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标签: 基因家族

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  • 担子菌植物细胞壁分解基因家族数据集

    2026年2月15日 30 205 45

    数据集概述 本数据集包含44个担子菌门基因组中与植物细胞壁分解相关的42个基因家族的补充表格、蛋白质序列文件、系统发育分析文件及系统发育树文件。数据用于研究不同营养策略真菌的基因组成差异,揭示其分解机制,共101个文件。 文件详解 补充表格文件...
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  • 被子植物的重组率与基因组进化研究数据

    2026年2月15日 30 19 16

    数据集概述 本数据集围绕被子植物重组率、基因组结构与分子进化的关系展开,包含3个文件,用于研究植物重组率对基因组大小、基因家族演化及分子选择压力的影响。数据支持系统发育比较分析,可揭示重组率在植物基因组宏观进化中的作用。 文件详解 matK_opt.mf.fasta 文件格式:FASTA...
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  • 全基因组范围的番茄和大豆内切β_甘露聚糖酶基因家族分析数据

    2026年2月9日 30 14 0

    数据集概述 本数据集为番茄与大豆内切β-甘露聚糖酶基因家族的全基因组分析及表达谱研究数据。涵盖基因鉴定、序列保守性分析、基因结构、系统发育与进化分析、启动子及表达模式研究等内容,涉及番茄、大豆及拟南芥等物种的相关基因信息。 文件详解 文件名称:NJB-01580-R data.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含番茄与大豆内切β-...
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  • Phylogeny_序列数据_系统发育树构建与残基保守性分析

    2026年2月8日 30 200 154

    数据集概述 本数据集包含用于系统发育树构建与残基保守性分析的序列数据,旨在为分子进化研究提供基础序列信息,支持相关生物信息学分析工作。数据集仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:Sequences_for_Phylogeny.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:文件内容为用于系统发育树构建与残基保守性分析的序列数据,具体字段信息未提供详细预览。...
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  • GPCR_Based_头足类信号转导进化基因组特征分析数据

    2026年1月30日 30 102 88

    数据集概述 本数据集为头足类GPCR基因家族进化研究相关数据,包含正选择分析、表达分析计算及系统发育分析三类文件,支持探究头足类信号转导进化中GPCR扩张的功能转变,为理解头足类形态和神经创新的分子机制提供数据支撑。 文件详解 正选择分析文件 文件名称:PositiveSelectionAnalysis.zip 文件格式:ZIP...
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  • 软体动物_5S_rDNA基因家族_转录调控区与进化分析数据

    2026年1月30日 30 210 19

    数据集概述 本数据集为软体动物5S rDNA基因家族研究的补充数据,涵盖双壳类、腹足类和头足类等物种的5S rDNA序列分析结果,重点研究贻贝科物种的转录调控区保守性、二级结构预测及长期进化模式,识别出不同类型的非转录间隔区及假基因拷贝,支持软体动物5S rDNA基因家族的进化机制研究。 文件详解 文件名称:README_for_Sequence...
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  • Vertebrate_脊椎动物基因家族系统发育树数据集_2002

    2026年1月28日 30 14 7

    数据集概述 本数据集包含118个脊椎动物基因家族的系统发育树,用于James Cotton和Roderic Page在2002年发表的两篇论文。数据涵盖基因序列文件、系统发育树文件、分类重叠图及基因家族列表,支持基因进化关系与分类学分析。 文件详解 压缩包文件 文件名称:genes.zip 文件格式:ZIP...
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  • Tasdighian_S_2025_植物全基因组倍增检测补充数据集

    2026年1月27日 30 201 24

    数据集概述 本数据集是论文《Using reciprocally retained gene families to detect whole-genome multiplications in plants》的补充数据,包含研究中计算分析的输入与输出文件,涉及植物全基因组倍增检测相关的基因家族分析、统计模型等内容,共8个文件。 文件详解...
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  • Arabidopsis_E2_Family_cDNA序列与统计分析数据

    2026年1月26日 30 138 103

    数据集概述 本数据集包含拟南芥E2基因家族的cDNA序列及相关统计分析数据,涉及UBC18调控FREE1稳定性以响应铁缺乏胁迫的机制研究,明确了FREE1的关键泛素化位点及其对植物铁缺乏敏感性的影响,为植物抗逆分子机制研究提供支撑。 文件详解 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • PDE6_Genes_Based_脊椎动物磷酸二酯酶6基因进化与表达研究数据

    2026年1月20日 30 139 69

    数据集概述 本数据集围绕磷酸二酯酶6(PDE6)基因展开,包含其在脊椎动物中的进化分析、比较同线性分析及斑马鱼中的基因表达数据,涉及催化亚基与抑制亚基基因家族的扩张、新成员鉴定及昼夜表达振荡特征等内容,共21个相关文件。 文件详解 系统发育分析文件(.phb格式) 示例文件:PDE6_catalytic-...
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  • MSP7_Plasmodium_蛋白功能分化分子进化分析数据2016

