AlphaFold3抗体与纳米抗体基准测试数据集_更新版

数据集概述

该数据集为AlphaFold3模型提供抗体与纳米抗体的基准测试数据，包含格式化的晶体结构及AF3、Boltz-1、Chai-1预测结构的PDB文件，同时涵盖数据集元数据（如PDB ID、重链、轻链及抗原序列）。

文件详解

• 文件名称：revised_Compiled_Benchmark_Data.zip
• 文件格式：ZIP压缩包（.zip）
• 内容说明：压缩包内包含以下类型文件及信息
• 晶体结构文件：格式化的晶体结构数据，以PDB格式存储
• 预测结构文件：AlphaFold3、Boltz-1、Chai-1模型预测的结构数据，以PDB格式存储
• 元数据：包含PDB ID、重链序列、轻链序列、抗原序列等数据集描述信息

适用场景

• 蛋白质结构预测模型评估：用于对比分析AlphaFold3与其他模型（Boltz-1、Chai-1）在抗体及纳米抗体结构预测任务中的性能
• 抗体结构研究：为抗体与纳米抗体的结构特征分析提供基准数据支持
• 计算生物学实验：作为计算生物学领域中蛋白质结构相关实验的标准测试数据集
• 生物信息学算法开发：为抗体结构预测相关算法的开发与优化提供验证数据