深海微生物群落结构与代谢季节性变化原位采样数据集

数据集概述

该数据集用于研究深海活性微生物群落结构与代谢的季节性变化,包含两个版本。版本一提供宏基因组组装基因组(MAGs)的氨基酸序列及KEGG数据库注释;版本二含定制代谢标记基因数据库压缩包及对应注释表,为深海微生物功能研究提供数据支持。

文件详解

  • 版本一文件(未提供具体文件名):
  • .faa格式文件:存储各MAG的氨基酸序列
  • .txt格式文件:基于KEGG数据库比对的MAG注释信息
  • 版本二文件:
  • Greening_lab_metabolic_marker_gene_databases.zip:压缩包,含基于Greening Lab数据库构建的代谢标记蛋白序列,补充NCBI和UniProt的amoB、pmoB序列
  • Greendatabase_annotation_table.txt:文本文件,基于上述定制数据库比对的MAG注释信息,字段示例:bin100_1_85(MAG编号)、Malonyl-CoA_reductase_Mcr_sequences_WP_097651709.1(代谢标记蛋白序列)、Candidatus Chloroploca asiatica(物种注释)

适用场景

  • 深海微生物学研究:分析深海微生物群落结构的季节性动态变化
  • 微生物代谢功能分析:探究深海环境中微生物的关键代谢通路与功能标记基因
  • 宏基因组数据注释:为深海微生物宏基因组组装基因组(MAGs)提供功能注释参考
  • 环境微生物数据库构建:支持定制化代谢标记基因数据库的扩展与应用研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 28.54 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。