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标签: OBO Foundry

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  • IJXD_Based生物信息学跨源标识符交叉引用数据库

    2026年1月30日 30 91 87

    数据集概述 本数据集为Inspector Javert's Xref Database（简称IJXD），是由PyOBO从OBO Foundry等来源提取的生物信息学交叉引用数据库。包含标准化的五列交叉引用数据，可实现不同来源标识符的整合与遍历，共6个文件，支持生物信息学中跨数据库标识符映射分析。 文件详解 核心数据文件（xrefs.tsv.gz）...
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  • Ooh_Na_Na_OBO_Foundry替代标识符提取数据

    2026年1月29日 30 99 18

    数据集概述 本数据集为从OBO Foundry提取的替代标识符集合，包含前缀、主标识符和替代标识符三类信息，以TSV格式存储。数据集由pyobo工具生成，包含元数据、样本、摘要及压缩数据文件，可用于生物信息学领域的标识符映射与标准化研究。 文件详解 数据文件 文件名称：alts.tsv.gz 文件格式：gz压缩TSV...
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  • PKT_Human_Disease_KG_Benchmark_Builds

    2026年1月21日 30 187 23

    数据集概述 本数据集为PheKnowLator（PKT）人类疾病知识图谱（PKT-KG）的基准构建版本，旨在建模人类疾病机制，涵盖中心法则及分子、细胞、组织、器官等多生物尺度。基于12个OBO Foundry本体、31个关联开放数据集和两项大规模实验结果构建，包含18种节点类型和33种边类型，通过调整知识模型、关系策略等参数生成12种不同基准图谱。...
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  • OBO_Foundry_Snapshot_本体词汇分析数据集_20220316

    2026年1月19日 30 109 14

    数据集概述 本数据集为2022年3月16日的OBO Foundry本体快照，用于OBO Foundry本体的词汇分析。包含3个文件，无目录层级，主要文件类型为ZIP压缩包和TSV表格，记录本体版本、候选本体及成员本体信息。 文件详解 candidate_ontologies.zip 文件格式：ZIP 内容说明：候选本体压缩包，包含OBO...
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  • OMOP2OBO_Source_OMOP标准测量概念到OBO本体映射数据V1_0

    2026年1月15日 30 196 101

    数据集概述 本数据集为OMOP2OBO Measurement Mappings V1.0版本，包含OMOP标准测量概念（基于LOINC）与人类表型本体（HPO）、生物相关化学实体（CheBI）等7种OBO本体的映射关系。映射覆盖测试结果的所有参考范围水平，采用自动（含TF-...
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  • Ooh_Na_Na_Relations_Based_OBO_Foundry本体关系抽取数据

    2026年1月13日 30 4 0

    数据集概述 本数据集包含从OBO Foundry、OLS等来源的本体中抽取的关系数据，原始内容采用CC0许可，衍生内容遵循原始来源许可。数据集共5个文件，涵盖本体关系的元数据、详细摘要、摘要、完整数据压缩包及样本数据，可用于语义网络关系分析。 文件详解 文件名称：relations_metadata.json 文件格式：JSON...
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