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GenePT_Gene_Embeddings_Based_基因与细胞基础模型完整嵌入数据
2025年12月11日 30 2 1
数据集概述 该数据集包含人类基因的NCBI及UniProt（如适用）摘要文本，以及基于这些摘要通过OpenAI的text-embedding-ada-002和text-embedding-3-large模型生成的基因嵌入数据，为基因与细胞基础模型GenePT提供支持。 文件详解 文件名称: NCBI_summary_of_genes.json...
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BenchStab蛋白稳定性突变预测比较数据集
2025年12月9日 30 180 146
数据集概述 本数据集为BenchStab工具配套数据，用于独立评估18种基于结构和4种基于序列的蛋白稳定性突变预测工具。数据来自FireProtDB的单点突变实验ΔΔG值，经UniRef50和SCOP聚类去重后得到289条记录，包含36种蛋白，其中约百分之二十八为稳定突变。 文件详解 文件名称: dataset.csv 文件格式: CSV 字段映射:...
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深海微生物群落结构与代谢季节性变化原位采样数据集
2025年12月8日 30 189 70
数据集概述 该数据集用于研究深海活性微生物群落结构与代谢的季节性变化，包含两个版本。版本一提供宏基因组组装基因组（MAGs）的氨基酸序列及KEGG数据库注释；版本二含定制代谢标记基因数据库压缩包及对应注释表，为深海微生物功能研究提供数据支持。 文件详解 版本一文件（未提供具体文件名）： .faa格式文件：存储各MAG的氨基酸序列...
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Combat_TB_NeoDB结核研究整合分析数据库
2025年12月8日 30 11 4
数据集概述 该数据集是基于图数据库技术构建的结核研究整合知识库，整合了结核分枝杆菌组学数据及相关生物资源数据，支持复杂联合查询，为结核研究提供开放数据支持。 文件详解 文件名称: uniprot_data.zip，文件格式: ZIP，包含UniProt相关数据的压缩文件 文件名称: neodb-db-data.tar.bz2，文件格式:...
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肝脂肪变性与脂肪性肝炎性别差异转录组功能元分析数据集
2025年12月8日 30 140 103
数据集概述 本数据集为《肝脂肪变性与脂肪性肝炎：转录组研究中性别差异的功能元分析》论文的结果与补充材料，包含7项转录组研究的表达矩阵、差异基因/通路分析结果、功能富集分析及元分析显著结果等，支持性别差异相关机制研究。 文件详解 该数据集包含8个压缩文件，具体说明如下： - 01_MatExp.zip：压缩文件，包含7项选定研究的基因表达矩阵 -...
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人类肠道噬菌体编码抗CRISPR蛋白发现数据集
2025年11月29日 30 47 35
数据集概述 本数据集包含支持人类肠道微生物组中CRISPR-Cas系统与抗CRISPR（Acr）蛋白系统性识别和表征的补充表格。涵盖CRISPR-Cas系统检测、分类、系统发育分析，噬菌体编码Acr预测，Acr候选选择、功能验证及结构分析等核心内容。 文件详解 目录: Discovery of human gut phage-encoded Anti-...
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婴儿利什曼原虫_JPCM5_蛋白编码序列数据集
2025年11月28日 30 127 1
数据集概述 该数据集包含婴儿利什曼原虫（JPCM5株）已注释的8532个蛋白编码基因的编码序列，基因注释结合了转录组学、蛋白质组学研究及文献来源信息，数据以Fasta格式存储。 文件详解 文件名称：LINF_Genes-CDS_24ago24.fasta 文件格式：Fasta (.fasta)...
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儿童急性淋巴细胞白血病药物重定位的蛋白质与配体数据集
2025年11月28日 30 56 2
数据集概述 本数据集包含蛋白质序列和配体数据两部分，用于儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）的药物重定位计算研究。蛋白质序列来自UniProt数据库，配体数据来自ChEMBL、DrugBank及手动补充的FDA批准药物，支持生物信息学、药物发现等领域研究。 文件详解 数据集目录: Protein and Ligand Dataset for Drug...
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Metanetx_UniProt_酶选择工具基础数据包
2025年11月27日 30 203 65
数据集概述 本数据集为运行酶选择工具所需的基础数据文件，基于Metanetx和UniProt数据库构建。数据以压缩包形式提供，包含支持酶催化反应选择的相关信息。在未来的版本更新中，计划采用RetroRules作为新的数据生成来源。数据集仅包含一个压缩文件。 文件详解 数据压缩包 文件名称：data.tar.gz 文件格式：GZ（压缩归档文件）...
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蛋白质摘要测试集-UniProt数据库摘要批量检索数据集-adarshr
2025年6月1日 30 151 102
蛋白质摘要测试集-UniProt数据库摘要批量检索数据集-adarshr 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质,摘要,生物信息学,UniProt,文本挖掘,生物医学,测试集 数据概述：...
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UniProt蛋白质注释数据集-198446条样本-visualcomments
2025年6月1日 30 90 9
UniProt蛋白质注释数据集-198446条样本-visualcomments 数据来源：互联网公开数据 标签：UniProt,蛋白质,注释,生物信息学,基因组学,API数据,学术研究 数据概述： 本数据集包含了使用UniProt...
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蛋白质亚细胞定位与生物信息数据集-CAFA5训练集-lnalinaf
2025年4月22日 30 148 36
蛋白质亚细胞定位与生物信息数据集-CAFA5训练集-lnalinaf 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质,亚细胞定位,生物信息学,UniProt,CAFA5,蛋白质组学,细胞生物学,机器学习,生物数据 数据概述： 本数据集包含CAFA5（Critical Assessment of Function Annotation...
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蛋白质数据库UniProt蛋白质信息查询数据集
2025年4月14日 30 67 50
蛋白质数据库UniProt蛋白质信息查询数据集 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质,UniProt,基因,蛋白质长度,生物信息学,帕金森,Kaggle竞赛,蛋白质组学 数据概述：...
