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标签: CHARMM36m

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  • GROMACS_CHARMM36m_Aβ肽与Cu_II_复合物水_二氯乙烷界面分子动力学模拟数据

    2026年1月9日 30 41 32

    数据集概述 本数据集包含三种系统的分子动力学模拟输入、参数及轨迹文件：Aβ₁₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆–Cu(II)复合物在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）。模拟基于GROMACS 2020.6与CHARMM36m力场，含TB⁻、BA+等有机离子参数，pH...
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  • 晶体中功能性蛋白质动力学手稿数据集

    2025年12月18日 30 97 90

    数据集概述 本数据集为手稿《晶体中功能性蛋白质动力学》的配套数据，包含分子动力学（MD）模拟数据及手稿主文本图表的基础数据，基于PDZ结构域晶体结构（PDB ID：5E11）构建多种模拟系统，使用三种力场进行模拟，支持蛋白质动力学相关研究。 文件详解 核心文件： data.zip：压缩文件，包含两个子目录 md_data目录：含基于PDZ结构域（PDB...
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