数据集概述
本数据集为手稿《晶体中功能性蛋白质动力学》的配套数据，包含分子动力学（MD）模拟数据及手稿主文本图表的基础数据，基于PDZ结构域晶体结构（PDB ID：5E11）构建多种模拟系统，使用三种力场进行模拟，支持蛋白质动力学相关研究。
文件详解
- 核心文件：
- data.zip：压缩文件，包含两个子目录
- md_data目录：含基于PDZ结构域（PDB ID：5E11）构建的多种模拟系统数据，使用Amber ff14SB、CHARMM36m、Amber ff94三种力场，提供初始和最终构象
- fig_data目录：含手稿主文本图1至图5的基础数据集
- README.TXT：文本文件，说明数据集为手稿《晶体中功能性蛋白质动力学》的配套数据，介绍archive内md_data和fig_data两个目录的内容
- 1uc.png：图片文件，具体内容未详细说明
适用场景
- 蛋白质结构与功能研究：分析晶体环境中蛋白质动力学特征
- 分子动力学模拟验证：对比不同力场（Amber ff14SB、CHARMM36m等）下的模拟结果
- 生物物理机制探究：研究配体结合对蛋白质动力学的影响
- 学术论文复现：支持手稿《晶体中功能性蛋白质动力学》研究结果的复现与验证
