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  • DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_1Mol_Based_磷脂双分子层动力学模拟完整数据

    2025年12月21日 30 176 89

    数据集概述 该数据集包含1摩尔浓度氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件，采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟条件为323K，含72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对钠氯离，轨迹时长120纳秒，分析最后60纳秒数据。 文件详解 模拟参数与配置文件： md.mdp：模拟参数文件，记录模拟条件设置...
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  • 二价阳离子与磷脂酰肌醇结合诱导双层膜纳米簇起始的离子特异性数据集

    2025年12月19日 30 106 37

    数据集概述 本数据集包含基于全原子分子动力学模拟的研究数据，核心探究二价阳离子（如钙、镁）与磷脂酰肌醇（如PI(4,5)P2、PI(3,5)P2）的相互作用机制，以及其对双层膜纳米簇起始的离子和异构体特异性影响，为膜信号复合物形成的分子机制研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含16个文件，涵盖模拟输入、结构、输出及说明文档，具体如下： -...
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  • 轴突膜粗粒化模型数据集

    2025年12月15日 30 116 50

    数据集概述 本数据集提供了轴突膜的粗粒化（CG）模型相关文件，支持分子动力学模拟研究。模型基于MARTINI 2.2力场构建，包含平衡态轴突膜结构、拓扑文件、参数示例及说明文档，为轴突膜力学特性与破裂机制分析提供数据基础。 文件详解 文件名称及格式： axolemma.gro：GROMACS坐标格式文件，存储平衡态轴突膜的结构数据...
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  • DPPC_Berger_OPLS06_Based_盐环境下DPPC双层膜分子动力学完整数据

    2025年12月14日 30 174 92

    数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件，采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟时长120纳秒，分析了最后60纳秒的数据，为研究DPPC膜在盐环境中的结构与动力学提供支持。 文件详解 模拟配置与力场文件：...
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