数据集概述
本数据集为PheKnowLator（PKT）人类疾病知识图谱（PKT-KG）的基准构建版本，旨在建模人类疾病机制，涵盖中心法则及分子、细胞、组织、器官等多生物尺度。基于12个OBO Foundry本体、31个关联开放数据集和两项大规模实验结果构建，包含18种节点类型和33种边类型，通过调整知识模型、关系策略等参数生成12种不同基准图谱。
文件详解
- 文件名称：
PheKnowLator_HumanDiseaseKG_Output_FileInformation.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：未明确提供具体字段，推测包含知识图谱基准构建的版本信息（如v2.0.0、v2.1.0等）、知识模型类型（类/实例型）、关系策略（标准/逆关系）、语义抽象方式（OWL/OWL-NETS）及对应构建的时间节点（如2020年5月、2021年1月等）相关信息。
适用场景
- 疾病机制研究：通过多生物尺度知识图谱分析人类疾病的分子、细胞等层面机制。
- 知识图谱建模优化：评估不同知识模型、关系策略对疾病知识图谱构建的影响。
- 生物医学数据整合：整合OBO本体与开放数据集，支持跨源生物医学信息关联分析。
- 下游任务性能评估：为知识图谱下游任务（如链接预测、节点分类）提供基准测试数据。
