数据集概述
本数据集围绕七鳃鳗(海七鳃鳗和日本七鳃鳗)的ABC转运蛋白基因家族展开全基因组分析,识别出37个ABC转运蛋白基因并分为7个亚家族,探讨其在脊椎动物中的早期进化事件,包括基因的扩张、收缩及保守性特征,为理解脊椎动物基因家族进化提供关键信息。
文件详解
- 文件名称:Phytree-original-data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含七鳃鳗ABC转运蛋白基因家族全基因组分析的原始数据,具体内容未提供预览,推测涵盖基因序列、分类结果、进化分析相关数据等支持研究结论的基础信息。
数据来源
论文“Genome-wide analysis of the ATP-binding cassette (ABC) transporter gene family in sea lamprey and Japanese lamprey”
适用场景
- 脊椎动物基因家族进化研究:分析ABC转运蛋白基因在七鳃鳗与其他脊椎动物中的演化规律,包括扩张、收缩及保守性特征。
- 基因亚家族功能探索:基于七鳃鳗ABC各亚家族的基因分布,研究不同亚家族在生物过程中的功能差异与进化意义。
- 比较基因组学分析:对比七鳃鳗与其他物种(如人、小鼠、斑马鱼)的ABC基因,揭示脊椎动物进化中的基因家族动态变化。
- 免疫相关基因进化研究:探讨ABCB2、ABCB3等基因与有颌类适应性免疫系统出现的关联。