数据集概述
本数据集包含弓鳍鱼(Amia)物种多样性研究的分子与形态学数据,通过ddRAD测序和形态学分析揭示其隐存物种多样性。数据支持将现存弓鳍鱼划分为两个物种,涉及系统发育分析文件、形态测量数据及标本信息,共8个文件。
文件详解
- 说明文件
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,概述文件内容及研究背景。
- 形态学数据文件
- 文件名称:amia_crainial_morphology.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含specimen(标本)、Species(物种)、intopercle ML(间鳃盖骨长度)、skull length(头骨长度)等颅骨形态测量字段。
- 文件名称:amia_meristics.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Catalog(标本编号)、Drainage(流域)、Species(物种)、SL(标准体长)、LL(侧线鳞数)等可数性状及标本信息字段。
- 分子数据与系统发育文件
- 文件名称:Amia_ddRAD_specimens.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:ddRAD测序标本信息表。
- 文件名称:amiiformes_ddRADtip.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:ddRAD序列数据的系统发育分析输入文件。
- 文件名称:amiiformes_ddRADtipSUM.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:系统发育分析结果树文件。
- 文件名称:Amia_coalescent_min177.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:BEAST软件用于溯祖分析的输入文件。
- 文件名称:Amia_coalescent_min177sum.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:溯祖分析结果的树文件。
适用场景
- 生物多样性研究:分析弓鳍鱼隐存物种多样性及演化历史。
- 脊椎动物系统发育分析:利用ddRAD数据和树文件研究弓鳍鱼的系统发育关系。
- 形态学物种界定:通过颅骨形态和可数性状数据支持物种划分。
- 保护生物学研究:为弓鳍鱼的保护策略制定提供物种多样性依据。
- 分子生态学研究:探究弓鳍鱼物种分化的时间及驱动因素。