Alpha_synuclein_ColabFold_Based_α_突触核蛋白结构建模完整数据

数据集概述

本数据集包含通过ColabFold工具对野生型人类α-突触核蛋白(alpha-synuclein)及其Ser129Asp突变体进行结构建模的结果,涵盖蛋白质结构模型文件、建模日志、参考文献、预测精度评估图表等多种类型文件,为研究该蛋白质野生型与突变体的结构差异提供数据支持。

文件详解

该数据集包含多种类型的文件,具体说明如下: - 蛋白质结构模型文件(.pdb格式,共10个): - 示例文件:humanasynucleinWT_ab597_unrelaxed_model_4.pdb、humanasynS129D_d87ec_unrelaxed_model_2.pdb等 - 内容:野生型及Ser129Asp突变体α-突触核蛋白的未松弛结构模型 - 序列比对文件(.a3m格式,共2个): - 示例文件:humanasynucleinWT_ab597.a3m、humanasynS129D_d87ec.a3m - 内容:建模使用的多序列比对数据 - 建模日志文件(.log格式,共2个): - 示例文件:humanasynucleinWT_ab597.log、humanasynS129D_d87ec.log - 内容:ColabFold建模过程的详细日志记录 - 参考文献文件(.bibtex格式,共2个): - 示例文件:humanasynucleinWT_ab597.bibtex、humanasynS129D_d87ec.bibtex - 内容:建模相关的参考文献引用信息 - 结构评估图表文件(.png格式,共4个): - 示例文件:humanasynucleinWT_ab597_PAE.png、humanasynS129D_d87ec_coverage_lDDT.png等 - 内容:预测对齐误差(PAE)、覆盖率与局部距离差异测试(lDDT)等结构质量评估图表

适用场景

  • 结构生物学研究:分析野生型与Ser129Asp突变体α-突触核蛋白的三维结构差异
  • 蛋白质突变功能研究:探究Ser129Asp突变对α-突触核蛋白结构稳定性的影响
  • 计算生物学建模验证:验证ColabFold工具对特定蛋白质突变体的结构预测效果
  • 神经退行性疾病机制研究:为帕金森病等与α-突触核蛋白相关疾病的机制分析提供结构数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.59 MiB
最后更新 2025年12月6日
创建于 2025年12月6日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。