找到109个数据集

标签: 高通量测序

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  • HTS_Based_底栖硅藻DNA提取方法与测序数据_原始数据集

    2026年2月13日 30 3 0

    数据集概述 本数据集围绕底栖硅藻生物监测展开,通过高通量测序(HTS)技术分析不同DNA提取方法对结果的影响。样本采集自法国、瑞典及马约特的溪流与湖泊,采用五种方法提取DNA并进行rbcL基因扩增测序,包含原始测序数据及样本信息关联文件,为评估DNA提取方法的有效性提供支持。 文件详解 fastq_file_info.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • MLR_Based_同种异体反应性T细胞受体库测序数据

    2026年2月9日 30 1 0

    数据集概述 本数据集是关于同种异体反应性T细胞受体库的研究数据,通过混合淋巴细胞反应(MLR)和高通量测序技术,分析健康成年人基线及3个月后的同种异体反应性T细胞克隆特征,揭示其克隆组成的广度、稳定性及可重复性,为移植患者临床管理提供技术支持。 文件详解 文件名称:README_for_Defining the alloreactive T cell...
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  • 食蚁兽类哺乳动物肠道微生物组趋同性研究数据

    2026年2月1日 30 36 7

    数据集概述 本数据集为食蚁(蚂蚁和白蚁食性)哺乳动物肠道微生物组趋同研究的配套数据,包含15种胎盘类食蚁哺乳动物及其近缘物种的肠道微生物组信息。通过16S rRNA基因高通量测序分析,探索饮食和系统发育对肠道微生物组进化的驱动作用,验证极端食性下微生物组的趋同适应性。数据集含4个文件,支持微生物组组成及功能的关联分析。 文件详解 说明文档类...
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  • rRNA基因拷贝数校正_土壤线虫群落测序数据

    2026年2月1日 30 17 15

    数据集概述 本数据集来自25年田间实验,通过形态学鉴定和高通量扩增子测序两种方法,研究年度焚烧和氮富集对草地土壤线虫群落的长期影响。包含测序数据、样本计数、分析脚本及参考数据库,共8个文件,用于验证测序方法的准确性及线虫群落对生态管理措施的响应。 文件详解 代码文件...
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  • 留尼汪岛象鼻虫关联普里斯提翁虫的微生物组动态数据

    2026年2月1日 30 146 55

    数据集概述 本数据集聚焦留尼汪岛犀牛甲虫Oryctes borbonicus尸体分解过程中,Pristionchus属线虫及其微生物组的演替与动态变化。研究线虫 dauer 阶段转换规律,通过16S rRNA基因高通量测序分析甲虫尸体、肠道、线虫及土壤的细菌群落差异,为昆虫分解过程中线虫-细菌互作机制提供数据支持。 文件详解...
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  • SYS_BIOL_古DNA进化模式与过程研究数据

    2026年2月1日 30 76 74

    数据集概述 本数据集是古DNA研究领域的补充数据,围绕古DNA的进化模式与过程展开,利用高通量测序技术及适配超损伤模板的分子技术,整合系统基因组学、群体基因组学等多方法,通过时间序列样本直接解析进化的时间维度。数据集包含1个文件,为古基因组和宏基因组数据的分析补充表格。 文件详解 文件名称:Table S1...
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  • 元条形码分析_土壤原生动物寄生群落高通量测序数据

    2026年2月1日 30 96 34

    数据集概述 本数据集包含土壤原生生物寄生群落的高通量DNA metabarcoding研究数据,涉及自由生活原生生物与寄生原生生物的群落结构分析,通过模拟群落实验评估高通量测序方法的偏差,揭示土壤后生动物携带的潜在寄生原生生物类群,为土壤原生生物多样性研究提供数据支持。 文件详解 OTUtableall.fa 文件格式:FA...
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  • 整合形态学和分子学方法进行土壤线虫群落分析数据研究

    2026年1月31日 30 7 6

    数据集概述 本数据集支持土壤线虫群落对植物扩张响应的研究,对比形态学鉴定、qPCR和高通量测序(HTS)三种方法的有效性。数据来自斯洛文尼亚(两种植物均为本地种)和德国(Centaurea stoebe为扩张种)的土壤样本,包含原始数据、统计结果及评审支持文件,共3个Excel文件。 文件详解 文件名称:stats.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 湖泊微藻_显微镜与高通量测序_多样性评估对比研究数据

    2026年1月31日 30 205 72

    数据集概述 本数据集为论文“Do we similarly assess diversity with microscopy and High Throughput Sequencing? Case of microalgae in...
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  • Mdaini_2024_地中海土壤特性与微生物学数据

    2026年1月31日 30 156 70

    数据集概述 本数据集聚焦半干旱地中海气候下灌溉果园的表土(0-10厘米)与底土(30-50厘米),探究土壤理化特性与微生物群落的关联。通过高通量16S rRNA基因和ITS1区域扩增子测序,分析不同土层的细菌和真菌群落,同时记录表土因灌溉导致的高盐度现象。 文件详解 文件名称:Mdaini et al. 2024. Soil depth...
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  • 唐松草属植物转录组比较研究及CYP719A基因进化数据分析

