突变体的结构模型、负染色拟合数据等内容。
数据来源
论文“In-cell architecture of the nuclear pore and snapshots of its turnover”(Nature, 2020)
适用场景
- 细胞生物学研究:分析酵母核孔复合体的细胞内三维结构及组成特征。
- 生物大分子建模:验证和优化核孔复合体结构整合建模的算法与流程。
- 突变体结构分析:对比野生型与Nup116缺失突变体的核孔复合体结构差异。
- 结构生物学数据复现:基于提供的源代码和输入文件,复现研究中的结构建模结果。
- 核孔复合体周转机制研究:结合模型数据探索核孔复合体的动态周转过程。