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Enhanced_Mapping_Based_小分子细胞结合位点对接数据
2026年1月22日 30 32 0
数据集概述 本数据集为Wozniak等人手稿中的精选对接构象数据，包含小分子在细胞内结合位点的映射信息，文件以结构ID（PDBID或AlphaFold模型）与探针ID组合命名，共1个压缩文件，可用于药物研发相关的小分子结合位点分析。 文件详解 文件名称：Wozniak_et_al_selected_docking_poses_v2.zip...
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数据2019_nCoV_ADE_Based感染抗体依赖性增强预防研究补充数据
2026年1月20日 30 48 39
数据集概述 本数据集为2019-nCoV感染抗体依赖性增强（ADE）研究的补充数据，包含病毒结构模型文件、序列文件、结构比对文件及说明文档等，涉及2019-nCoV与SARS的S蛋白结构、RBD区域序列等关键信息，用于支持新型冠状病毒感染机制及预防策略相关研究，共包含10个文件。 文件详解 结构模型文件（.pse、.pdb格式）...
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Drug_target_residence_time_Based药物研发数据
2026年1月20日 30 106 84
数据集概述 本数据集包含药物靶点停留时间及相关结合动力学系数、配体基础性质（如SMILES或InChI字符串），以及PubMed参考文献信息。数据集分为Excel文件和压缩包文件，总计2个文件，可通过分子可视化系统或文本编辑器打开。 文件详解 文件名称：residence_time_data.xlsx 文件格式：XLSX...
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Propeptides_Supplemental_蛋白生产研究前肽加工与生产促进补充数据
2026年1月13日 30 154 21
数据集概述 本数据集为论文《Propeptides: From Processing to Promotion of Protein Production》的补充数据，包含三十个文件，涵盖基因序列、蛋白质结构模型、实验视频及引物信息，主要涉及前肽（Propeptides）对蛋白生产的影响研究，支持蛋白质工程领域相关分析。 文件详解...
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OCE_Supplementary_Material_真菌孤儿候选效应因子结构与进化研究数据
2026年1月12日 30 87 1
数据集概述 本数据集为论文“Surface frustration re-patterning underlies the structural landscape and evolvability of fungal orphan candidate...
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大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣功能研究数据集
2025年12月13日 30 17 1
数据集概述 本数据集包含支持大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣（NAC）活性研究的原始和处理数据，通过微量热泳动（MST）、NAC活性测定、RNA三维结构建模及蛋白-RNA复合物对接等方法获取，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
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约束测试文件数据集
2025年12月9日 30 200 65
数据集概述 本数据集包含约束回归测试相关的文件，主要由行业基准系统和T4溶菌酶轨迹两部分组成，为约束测试的验证与分析提供数据支持。 文件详解 该数据集包含两个压缩文件，具体说明如下： - industry_benchmark_systems.zip:...
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C21ORF2与NEK1疾病突变域相互作用ColabFold建模原始输出数据集
2025年12月23日 30 204 89
数据集概述 本数据集为论文配套的ColabFold建模原始输出，核心内容是C21ORF2蛋白与NEK1疾病突变域相互作用的结构预测结果，包含蛋白质结构模型文件、评估图表及相互作用残基列表，为研究两者功能关联提供结构数据支持。 文件详解 蛋白质结构模型文件（共5个，PDB格式）：...
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RNA_Benchmark_Based_RNA基准数据集完整数据
2025年12月23日 30 50 18
数据集概述 本数据集为RNA相关基准数据，包含预测、CT等关键词相关内容，由六个压缩文件组成，覆盖序列、结构、多序列比对及预测结果等数据类型，为RNA研究提供基础数据支持。 文件详解 压缩文件集（共6个，均为.zip格式）： fasta.zip：可能包含RNA序列相关的FASTA格式文件...
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UBTR012574化学系列扩展数据集II
2025年12月22日 30 208 96
数据集概述 该数据集围绕UBTR012574化学系列的扩展展开，包含针对USP5锌指泛素结合域（ZnF-UBD）的分子对接模拟数据，用于优先化合物合成的研究。 文件详解 UBTR012574.pdb：PDB格式文件，可能为UBTR012574的分子结构数据...
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肉毒杆菌神经毒素潜在解毒剂计算机辅助筛选数据集
2025年12月19日 30 34 9
数据集概述 本数据集为基于计算机辅助筛选的肉毒杆菌神经毒素潜在解毒剂研究数据，包含三十五种源自NSC1012结构的配体与A、B、E、F型肉毒杆菌神经毒素催化域的分子对接结果，以及药物代谢动力学（ADME）性质分析数据，为开发肉毒中毒解毒剂提供候选化合物基础。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 分子结构与对接结果文件： -...
