轴突膜粗粒化模型数据集

数据集概述

本数据集提供了轴突膜的粗粒化(CG)模型相关文件,支持分子动力学模拟研究。模型基于MARTINI 2.2力场构建,包含平衡态轴突膜结构、拓扑文件、参数示例及说明文档,为轴突膜力学特性与破裂机制分析提供数据基础。

文件详解

  • 文件名称及格式:
  • axolemma.gro:GROMACS坐标格式文件,存储平衡态轴突膜的结构数据
  • topol.top:拓扑文件,定义MARTINI 2.2力场下的分子拓扑结构
  • top.zip:压缩文件,包含补充拓扑相关文件
  • relax.mdp:GROMACS参数文件示例,用于模拟设置
  • README.docx:Word文档,提供模型背景及使用说明

适用场景

  • 生物物理学研究:分析轴突膜的力学刚度与破裂机制
  • 分子动力学模拟:基于MARTINI力场开展轴突膜相关模拟实验
  • 神经科学研究:探究轴突膜结构特性对神经功能的影响
  • 计算生物学教学:作为粗粒化模型构建与模拟的实践案例
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 19.54 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
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