XK_VPS13A_Based膜蛋白相互作用结构预测数据

数据集概述

本数据集包含脂质 scramblase XK与脂质转移蛋白VPS13A在质膜上相互作用的相关文件，涉及Alphafold预测的VPS13A蛋白结构、XK与VPS13A C端的多聚体相互作用预测，以及图表对应的表格数据，支持相关预印本和出版物的研究验证。

文件详解

• 蛋白结构预测文件（.pdb格式，共3个）
• 文件名称：ATG2-C_PH+XK.pdb、VPS13A_cterm.pdb、VPS13A_Nterm.pdb
• 字段映射介绍：存储蛋白质三维结构数据，包含原子坐标、氨基酸残基序列等结构信息
• 表格数据文件
• 文件名称：TabularData_Graphs.xlsx
• 文件格式：XLSX
• 字段映射介绍：包含图1G、S2E和4D对应的表格数据，支持图表的数值验证与复用
• 结构可视化文件
• 文件名称：VPS13A_FigS1.pse
• 文件格式：PSE
• 字段映射介绍：Pymol结构比对文件，存储VPS13A不同预测部分的结构对齐场景

数据来源

预印本（https://doi.org/10.1101/2022.03.30.486314）和出版物（https://doi.org/10.1073/pnas.2205425119）

适用场景

• 膜蛋白相互作用机制研究：分析XK与VPS13A在质膜上的结合模式及结构基础
• 蛋白质结构预测验证：对比Alphafold预测结构与实验数据的一致性
• 生物医学图表复现：利用表格数据重现研究中的关键实验图表
• 脂质转运蛋白功能分析：探究VPS13A蛋白N端与C端的结构特征及功能关联