数据集概述
本数据集为从OBO Foundry提取的替代标识符集合，包含前缀、主标识符和替代标识符三类信息，以TSV格式存储。数据集由pyobo工具生成，包含元数据、样本、摘要及压缩数据文件，可用于生物信息学领域的标识符映射与标准化研究。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称：alts.tsv.gz
- 文件格式：gz压缩TSV
- 字段映射介绍：包含三列核心数据，分别为prefixes（前缀）、primary identifiers（主标识符）、alt identifiers（替代标识符）
- 文件名称：alts_sample.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含三列数据，分别为prefix（前缀）、identifier（主标识符）、alt（替代标识符），示例数据包含aeo等前缀的标识符映射
- 文件名称：alts_summary.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含各前缀对应的标识符数量统计，如ncbitaxon、zfin、chebi等
- 元数据文件
- 文件名称：alts_metadata.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含version（版本）、git_hash（Git哈希值）、date（日期）、count（计数）四个字段
数据来源
由pyobo工具从OBO Foundry提取生成
适用场景
- 生物信息学标识符映射: 用于不同数据库或本体之间的标识符匹配与转换
- 生物数据标准化: 支持生物医学数据的统一标识和整合分析
- 本体数据管理: 辅助OBO Foundry本体资源的维护与更新
- 生物信息工具开发: 为生物信息学软件提供标识符映射的基础数据支持
