数据集概述
本数据集为论文《Propeptides: From Processing to Promotion of Protein Production》的补充数据,包含三十个文件,涵盖基因序列、蛋白质结构模型、实验视频及引物信息,主要涉及前肽(Propeptides)对蛋白生产的影响研究,支持蛋白质工程领域相关分析。
文件详解
- 基因序列文件(.gbk格式,共15个)
- 文件名称示例:pHB201.gbk、pHB201_wprA_PhoA1.gbk、pHB201_vpr_PhoA1.gbk等
- 字段映射介绍:存储基因克隆载体(如pHB201系列)的核苷酸序列信息,包含不同前肽(wprA、vpr等)与PhoA融合基因的构建细节
- 蛋白质结构模型文件(.pdb格式,共7个)
- 文件名称示例:SPProvprPhoA_7b012_unrelaxed_rank_1_model_3.pdb、SPProlipAPhoA_acaf8_unrelaxed_rank_1_model_1.pdb等
- 字段映射介绍:记录前肽-PhoA融合蛋白的三维结构模型数据,包含模型排名、结构预测参数等信息
- 实验视频文件(.mp4格式,共7个)
- 文件名称示例:SPPROWPRAPHOA.mp4、SPBPRPHOA.mp4、SPVPRPHOA.mp4等
- 内容说明:可能为蛋白质表达或加工过程的实验记录视频
- 引物信息文件(.xlsx格式,共1个)
- 文件名称:Primers.xlsx
- 内容说明:存储实验所用引物的序列及相关信息
数据来源
论文《Propeptides: From Processing to Promotion of Protein Production》
适用场景
- 蛋白质工程研究:分析前肽对目标蛋白(如PhoA)生产效率的促进机制
- 基因工程载体设计:基于.gbk文件优化含前肽的融合基因克隆载体构建
- 蛋白质结构功能分析:利用.pdb文件研究前肽与目标蛋白的相互作用及结构影响
- 分子生物学实验设计:参考Primers.xlsx的引物信息开展相关基因克隆实验
- 蛋白质表达过程可视化:通过.mp4视频辅助理解前肽介导的蛋白加工过程