    2026年1月30日 30 152 103

    数据集概述 本数据集包含两种鬼臼属(Dysosma)物种的比较转录组资源及鬼臼亚科(Podophylloideae)中CYP719A基因的分子进化数据。通过高通量测序获取高海拔物种D. aurantiocaulis的转录组,与低海拔物种D. versipellis进行比较分析,识别直系同源基因并研究其选择压力,同时开发EST-...
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  • Cuculus_canorus_普通杜鹃繁殖地食性研究数据

    2026年1月30日 30 128 53

    数据集概述 本数据集包含普通杜鹃(Cuculus canorus)繁殖地食性研究的相关数据,采用分子DNA测序和众包照片两种方法收集,覆盖2005-2016年英国区域数据,可用于分析杜鹃食性构成、猎物多样性及农业集约化对其猎物的影响。 文件详解 文件名称:Photo_Data.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 沃兰尼_恩斯_利斯_布赫纳补充材料3_昆虫样本PCR引物数据

    2026年1月29日 30 118 102

    数据集概述 本数据集为论文补充材料3,包含研究中用于昆虫 bulk 样本均质化与非破坏性裂解方法对比实验的第一、二轮PCR所用引物信息,是支撑昆虫生物多样性测序实验的关键技术参数数据。 文件详解 文件名称:oo_1203182.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 澳大利亚陆生脊椎动物数据的系统发生分析所需的_Dryad_资源

    2026年1月29日 30 14 5

    数据集概述 本数据集为澳大利亚陆生脊椎动物系统发育基因组分析提供转录组资源,包含鸟类、蛙类、蜥蜴和哺乳动物共二十二个物种的转录组序列,支持基于外显子的序列捕获研究,还提供选择系统发育信息外显子的方法示例,助力解决澳大利亚脊椎动物进化关系与隐存多样性问题。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • PGBD5_Based人类转座酶基因组重排正向遗传筛选实验数据

    2026年1月29日 30 9 8

    数据集概述 本数据集来自人类转座酶基因组重排的正向遗传筛选研究,通过HPRT1筛选结合高通量测序技术,分析人类转座酶PGBD5诱导的HPRT1突变谱及潜在基因组重排底物(PSS基序),为解析PGBD5等驯化转座酶的内源性基因组重塑活性提供支持,包含五份文件。 文件详解 Metadata_HPRT1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • mRNA_Seq_Based_基因测序数据质量修剪优化研究数据

    2026年1月28日 30 43 42

    数据集概述 本数据集围绕高通量mRNA测序数据的质量修剪优化展开,基于实证序列数据提供mRNA-Seq研究中修剪强度的通用建议,指出相较于激进修剪,对Phred评分<2或<5的核苷酸进行温和修剪更适合多数研究场景。 文件详解 文件名称:assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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  • 系统基因组学_福尔马林固定标本_百年蛇类标本的基因组学研究数据

    2026年1月28日 30 90 16

    数据集概述 本数据集围绕百年福尔马林固定/液浸蛇类标本的系统基因组学研究展开,包含通过改良DNA提取 protocol 结合高通量测序获得的遗传数据,以及标本信息、实验方案、系统发育分析结果等相关文件,可支持博物馆标本在现代系统发育研究中的应用验证。 文件详解 数据压缩包...
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  • 优化后的DNA提取方法_适用于植物多样性样本的NGS研究方案数据

    2026年1月28日 30 16 2

    数据集概述 本数据集围绕植物多物种地上(绿色部分)和地下(土壤)样本的DNA提取优化协议展开,旨在解决NGS分析中植物群落评估缺乏标准化DNA提取方法的问题。协议通过优化裂解后可溶性化合物沉淀和pH标准化步骤,提升DNA质量与产量,已通过36个草地样地ITS2区域 metabarcoding 文库构建验证,适用于基础实验室环境。 文件详解...
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  • PR2_Based_温带湖泊纤毛虫群落古重建生态变化研究补充数据

    2026年1月28日 30 159 81

    数据集概述 本数据集是温带湖泊纤毛虫群落古重建生态变化研究的补充数据,包含PR2数据库的 curated 版本相关文件,用于高通量测序(HTS)数据的分类学分配,支持湖泊生态系统长期变化的研究。 文件详解 pr2_database_curation_procedure.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:记录PR2数据库 curated...
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  • eLife_Dryad_Based_减数分裂动粒交叉重组研究数据

    2026年1月27日 30 199 48

    数据集概述 本数据集来自关于减数分裂过程中动粒功能的研究,核心内容为验证保守Ctf19/CCAN动粒亚复合体抑制着丝粒近端交叉重组的机制,涉及酿酒酵母减数分裂DNA断裂形成及黏连蛋白富集对交叉重组的调控,数据包含测序分析结果与说明文档。 文件详解 README_for_eLife_Dryad_Recombine_data.txt 文件格式:TXT...
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