    2026年1月25日 30 116 87

    数据集概述 本数据集围绕疟原虫裂殖子表面蛋白7(MSP7)基因家族展开,包含其分子进化与系统发育分析相关数据。通过对12种疟原虫基因组中MSP7家族的研究,揭示基因扩张收缩、选择压力变化及功能分化特征,为理解MSP7在寄生虫入侵中的作用提供支持。 文件详解 文件名称:Garzón-Ospina et al.,- 2016 - BMC...
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  • Anchored_Enrichment_鲤形目系统发育基因组学分析数据集

    2026年1月22日 30 30 27

    数据集概述 本数据集为鲤形目(包括鲤科、鳅科等约4300种淡水鱼类)的系统发育基因组学研究数据,基于锚定富集方法构建,包含172个鲤形目类群及3个外群的219个基因座(总长315,288 bp),旨在解决该类群系统发育关系的争议,为进化生物学研究提供框架。 文件详解 文件名称:LociPartitions.txt 文件格式:TXT...
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  • Hucho_taimen_Based_哲罗鲑转录组从头组装与特征分析数据

    2026年1月21日 30 150 119

    数据集概述 本数据集为哲罗鲑(Hucho taimen)的转录组从头组装与特征分析结果,包含转录组序列、功能注释、基因家族分析、正选择基因鉴定及微卫星标记等数据,共11个压缩文件,可用于研究该濒危物种的保护遗传学、系统发育及进化机制。 文件详解 文件名称:Index_and_primers_for_genotype.zip 文件格式:ZIP...
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  • Tuatara_Genome_Based_大蜥蜴视觉系统分子进化支持数据集

    2026年1月21日 30 176 8

    数据集概述 本数据集为《大蜥蜴基因组:来自古老爬行纲唯一现存物种的脊椎动物进化洞察》论文的补充数据,聚焦大蜥蜴视觉系统的分子进化研究。包含基因树、补充文件、PAML结果表和基因序列比对等四类文件,总计4个文件,用于支持相关进化分析。 文件详解 Schott Tuatara Vision Gene Trees.zip 文件格式:ZIP...
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  • Populus_Genome_wide_MATE转运蛋白铝抗性分子机制研究数据

    2026年1月19日 30 19 10

    数据集概述 本数据集围绕毛果杨(Populus trichocarpa)MATE转运蛋白家族展开全基因组分析,探究其在铝抗性中的分子机制。包含71个候选MATE基因的染色体分布、系统发育关系及表达分析结果,重点验证PtrMATE1和PtrMATE2在铝胁迫下的功能,为林木抗逆分子机制研究提供数据支持。 文件详解 文档文件...
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  • PhyloGenes_Based_基因家族系统发育与功能注释完整数据_1_2版本

    2026年1月19日 30 70 7

    数据集概述 本数据集为PhyloGenes平台1.2版本发布的基因家族数据压缩包,包含基因家族的系统发育树文件和基因成员信息文件,覆盖基因ID、分类学名称、序列登录号、功能注释等核心内容,支持生物信息学领域的基因家族分析与功能研究。 文件详解 PhyloXML_files文件夹 文件名称:以.xml命名(每个家族对应一个文件)...
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  • Lignocellulose_Based_东海潮间带木质纤维素降解细菌群落功能研究数据_2023

    2026年1月11日 30 202 192

    数据集概述 本数据集围绕东海东南潮间带木质纤维素降解细菌群落展开研究,通过原位富集实验结合16S rRNA扩增子和宏基因组测序,分析不同木质素/木质纤维素底物相关的细菌群落结构、多样性及降解功能基因,揭示海洋生态系统中木质纤维素降解的微生物机制,包含4份相关文件。 文件详解 数据表格文件(共3个) 文件名称:Table...
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  • Ceratodon_purpureus_De_novo_转录组组装与比较分析数据

    2026年1月15日 30 5 3

    数据集概述 本数据集包含紫萼藓(Ceratodon purpureus)雌雄分离株的转录组从头组装与比较分析数据,使用454 FLX技术生成。通过与小立碗藓(Physcomitrella patens)的比较分析,覆盖了原丝体转录组,为研究苔藓植物基因家族进化、生理发育分化及密码子使用偏好提供资源,共含12个文件。 文件详解 预测序列文件...
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  • Patinopecten_yessoensis_MCM基因低pH胁迫表达分析数据

    2026年1月15日 30 30 4

    数据集概述 本数据集聚焦虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)在低pH胁迫下的MCM基因调控作用,包含其外套膜组织在不同时间点的基因表达分析结果,共涉及2个文件,均为Excel格式,用于揭示低pH环境对虾夷扇贝MCM基因表达的影响。 文件详解 文件名称:Expression pattern of Py under low-pH...
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  • Transcriptome_dynamics_拟南芥气孔谱系细胞转录组动态研究数据

    2026年1月15日 30 205 157

    数据集概述 本数据集记录拟南芥叶片成年干细胞谱系发育过程中,气孔谱系细胞的转录组动态变化。通过RNA测序和微阵列平台,对荧光激活细胞分选分离的标记细胞进行基因表达定量,覆盖细胞诞生、扩增至自我更新群体终止的阶段,为植物发育基础过程研究提供资源。 文件详解 文件名称:mmc4.xlsx 文件格式:XLSX...
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