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标签: MD模拟

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  • FicD的TPR结构域功能动力学与ATP和BiP相互作用数据集

    2025年12月23日 30 166 74

    数据集概述 本数据集包含FicD的TPR结构域功能动力学研究相关的分子动力学（MD）模拟数据，核心围绕其与ATP和BiP相互作用的调控机制，为蛋白质结构功能分析提供数据支持。 文件详解 文件名称: FicD-MD-Data.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 文件内容:...
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  • RXR_RAR基因调控的分子动力学与随机建模整合数据集

    2025年12月21日 30 121 47

    数据集概述 该数据集围绕RXR-RAR核受体系统的基因调控机制展开，整合原子分子动力学（MD）模拟与随机建模方法，探究配体诱导的变构通讯、受体动力学及DNA识别，揭示分子尺度互作与长时程调控动态的关联。 文件详解 文件名称: data_naresh.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明: 压缩包内包含支持RXR-...
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  • 晶体中功能性蛋白质动力学手稿数据集

    2025年12月18日 30 185 14

    数据集概述 本数据集为手稿《晶体中功能性蛋白质动力学》的配套数据，包含分子动力学（MD）模拟数据及手稿主文本图表的基础数据，基于PDZ结构域晶体结构（PDB ID：5E11）构建多种模拟系统，使用三种力场进行模拟，支持蛋白质动力学相关研究。 文件详解 核心文件： data.zip：压缩文件，包含两个子目录 md_data目录：含基于PDZ结构域（PDB...
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  • 白细胞介素17受体A_泛素连接酶TRAF3IP2信号枢纽多尺度计算研究数据集

    2025年12月18日 30 27 3

    数据集概述 该数据集包含针对白细胞介素17受体A（IL-17RA）与泛素连接酶TRAF3IP2信号枢纽的多尺度计算研究资料，涵盖分子对接、分子动力学模拟、口袋分析及结合亲和力分析等完整工作流程的输入文件与结果数据，为自身免疫及抗炎治疗靶点研究提供结构动力学与热点区域的计算支持。 文件详解 Dock.zip:...
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  • 数据5_HT1AR受体与不同拮抗剂结合机制研究数据集

    2025年12月15日 30 57 36

    数据集概述 本数据集包含5-HT1AR受体与Lecozotan、NAD299等七种拮抗剂结合的分子动力学（MD）模拟输入文件及参数文件，为研究受体与拮抗剂结合机制提供原始数据支持。 文件详解 文件列表：共7个ZIP格式压缩文件，分别对应不同模拟系统 SDZ216-525.zip：SDZ216-525拮抗剂系统的MD模拟输入及参数文件...
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  • 约束测试文件数据集

    2025年12月9日 0 77 18

    数据集概述 本数据集包含约束回归测试相关的文件，主要由行业基准系统和T4溶菌酶轨迹两部分组成，为约束测试的验证与分析提供数据支持。 文件详解 该数据集包含两个压缩文件，具体说明如下： - industry_benchmark_systems.zip:...
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  • MD模拟与AFM图像文件数据集

    2025年12月9日 30 68 16

    数据集概述 本数据集包含两类核心内容：一类是通过GROMACS 4.7.0进行的分子动力学（MD）模拟数据，研究不同单价（Na+、K+）和二价（Mg2+、Ca2+、Sr2+）阳离子与Drew-Dickerson B-DNA十二聚体的相互作用；另一类是通过JPK Nanowizard ULTRA...
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