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木瓜蛋白酶晶体与天然产物配体混合物浸泡的补充单晶X射线衍射结构数据集
2025年12月19日 30 126 112
数据集概述 本数据集包含木瓜蛋白酶晶体与天然产物配体混合物（主要为环氧基半胱氨酸蛋白酶抑制剂E-64类似物）浸泡后的单晶X射线衍射结构，提供结构坐标、结构因子及初步验证报告，因配体密度不足未存入PDB，现作为补充数据公开。 文件详解 文件名称：papain_cocktails_XRD_no-dep_FigS12.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制分子动力学模拟数据集
2025年12月19日 30 186 163
数据集概述 本数据集包含鱼藤酮与呼吸复合体I结合机制研究的分子动力学模拟快照及力场拓扑文件。核心内容为模拟得到的三种结合模式（ROT1、pre-redox、ROT2）的蛋白质-配体结构，以及GROMACS格式的鱼藤酮及其衍生物的力场参数文件，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 分子模拟快照文件（位于configurations/目录下）:...
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数据47G4_Hu19_scFv与VL_VL二聚体的Alphafold2模型数据集
2025年12月14日 30 74 50
数据集概述 本数据集包含47G4（Hu19）单链抗体片段（scFv）二聚体及VL-VL二聚体的Alphafold2预测模型，展示了scFv二聚体的VH-VL结构互换特征，为抗体结构分析提供数据支持。 文件详解 47G4（Hu19）scFv二聚体模型文件：...
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数据16LiF16HF_Based_量子化学分子数据完整分析数据集
2025年12月5日 30 180 106
数据集概述 该数据集包含与16LiF16HF相关的9个文件，涵盖图像、分子结构、脚本、日志等多种类型，无目录结构，文件类型分布均衡，未提供内容预览。 文件详解...
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人参皂苷F1生产相关多功能糖苷酶分子模拟数据集
2025年12月16日 30 141 137
数据集概述 该数据集包含人参皂苷F1生产相关的分子对接及动力学模拟数据，针对野生型β-葡萄糖苷酶BgDU及其DUase突变体与底物NG-R1、G-Rg1的结合动态及构象变化，开展了四组独立模拟研究，为糖苷酶结构工程改造提供数据支持。 文件详解 数据集包含四个核心文件夹，具体说明如下： - Docking Structure文件夹： -...
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KRAS高变区分子动力学研究数据与模拟文件
2025年12月14日 30 91 18
数据集概述 该数据集包含KRAS高变区（HVR）分子动力学（MD）研究的关键模拟输入文件、处理后的轨迹及分析脚本，围绕KRAS膜结合调控及下游效应子相互作用展开，支持研究的可重复性与透明度。 文件详解 文件名称：kras_md_zenodo.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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真菌NUDIX酶多样性分析数据集
2025年12月14日 30 37 0
数据集概述 本数据集涵盖真菌NUDIX酶多样性分析的原始数据，包含补充文件（如真菌组装列表、蛋白ID、基序保守性等）和多个文件夹（分子对接结果、结构文件、序列比对、系统发育树），为研究真菌NUDIX酶的多样性与功能提供支持。 文件详解 补充文件: Supplementary_File_S1.xlsx:...
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DMPC和DMTAP脂质及其混合物的构型与参数数据集
2025年12月13日 30 174 20
数据集概述 本数据集包含在五十摄氏度下，阳离子型（电荷：正一）DMTAP脂质、DMPC脂质、水及中和离子（必要时）组成的不同系统的构型与参数，覆盖纯DMPC及六种DMTAP比例的混合体系。 文件详解 脂质构型文件（PDB格式）：共十一个，对应不同DMTAP比例的脂质系统，包含脂质、水和中和离子的原子坐标...
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ALK2_ACVR1与M4K2117共结晶结构数据集_PDB_6SRH
2025年12月12日 30 78 30
数据集概述 该数据集包含ALK2（ACVR1）与化合物M4K2117共结晶的结构数据，已在PDB数据库以代码6SRH存档。数据涵盖结晶结构相关的多种文件类型，为研究该蛋白与化合物的相互作用提供支持。 文件详解 结构与序列文件： M4K2117_refine_12.cif：CIF格式，可能包含经精修的晶体结构信息...
