人类肠道噬菌体编码抗CRISPR蛋白发现数据集

数据集概述

本数据集包含支持人类肠道微生物组中CRISPR-Cas系统与抗CRISPR(Acr)蛋白系统性识别和表征的补充表格。涵盖CRISPR-Cas系统检测、分类、系统发育分析,噬菌体编码Acr预测,Acr候选选择、功能验证及结构分析等核心内容。

文件详解

  • 目录: Discovery of human gut phage-encoded Anti-CRISPR p/
  • 文件名称: Table S1-S7.xlsx
  • 文件格式: Excel (.xlsx)
  • 内容: 包含Class 1和Class 2 CRISPR-Cas系统在UHGG数据库中的检测、分类及系统发育分析数据,涉及Type I、III、II、V、VI等类型
  • 文件名称: Table S9-S14.xlsx
  • 文件格式: Excel (.xlsx)
  • 内容: 包含UHGG与GVD的间隔区-病毒连接数据、Acr候选选择、密码子优化及文库构建信息
  • 文件名称: Table S16-22,S24-S26.xlsx
  • 文件格式: Excel (.xlsx)
  • 内容: 包含针对6种Type II-Cas9系统的Acr功能验证数据、非冗余Acr集及结构分析结果

适用场景

  • 微生物学研究: 分析人类肠道微生物组中CRISPR-Cas系统的分布与多样性
  • 噬菌体-宿主互作研究: 探究噬菌体编码Acr蛋白的作用机制及宿主免疫逃逸策略
  • 基因编辑工具开发: 挖掘新型抗CRISPR蛋白,优化CRISPR-Cas9系统的调控
  • 结构生物学研究: 分析Acr蛋白的结构特征与功能关系
  • 生物信息学分析: 验证宏基因组数据中CRISPR-Cas系统与噬菌体的关联预测方法
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 31.79 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
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